Viruses: 11945665
Help
Entry
11945665 CDS
T40000
Symbol
S, WiCoV-HKU20_gp02
Name
(RefSeq) Wigeon coronavirus HKU20; spike glycoprotein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
1159908
Wigeon coronavirus HKU20
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
CoV_S1
CoV_S1_C
CoV_S2_C
Use1
Syntaxin-6_N
BST2
Baculo_PEP_C
BLOC1_2
DUF948
DUF2959
DUF4131
Fib_alpha
DUF1043
KxDL
ATG17_like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11945665
NCBI-ProteinID:
YP_005352871
RS:
NC_016995
UniProt:
H9BR25
LinkDB
All DBs
Position
NC_016995:18817..22455
Genome browser
AA seq
1212 aa
AA seq
DB search
MYRFAILMLVISPTLAASIADKVLDVVTFPGASRLLYPQHYQQPQVRGWTDDIGVDGRIP
ATYPLTNTFYLSNTTTPVDGVYTSLQPLLIRCKFKYVNDTVNAGKILTMYFNLTNNTGRC
DGNSEKVGLVDAIRFQINVTTDILQLTAGSINFTTPDGELYTLHCLNTTLGVGQDYYPSQ
SRTRQSGVTYHCYMIYRNTSYAYSANEYTYRVLQYLGPLPASVREIVAFSNGFIYINGIL
LSRIPALHKVDFGLVKSAHTSDYYVILFADMVDVMVNISATEMQSIFYCITPFEQVKCSQ
KQTTLSDGFYSTSAIEVLQRQRTFVGLPMAINITTLNFAISYLNTKANPSLGAPQEVNLT
INGFADQFCVTTSQFMVTLNVTCLVHNNTSIIPCPQAYTAEISPGDCPFNFLDVNNYLMF
DSICFSPSPSGDSCQMVINKVWANNRIPMSSVYVSYVYGNQIVGVPRHDLVQLDHVVFNL
CTDYTIYGYTGTGVIRETNTTYFAGYAYASPAGQLVAYKNLTTGAINSITPCKFSQQLAV
YNDTPVALVSAVPSQDFGFTNATSMGTFVVNSNATNCTIPALTYGPLGICANGAPYVVPT
GEGQEPSVVPISTGNISIPVNFTVAIQPEYLQVYTEQVVVDCATYVCNGNPLCNKLLLQY
TSACDTIEQALQMSARLESSEVSNMLHISTQALDLANISNFEGYNMSFVLPAVKQGRSAL
EDLLFTKVVTAGLGTVDADYEKCAKGMDIADLVCVQYYNGIMVLPGVANAGKMAEYTASL
TGGMVMGGITSAASIPFSLAVQSRLNYVALQTGVMLDNQKLLADSFNKAMETISGAFNSL
NSAVHETINVVNTLSSALTKIQSVVNQHTTALNQLTQQLANNFQAISSSITDIYNRLGQL
EADAQVDRLITGRLAALNAFVSQTLTKAEQVRQSRLLAQQKVNECVKSQSQRFGFCGNGS
HIFTIANAAPDGIMFLHTVLQPVSYITVVAYSGLCVDNTYGYALKEPNLALVQYNGYYVT
PRNMYQPRPATTADFVQIQSCDVTLYNITYNNISLVIPDFVDTNKTIEDIISSIPNNTAP
SLEIASLNLTVLNLTSELEQLKASTGNFTQISQEIQDYINKLNDTLVDLEWLNRVETYVK
WPWWVWLLIFLAICTFIIIVVTIFLCTGCCGGCFGCFGGCCGLFSRVKHHEFSHLPVEEQ
DGSIPITYKKVN
NT seq
3639 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtacaggtttgctatactaatgttggtcatttcgccaaccctagctgcatccatagct
gataaagttttggatgtagtaacctttcccggagcatctcggttgttgtacccacaacac
taccaacaaccccaagtaagggggtggactgatgatattggtgttgatggtcgcatacct
gcaacctatccactaaccaacaccttctatctttcaaataccaccacaccagttgatggt
gtttatactagtcttcagcccttattaattcgttgtaagtttaaatacgtcaatgatact
gtcaatgctggtaaaattcttactatgtattttaacctcaccaataacacaggtagatgt
gacgggaattcggaaaaggttggtcttgtggatgccatcaggtttcaaattaatgtcaca
accgacatattacagctcactgcaggcagtattaactttactacaccggacggagagctg
tatacattacattgtcttaacacgacacttggtgtaggccaggattattacccatctcaa
agccgcacgcggcagtctggtgttacctatcattgttatatgatatatcgtaacacatcc
tacgcctacagcgctaatgaatacacttatcgtgtgcttcaatatttgggtcccttacca
gcatcagttagggaaattgttgcttttagtaatggattcatttacattaatggcattctt
ctttcgcgaatacccgcgttgcataaagttgattttggtcttgttaagagtgcccatacg
tcagattattatgttatcttgtttgctgatatggttgacgtaatggtcaacatatccgcc
actgaaatgcagtctatcttttactgcataaccccttttgagcaggttaaatgttcacag
aaacaaaccactctttctgatgggttctattccacatctgccattgaagtcctacagcgc
cagcgcacatttgtagggttaccgatggctattaacattactacgcttaattttgctatt
agttatttgaataccaaggctaatcctagtttaggtgcaccacaggaagtcaatcttacc
ataaatgggtttgcagatcaattctgtgttacaacctcccagtttatggttactcttaat
gtgacctgtctcgttcataataatactagtataataccctgtccacaggcttacacggca
gaaatctcaccgggggattgcccatttaattttttggatgttaataactatttaatgttt
gacagcatttgcttttcaccttctcccagtggtgacagctgtcagatggttattaataaa
gtctgggccaataatcgcatacctatgagtagcgtttatgtctcctatgtctatggcaac
cagatagtcggtgtacctcgacacgatctcgtgcagttggatcatgtcgtgtttaatttg
tgcacagactacaccatttatgggtataccggtactggtgttatacgtgaaactaacacc
acatactttgccggttatgcctatgcatcaccagctggtcaactcgttgcctataaaaat
cttactactggtgctattaattctataacaccatgtaagtttagtcaacaattagccgtg
tataatgatacacctgtagcccttgtgtcagcggtgccctcgcaggactttgggtttacc
aatgcaacctctatgggtacctttgttgtcaattcaaatgcaactaattgcaccattcca
gctcttacttatggcccacttggcatttgtgccaatggcgctccatatgtagtacctaca
ggtgaaggccaagaacctagtgttgtccccatttctacgggcaacatttcaatacctgtc
aattttactgtagccatacagcctgagtatctacaggtttatactgagcaggttgttgta
gactgtgccacttatgtttgcaacggtaacccattgtgtaacaagttgttgttacaatac
acttcagcttgcgacacaattgagcaggcgttgcaaatgagcgcccgtttagagtctagt
gaagtctctaacatgctacacatttcaacgcaggctctggatttggctaacatctcaaat
tttgagggttataatatgtcctttgttttgcctgctgttaaacagggtaggtctgcctta
gaagacttgctatttactaaagtagttacagctggactgggcacagtagatgctgactat
gagaaatgtgctaaaggcatggacatagcagaccttgtatgtgtccagtactataacggt
atcatggtgctccccggcgtagcaaatgctggcaaaatggctgagtacacagcatccctt
actggcggtatggttatgggtggtattacatcagcagcctctataccattttccttagcg
gtacaaagccgccttaattatgtagctctgcaaacaggtgttatgttagataatcagaag
cttctagcagattcctttaataaggctatggagacaatttctggtgcatttaattcactt
aattctgctgtgcatgaaactattaatgttgttaacactctatcatctgcacttactaag
atacagagtgttgtcaatcagcatactacagccttaaatcagctaactcagcagttggct
aataatttccaggctatatcttcgtctattacagacatttataacaggttgggtcaacta
gaggctgatgctcaggtagatcggcttattacaggtcggttggcagccctcaatgcattt
gtgtcccaaaccttaaccaaggcagagcaggtccgccaatctaggttgcttgctcagcag
aaagttaatgagtgtgtcaaatcgcagtctcagcggtttggtttctgtggcaatggttct
cacatctttactattgccaatgccgcgcctgatggcattatgtttttgcacacggtacta
caacctgtaagctacattactgttgtagcctattcagggctgtgtgtagacaacacttat
ggctacgctcttaaagagcctaacctagcacttgtgcagtataatggttattatgttact
ccgcgtaatatgtatcaaccacgtccagctactacagctgactttgtgcaaatacaatct
tgtgatgttaccctctataacattacttacaataatatatctttggtcataccagacttt
gtggataccaacaaaactattgaagatatcatttcttcaatacctaataatactgcgcct
agtttagaaatagccagtcttaatctgactgtactaaacctgacgtcagagctagaacaa
ttaaaagcctccactggcaattttactcaaatttctcaggaaatacaggattacataaat
aaactcaatgacactctagttgacttagagtggctcaacagagtagaaacttatgttaaa
tggccatggtgggtgtggcttcttatctttttagccatttgtacttttataataattgtc
gtaacaatcttcctatgcacaggttgctgtggtggatgttttggctgttttggtgggtgc
tgtggtttgtttagcagagttaaacaccatgagttttcgcacttacctgtagaagaacaa
gatggctcaataccaattacctataagaaagttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
