Viruses: 30853692
Help
Entry
30853692 CDS
T40000
Symbol
S, BWV08_gp2
Name
(RefSeq) Lucheng Rn rat coronavirus; spike glycoprotein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
1508224
Lucheng Rn rat coronavirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
CoV_S1_C
CoV_S2_C
Syntaxin_2
SesA
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
30853692
NCBI-ProteinID:
YP_009336484
RS:
NC_032730
UniProt:
A0A1L7HJ82
LinkDB
All DBs
Position
NC_032730:21412..24816
Genome browser
AA seq
1134 aa
AA seq
DB search
MYFFLLLLFVSADAAIQTCPAPGNVNLDISKLYYGTQASINATFQVVQVLPQVPWKCNSY
SNGPSNKFNGIGVFVDLASAQHSWHLFVYPSMPTNKTWILSWADTHTSFEHGSVISYVQI
CKYPSNVVTDITNGNGCHTNMAGPGATTCDVILSSPLECVLNRTYSQQYAGVSYITWYND
HIIASIQGEVFTFDIGEVLQWSNFSAFCGTGNKCGFSYATTLSEWLVRTDNDGTVIDYVI
CDTDFESQLKCKNMVFELTPAVYSGSAVELQSAIYYVSNELPDCDFSFADMFMDGTGNFE
GLRRHVFSNCWVNYTAWFACADDYSCIIFNAIFAEVRYKLSQPDGLVNPFIKCNGLDLYS
ITKGCSSGFVLRYQLYANGSFDVNSYTPDYMECFGYFALYNGYVIYNAKFVSKGLTVCVV
QPVEPELDVCKSYTIDGVTFQGILRNTTHQIDSFHNILYYGDMVSYVRIRGVVYAVESCN
RFYYSVFKTLSAIGYLYSGATCDSTDVTTFMTKARATTFVDSSLGCFIDVSVTDGNYTDC
LNPIGNGFCVDVNVTGQPVVGNIFIQTHDTDYARPILTAQQIELPIDHYVSVKEQFIQTS
TPKFDVDCERYICDVSSDCRELLVKYGGYCSKILADIKSSSIQLDYQILGLYKTLAVDFK
VPDIDFGDFNFSMYMSEANGRSFIEDLLFDKIVTTGPGFYQDYYDCKKMNLQDLTCKQYY
NGIMVIPPVMDDTLITFWSSAVAGSMTAGLFGGQAGMVSWTVALAGRLNALGVMQDALVE
DVNKLANGFNNLTQYVSDGFKTTSQALSTIQAVVNNNAQQVSQLVQGLSENFGAISNNFA
LIAERLERIEAAMQMDRLINGRMNILQNFVTNYKLSISELKSQQALAQSLINECVYAQSS
RNGFCGDGLHLFSLMQRAPDGIMFFHYTLKPNNTIIVETTPGLCLSNDVCIAPKDGLFVR
LSTARDTDWHFTTRNRYSPEPITVNNTLTISGGVNFTVVNSTIDGIEPPANPSFDEEFAE
LYKNVTLELEQLKNISFDPEMLNLTYYIDRLDELATNVSQLHVDVSEFNKFVQYIKWPWY
VWLAIFLVLVLFSFLMLWCCCATGCCGCCGLCGAACNGCCTKPQPIEFEKVHVQ
NT seq
3405 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatttctttttgctcctgttgtttgttagtgctgatgctgccattcaaacctgtcct
gccccaggtaatgttaacttggatatctccaagttatattatggaacgcaagcatctatt
aatgccacgtttcaagttgttcaagttctgccccaagtaccgtggaagtgcaatagttat
tctaatggtccttctaataagtttaacggtataggtgtttttgtagacctagcctccgcc
cagcattcatggcacctttttgtttatccatctatgcctacaaataaaacttggattttg
tcatgggctgatactcataccagttttgaacatggtagtgttatatcttatgtccagatt
tgtaagtatccatctaatgttgtgactgacattactaatggtaatggctgtcacactaat
atggcagggcctggtgccacaacttgtgatgtcattcttagctcaccacttgagtgtgtt
cttaatagaacttactcacaacagtatgctggtgtctcctatattacttggtataatgat
cacattatagcatctatccagggtgaggtcttcacctttgatattggtgaagtgctgcaa
tggtctaattttagtgccttttgtggtaccggtaataagtgtggttttagttatgcgacc
acactctctgaatggttggttaggactgataatgatggcacggttattgattatgttatt
tgtgatactgactttgaaagtcagcttaagtgcaagaatatggtttttgaacttacacct
gctgtttattcgggctctgctgttgagttacaatccgctatttattatgtttcaaatgag
ttacccgattgtgacttttcatttgctgacatgtttatggacggcaccggaaattttgaa
ggtctccgtagacatgttttcagcaactgttgggtcaactacacagcatggtttgcatgc
gcggatgattattcctgcattatttttaatgctatttttgctgaggtgcgttataaacta
tcgcagcctgatggtctagttaatcctttcattaaatgtaatggattggacctctattct
atcactaaaggctgctctagtggctttgttttacgttatcagctttatgctaatggcagt
ttcgatgttaattcttatacacctgattatatggaatgttttggttattttgcgctatat
aatggttatgttatttacaacgccaagttcgttagcaagggcttgactgtttgtgttgta
cagcctgtcgaaccagaacttgacgtttgtaagtcttatactatagacggcgtgacattc
cagggcattcttagaaatacaacacatcagattgatagttttcataatattttatattat
ggcgacatggtcagctatgtgcgtattaggggtgttgtttacgctgtagagtcctgcaat
aggttttattatagtgtttttaagaccctttctgctattggttatctgtattcaggcgcc
acgtgtgactccactgatgtaactacttttatgactaaggctagagctacaacatttgta
gatagttcacttggttgttttatagacgtcagtgtcacagatggtaattatactgattgc
ttaaaccctatcggaaatgggttctgtgttgatgttaatgttactggtcaaccagttgtt
ggtaacatatttatacagactcatgacactgactatgctaggccaattcttactgcccag
caaatagaactgcctattgaccattatgttagtgtcaaagagcagtttattcaaactagt
acacccaagtttgatgttgattgtgaaaggtatatctgcgatgtttccagcgattgccgc
gaattgcttgttaagtatggtggctattgttccaaaatacttgcagatattaaatcttcc
agcattcagctggattatcagattttggggctttacaaaactttagctgttgattttaag
gttcctgatattgattttggtgactttaattttagtatgtatatgtctgaggccaatggt
agatcttttattgaggatctactttttgataagatagttactacgggtccagggttttat
caagattattatgattgtaagaagatgaatttgcaagatcttacttgcaagcagtattat
aatggtattatggttataccacctgttatggatgataccttgatcacgttttggtcatca
gccgttgctggttccatgactgcaggcctctttggtggtcaggcaggtatggtttcctgg
actgtagcacttgctggcagactcaatgcgcttggcgttatgcaggatgcacttgttgag
gacgttaataaacttgctaatggttttaacaacctcacacagtatgtgtcagatggcttt
aaaaccaccagtcaagctctctcaaccattcaggctgttgttaataataatgcacagcaa
gtttcccagctagtccaagggttaagcgagaacttcggtgctattagtaacaattttgct
cttattgctgagcgccttgaaaggatagaagccgctatgcagatggaccgtcttattaat
ggccgtatgaatatattacagaattttgtcaccaattataagctttccatatctgagctt
aaatctcagcaagctcttgcccagagtcttattaatgaatgcgtttatgcacagagcagt
aggaatggcttttgtggtgatggtttgcacttattctcactgatgcagcgtgcaccggac
ggaataatgttcttccattacacacttaaaccaaataacaccatcatagtcgaaaccaca
ccaggactctgtttgagtaatgatgtttgtatagctcctaaagatggtttatttgttaga
ctttctactgccagagacactgattggcattttacgactcgcaaccgctatagtccagaa
ccaataacggttaacaacactctcactattagtggcggtgttaattttactgttgttaat
tctactatagatggtatagagccgccagccaacccatcttttgatgaggagtttgctgag
ttatataagaatgttacattagagctcgaacagcttaaaaatattagttttgaccccgag
atgcttaatctgacctattatattgataggctagatgagctagcaacaaatgtgtcgcag
ctccacgtagatgtttcagagtttaataaatttgttcagtatattaaatggccttggtat
gtttggctagcaatattccttgtgcttgtactgttcagcttccttatgctctggtgttgt
tgcgccacaggttgttgcggatgttgtggtctttgcggtgccgcttgtaatggatgttgt
actaaacctcaacctattgaatttgaaaaggtccacgtacaatga
DBGET
integrated database retrieval system