Viruses: 28721348
Help
Entry
28721348 CDS
T40000
Symbol
S, BHT41_gp02
Name
(RefSeq) Rousettus bat coronavirus; spike protein
KO
K24325
Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
1892416
Rousettus bat coronavirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
28721348
NCBI-ProteinID:
YP_009273005
RS:
NC_030886
UniProt:
A0A1B3Q5W5
LinkDB
All DBs
Position
NC_030886:21121..24993
Genome browser
AA seq
1290 aa
AA seq
DB search
MFRTLLLAALFNACWCARPTCIKPTETWGTPSFTGVEYVPHNTTYVSVPLNKLSCLLPDP
YMAHSGQTVRQKLYMGNTSNTLVYPVTPPMFNLTYGNVTPGVYNTSFLPVFDGLLVHTYM
NRFAHLDNPNRTCQEPFGVVFGTTFEQDRIAMVIIAPGEFGMWGQVNRPNTTFVHVVACS
NATICAYPMFNRWGPAGSIHAENSFVEHNSSCFLNDTFEIPMGTSRVNLAFRFQDGNLLL
YHTAWLPTENYTLSGDYPLRYARSVGVGSNLPFAQFFQSVARARDSACAFLHNNLYIAPV
QPKELLVKYNDQGMPVEIADCSADSTQELYCITGTFTPSVGVYQLSRYRAEAKKLVQVTQ
QEDSCAIPYTTILEPPSPAAWVRATISNCTFDFESLLRTLPTYNLKCYGISPARLSTMCY
AGVTLDIFKLNTTHLSNMLGSVPDAVSIYNYALPSNFYGCVHAYHLNSTTPYAVAVPPGA
YPIKPGGRQLFNSFVSQVLDSPTSQCTPANCMGVVVIGLTPASGSNLVCPKANDTQVIEG
QCVKYNFYGYAGTGVINQSDLAIPNNKLFVTSKSGAVLAVRAGDKVYSITPCVSVPISVG
YDPGHQRALVFNGLDCSARANAVSMPASEYWTAAASTTARGSEPVLDTPSGCVYNVNNCT
THTVSVCEMPIGNSLCLVSNFTCSDVATASLSPNLLSLVVYDPTDAGLKVLTPVYWVSIP
TNFTLAATTEYIQTTAPKVNVDCVKYLCGDSERCIDVLSQYGAFCEDVNKALADVSAIID
SSMVTMVSELTAGVMWSETPQANVGSYNFSGLMGCLGSNCQEKQYRSAISDLLYNKVKVA
DPGFMGAYQKCIDEQWGGSVRDLICTQTFNGISVLPPIVSPGMQALYTSLLVGAVASSGY
TFGITSVGVIPFATQLQFRLNGLGVTTNVLMENQKLIANAFNNALTGIQKGFDATNMALA
KMQSVINQHAQQLSTLVDQLGNSFGAISSSINEIFSRLDELEANAQVDRLINGRMVVLNT
YVTQLLIRASEVKAQAALASQKISECVKAQSQRNDFCGNGTHVLSIPQMAPNGVLFLHYS
YQPTAYNLVRTAAGLCFNDTGYAPLGGLFVLPNNTDRWLFTKMSFYDPVNISVSNTQVLA
ACGLNYSSVNYTVLEPAVDTSSFNFTEEFEKWYVNQSHIFNNTFNASAFNFSLVDVNEQL
AILTDVVNQLNQSYIDLKQLGTYEYTVKWPWYVWLGMIAGLVGLVLAVVLLLCMTNCCSC
ARGVCSCKSCAYEEHEDVYPAVRVHGKRTA
NT seq
3873 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcggacgttgctcttagcggcgttgtttaacgcctgctggtgtgcgcgtccgact
tgtattaagcctactgaaacatggggcacgccttcatttacgggtgtggagtatgtacca
cataacactacctatgtctcagtaccgcttaacaagctatcatgcttattaccagaccct
tatatggcacactcaggacagactgtgagacaaaagttatacatgggcaatacctccaat
acgcttgtatacccagtcacaccaccaatgttcaaccttacatatggcaatgtgacacct
ggtgtgtacaacacgtcttttctaccagtctttgacgggctccttgtgcatacctacatg
aatcggtttgcacacttggataaccctaataggacatgtcaagagccatttggcgttgtg
tttggcactacctttgagcaagaccgtattgctatggtcataattgctccaggtgagttt
ggtatgtggggtcaggttaaccggcctaacactacttttgttcatgtagtggcatgtagt
aatgctaccatttgtgcctaccctatgttcaataggtggggaccagctggtagcatacat
gccgaaaactcctttgttgagcacaactcctcgtgctttttgaatgacacttttgagatt
ccaatgggtacatctcgtgtcaatttagcttttaggtttcaagacggcaaccttttactg
taccatacagcttggctgccgactgaaaactatactttaagtggtgactaccccctacgt
tacgcacgtagtgttggtgtaggctccaatttaccgtttgctcaattctttcagtctgtc
gctcgtgcacgtgatagtgcatgcgctttcctacataataatttgtacatagcccctgta
cagcctaaagagctgcttgttaagtacaatgaccaaggcatgcctgtagaaattgcagac
tgctctgctgattctacacaagagctatattgtattactggcaccttcacaccaagtgtc
ggtgtttatcaattaagtcgctatcgcgctgaagccaaaaagcttgtgcaagttacacag
caagaagactcctgcgcgataccgtatactactattctagaaccaccctcaccggctgcg
tgggtgcgtgctaccatttctaattgtactttcgactttgaatcgctactgcggacattg
ccgacatacaatttgaagtgctatggcatctcacctgctcgacttagtactatgtgctat
gctggggtgacgctagatatttttaaactaaacaccacccacttgtccaacatgcttgga
tctgtgccggatgctgttagtatttacaattatgccttgcctagcaacttttatggttgc
gtgcatgcttatcatcttaatagtactactccatatgcagtggctgtaccacctggcgct
tacccaattaaaccaggtggcagacagttgtttaacagctttgtgtctcaagtcttagac
tcaccaacgtcacagtgcacccctgctaattgcatgggtgttgttgttatagggttaaca
ccagcttctggttctaacctcgtgtgtccaaaggctaacgatacacaagttatcgaaggt
cagtgtgtgaagtacaacttttatggctatgcaggcaccggtgttataaaccagagtgac
cttgccatacccaacaacaagttgtttgttactagcaaatcaggagctgtccttgccgta
cgtgcaggtgacaaagtttacagcatcacaccttgtgtgtcagtgcccatttcagttggt
tatgaccctggacatcagcgtgcgcttgtgttcaacggtctcgactgtagtgcgcgcgcg
aatgctgtaagcatgccagcttccgaatattggaccgcagccgctagcactactgctcgc
ggttctgagcctgtattagacacaccgtctggttgcgtctacaatgttaataactgcact
acacacacagttagtgtttgtgaaatgcctattggtaacagcctttgcctcgtcagcaac
tttacgtgttctgacgtggcaacagctagccttagtccaaatttgttaagcttggttgta
tacgaccccactgatgcgggacttaaagttctaacaccggtgtactgggtcagtataccc
accaactttacactagctgcaacaactgagtacattcaaaccactgcacccaaagtcaat
gttgactgtgttaagtacctatgtggcgactctgagcgctgcatagatgtgctgtcacaa
tatggggctttctgtgaagacgtcaacaaggctcttgccgacgtcagtgctattattgat
tcatctatggtgactatggtttcagagcttactgccggtgtgatgtggagtgaaacacct
caagctaatgtcggctcatataacttttccggtcttatgggctgtctaggttccaactgt
caggagaagcagtatcgttctgctatctcagacttgttgtataataaagttaaggtagca
gacccagggtttatgggtgcttaccagaaatgtattgatgagcagtggggtggcagtgtg
agagaccttatttgcactcagacatttaatggcatctcagtgttaccgcccattgtctct
cctggcatgcaagccttgtatacatctttattagtaggtgctgttgcttcatctggctac
acctttggcattacgtccgttggtgtcataccatttgccacacagctccaatttagactt
aatggccttggtgttaccaccaatgtgctcatggaaaaccaaaaactcattgccaacgca
ttcaacaatgccctcacaggcatacagaagggttttgacgctaccaacatggctttagcc
aaaatgcagagtgtcatcaaccagcatgcgcagcaattgagtactttagttgaccaattg
ggcaactcttttggtgctatctcctcatccatcaatgaaatctttagtcggctagatgaa
ttagaagccaatgcacaagtagatcgccttatcaatgggcgtatggttgtcttgaacacc
tacgtcactcagctgctcattagagcttctgaggttaaggcacaagctgcgttggctagt
caaaagataagtgagtgtgtcaaagcacaatcccagcgtaatgacttttgcggtaatggc
acacatgtgttgtccatacctcaaatggcaccaaatggtgtgttgttcttgcactactcc
tatcaacctacagcttacaatttagtgcgtactgccgctggcctttgttttaatgacact
ggctatgcacctctaggaggtttgtttgtgttgcctaacaacacagacaggtggctattc
actaaaatgagcttttacgatcccgtaaacatctcagtttctaatacgcaggtccttgcg
gcttgtggtcttaattattctagtgtcaactacaccgtccttgagccggcggttgacact
agctcctttaattttacagaagagtttgaaaagtggtacgtcaaccagagtcatattttt
aacaacacctttaacgccagcgcctttaacttttcccttgtggacgttaatgagcagctt
gcgattcttacagatgttgtcaaccagttaaaccagtcttacatagacctcaagcagttg
ggcacctatgagtacacggtcaaatggccgtggtacgtatggctgggtatgattgcagga
ctagtaggccttgtgctagcggtagttctgctgctttgtatgactaattgctgctcgtgt
gctcgcggtgtttgctcttgcaagtcgtgtgcttatgaggagcatgaggatgtgtatcct
gctgttcgtgtgcatggaaaacgaacggcatga
DBGET
integrated database retrieval system
