KEGG   Viruses: 26626797
Entry
26626797          CDS       T40000                                 
Symbol
AVU60_gp2
Name
(RefSeq) BtMr-AlphaCoV/SAX2011; spike glycoprotein
  KO
K19254  Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
1503289  BtMr-AlphaCoV/SAX2011
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 CoV_S1 CoV_S1_C CoV_S2_C TMEM251 DUF2959 Effector_1 Filament PIN_8 Phage_GPO DUF16
Other DBs
NCBI-GeneID: 26626797
NCBI-ProteinID: YP_009199609
RS: NC_028811
UniProt: A0A0U1WHD7
LinkDB
Position
NC_028811:20288..24451
AA seq 1387 aa
MWHVIVALVFIPFLSAANTGTCSNTINRFMYLKLGLPVPTNDAYVTGYLPIPSNWTCSDG
YWQYKNAHGLFVSYHSTALDFAIGVSSSTSYAEKWGLYFWQKNNEGRAVFRICKWDASAQ
TNFAPDRHTARDCFVNKQIPMVFKHQGNEIVGVSWSGSRVTLHTLDRVFSFIVEGAESWD
YATLRCANGYACAHQVVYNPVTVIVTTVAAGIQKYTLCDNCTGFPQHVFATMENGEIPPS
FNFANWFYLTNSSSPVSSRVVGLQPLLLTCLWPIPALLGTATDITFDRNGTSDVRCNGFA
SNETADAMRFSLNFTDSAVFAKEGVITLKTLSNTFKFSCSNSSTYQAPYVIPFGHIDQPY
YCFTTFYINETAGTTTTSFVGMLPPVVREFVITKTGNVYLNGYRIFTVDDVVSVNFNISS
TDHRDFWTVAFVKNTEVMLDIEDTYIKQLLYCNTPLNVVKCQQLKFVLDDGFYSYSSPVD
EVLPRTIVRLPRLMTHNFLNFTIFVSFYFDDDKQARPDGGFYECATCAPKYYKLAFVDDW
TSAVSSNVTSICVNYASFTTRLFTFYAGTTAGVHLGLETGTCPFSFDTLNNYLTFGSLCF
SLVANGGCTMNIVTQGPYGLPHTIAVLYVSYTEGDNIIGVPLSNIPPLGVSDMSQVYLDT
CTTYTIYGMTGRGVITRSNNTFITGLYYTSNAGNLLAYKNSTTGVVYNVYPCQLSSQVAV
ISDAIVGMASSTPNVSIDFNVTVVADNFYYLSNSAQPCDQPVLTYAGIGICSDGSITNST
ARRAAADPVSPVISGNISVPTNFTFSVQVEYIQLMLKPVTVDCSVYVCNGNPRCLQLLAQ
YASACRTIEQALQLSARLESVEVNSMISISQEALALGVIDNFKHDFNLTNVLPASVGAKS
AVEDLLFDKVVTSGLGTVDADYKECASRTANTVAEVGCVQYYNGIMVLPGVVDQSLLAQY
SAALTGAMVFGGVTAGAAVPFSIAVQSRLNYLALQTDVLQRNQQQLANSFNAAMGNITEA
FGRVNDAIEQTSHAISTVAQALDKVQTVVNDQGLALSQLTKQLASNFQAISSSIEDLYNR
LDRVEADLQVDRLITGRLAALNAFVAQQLTKYTDVRASRQLAQDKINECVKSQSFRYGFC
GNGTHVFSVVNAAPDGMMFFHSVLLPTAYMEVAAFSGLCVEGNGYVLRDTGNVLFEKNGQ
YLITARKMFEPRVPQTSDFVQITGCDVVYLNVTRDELPTVIPDYIDVNSTVEDILSKLPN
RTTPEFDLDIFNATYLNLTGEIADLTARSESLKNTTLELKELIANINATLVDLEWLNRVE
TYIKWPWWVWLIIVLVLILFTCLMLFCCCSTGCCGIFSCMASSCGACCDIRGTKLQRYEA
IEKVHVQ
NT seq 4164 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtggcacgtcattgtagccttggtttttattccatttttgagtgctgctaatactggt
acgtgttctaacactataaaccgttttatgtacttaaaattgggtttaccagttcctaca
aatgatgcttatgttactggttacttgccaataccgtcgaactggacttgcagtgacggt
tattggcagtacaaaaatgctcatggactgtttgtctcttatcatagtacagcgctagat
tttgccataggcgtgtcgtcgtcgacaagttacgccgagaaatggggcctttatttttgg
cagaaaaataatgaaggccgtgctgtatttagaatctgtaagtgggatgcaagtgcacaa
accaactttgctcccgatagacatacagctcgtgactgctttgttaataagcaaattccc
atggtttttaagcaccaaggcaatgaaatagtcggcgtttcatggtcaggttcacgcgtg
acattacacacgttagatcgtgtgtttagtttcattgtagaaggtgcagagagttgggat
tatgctactcttcgttgtgccaatggttatgcatgcgcacaccaagttgtgtacaatcct
gtgactgttattgttactacagtcgctgcaggtattcaaaagtacacgctttgtgataat
tgcactggtttcccgcagcatgtttttgctactatggagaatggtgaaataccacctagc
tttaattttgctaattggttttatctaacaaattcttcttcacctgtctctagtagagtg
gttggtctgcaaccacttttgttaacatgtttgtggcctataccagctttacttggcact
gctacagatataacctttgacagaaatggtaccagtgatgttagatgtaacggctttgcc
tctaacgagacggccgatgctatgagattttcacttaattttacggatagtgccgtattt
gctaaagagggtgttataacacttaaaacgttgtctaataccttcaaattctcttgtagc
aactcatcgacataccaggcaccatatgtcataccttttggtcacattgaccaaccatat
tattgctttaccacattttacatcaatgaaacagctggtactactaccacttcttttgtg
ggtatgctaccacctgttgtcagagagtttgtcattaccaagactggtaatgtgtactta
aatggctacagaattttcactgttgatgatgtggtgagcgtaaattttaacattagttct
acagaccatcgtgatttttggacagttgcctttgttaaaaacacagaggtgatgcttgac
attgaagacacttatataaagcagttgctttattgtaacacacctctcaatgttgtaaag
tgccagcaactaaaatttgtcttagacgatggtttttactcttatagttcaccagttgat
gaagttttgccacgcactattgtgcggttgcccagacttatgacacacaattttctcaat
tttacaatctttgtgtcattctattttgatgatgataaacaggccagacctgatggcggg
ttttatgagtgcgctacatgtgctcccaagtattacaaacttgcctttgtagacgattgg
acttcagctgttagctcaaatgttacaagcatttgcgttaactatgccagtttcactacc
aggttattcactttttatgcaggtaccactgcaggtgtacatctgggtttagagactggt
acttgcccattcagttttgacacacttaataactatttgacttttggttcactgtgtttt
tcattagtagccaatggtggctgtactatgaatatagtcacacaaggtccttatggtttg
ccgcataccattgcggttttgtatgtctcatatactgaaggcgacaacattattggagtc
cctctgtctaacataccacctcttggtgtttcagacatgagtcaggtttaccttgacaca
tgtactacgtacaccatttatggtatgacaggtcgtggtgttatcacccgtagtaacaac
acgtttattactggcctatattacacttcaaatgcaggcaatttgttggcatataaaaat
tcaactactggtgtagtttataatgtttacccatgtcaactttcttcacaggttgctgtt
ataagcgatgccattgtaggtatggcttcatctactcctaatgtgtctattgattttaat
gttactgtcgttgctgacaacttttactacctaagtaatagtgcacagccatgtgaccaa
ccagtgcttacttatgctggtataggtatatgtagtgatggtagcataaccaatagtacg
gctaggagagctgcagcagaccctgttagtcctgttatatctggtaatatttctgtacct
accaacttcactttttctgtgcaagttgagtatatacagttgatgcttaaacctgtaaca
gtcgactgcagtgtttacgtttgcaatggaaacccgcgttgtcttcagctactggcacaa
tatgctagtgcttgtagaactatagaacaagccttgcaacttagtgcaagacttgagtct
gttgaagtcaatagtatgatttccatttcgcaagaggcacttgcgctcggtgttatagac
aactttaagcatgactttaatctcactaatgtacttcctgccagtgtaggtgctaagtct
gcagtggaggatttgctttttgataaagtcgttacttcaggtttgggaactgttgatgca
gattataaagagtgtgcttctcgcacggctaataccgtagcggaagtaggttgcgtgcaa
tactataatggaattatggtactgcctggtgttgtagaccaatctttgctggctcagtat
tccgctgctcttacaggtgctatggtatttggcggtgtcacagcaggtgctgccgtacca
ttttccatagcagttcagtccagactgaattatttagctttgcaaactgatgttctacag
cgtaaccagcagcagcttgcgaactcctttaatgctgctatgggtaacattactgaagct
tttggtcgtgttaacgacgccatagagcaaacatcacatgccatttcaactgtggcacag
gcattagataaggtgcagaccgtggtcaatgatcaaggtttggctctctctcaacttaca
aagcagttggcttctaactttcaggctatttcatcttctatagaagatctttataaccgc
cttgacagagtcgaggctgacttgcaggttgacagacttatcacaggccgtttagctgcg
ctgaatgcttttgtggcccaacagttgactaagtacacggatgtcagagcttctaggcag
ttagcacaggataaaattaatgaatgcgttaaatctcagtcattccgttacggtttttgc
ggcaacggtacacatgtgttttccgttgttaatgccgctcctgatggaatgatgtttttc
cattcagttttactccctactgcttatatggaagtggcagcattttcagggctttgtgtt
gaaggtaatggctatgtcctcagagacacaggtaatgtactctttgagaagaatggtcag
tacctcattactgctaggaagatgtttgaaccacgtgttccacagacatctgactttgtg
caaattacaggctgtgatgttgtatatttgaatgtgactcgtgatgaactgcctactgtg
ataccagattatattgatgttaatagcactgtcgaggacatacttagtaaactccctaac
aggactacacctgagtttgacctcgacattttcaatgctacatacctcaacttgactggt
gagatagcagatttaacggctaggtccgagtcacttaagaatactactttagagttaaag
gagcttattgctaatattaatgctacacttgttgaccttgaatggcttaacagagttgaa
acgtatatcaagtggccttggtgggtttggctcatcattgtgctagttttgatacttttc
acctgtttgatgctgttctgttgttgttcaactggatgttgtggcatttttagctgtatg
gccagttcttgcggcgcctgctgtgatatacgtggaactaaacttcagcggtacgaagct
atagaaaaagtccacgtgcaatga

DBGET integrated database retrieval system