KEGG   Viruses: 3283262
Entry
3283262           CDS       T40000                                 
Symbol
S, MHV-JHMgp05
Name
(RefSeq) Murine hepatitis virus strain JHM; spike glycoprotein
  KO
K24325  Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
11144  Murine hepatitis virus strain JHM
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 bCoV_S1_N bCoV_S1_RBD CoV_S1_C CoV_S2_C DUF2959 HSBP1
Other DBs
NCBI-GeneID: 3283262
NCBI-ProteinID: YP_209233
RS: AC_000192
LinkDB
Position
AC_000192:23940..28070
AA seq 1376 aa
MLFVFILLLPSCLGYIGDFRCIQTVNYNGNNASAPSISTEAVDVSKGLGTYYVLDRVYLN
ATLLLTGYYPVDGSNYRNLALTGTNTLSLTWFKPPFLSEFNDGIFAKVQNLKTNTPTGAT
SYFPTIVIGSLFGNTSYTVVLEPYNNIIMASVCTYTICQLPYTPCKPNTNGNRVIGFWHT
DVKPPICLLKRNFTFNVNAPWLYFHFYQQGGTFYAYYADKPSATTFLFSVYIGDILTQYF
VLPFICTPTAGSTLLPLYWVTPLLKRQYLFNFNEKGVITSAVDCASSYISEIKCKTQSLL
PSTGVYDLSGYTVQPVGVVYRRVPNLPDCKIEEWLTAKSVPSPLNWERRTFQNCNFNLSS
LLRYVQAESLSCNNIDASKVYGMCFGSVSVDKFAIPRSRQIDLQIGNSGFLQTANYKIDT
AATSCQLYYSLPKNNVTINNYNPSSWNRRYGFNDAGVFGKSKHDVAYAQQCFTVRPSYCP
CAQPDIVSACTSQTKPMSAYCPTGTIHRECSLWNGPHLRSARVGSGTYTCECTCKPNPFD
TYDLRCGQIKTIVNVGDHCEGLGVLEDKCGNSDPHKGCSCANDSFIGWSHDTCLVNDRCQ
IFANILLNGINSGTTCSTDLQLPNTEVATGVCVRYDLYGITGQGVFKEVKADYYNSWQAL
LYDVNGNLNGFRDLTTNKTYTIRSCYSGRVSAAYHKEAPEPALLYRNINCSYVFTNNISR
EENPLNYFDSYLGCVVNADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKSRRARRSVSTGYRLTTF
EPYMPMLVNDSVQSVGGLYEMQIPTNFTIGHHEEFIQIRAPKVTIDCAAFVCGDNAACRQ
QLVEYGSFCDNVNAILNEVNNLLDNMQLQVASALMQGVTISSRLPDGISGPIDDINFSPL
LGCIGSTCAEDGNGPSAIRGRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGQEVRDLLCVQS
FNGIKVLPPVLSESQISGYTAGATAAAMFPPWTAAAGVPFSLNVQYRINGLGVTMNVLSE
NQKMIASAFNNALGAIQEGFDATNSALGKIQSVVNANAEALNNLLNQLSNRFGAISASLQ
EILTRLDAVEAKAQIDRLINGRLTALNAYISKQLSDSTLIKFSAAQAIEKVNECVKSQTT
RINFCGNGNHILSLVQNAPYGLCFIHFSYVPTSFKTANVSPGLCISGDRGLAPKAGYFVQ
DNGEWKFTGSNYYYPEPITDKNSVVMISCAVNYTKAPEVFLNNSIPNLPDFKEELDKWFK
NQTSIAPDLSLDFEKLNVTFLDLTYEMNRIQDAIKKLNESYINLKEVGTYEMYVKWPWYV
WLLIGLAGVAVCVLLFFICCCTGCGSCCFRKCGSCCDEYGGHQDSIVIHNISAHED
NT seq 4131 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgctgttcgtctttattttactattaccctcttgtttagggtatattggtgattttaga
tgtatccagaccgtgaattataacggcaataatgcttctgcgcctagcattagcaccgaa
gcagtcgatgtttccaaaggtctgggcacttactatgttttagatcgtgtttacttaaat
gccacgttattgcttactggttattatcctgtggacggttccaattatcggaatctcgcg
cttacaggcactaataccttaagccttacgtggtttaaaccaccctttctaagtgagttt
aatgatggtatatttgctaaggtccagaacctcaagacaaatacgccaacaggtgcaacc
tcatattttcccactatagttataggtagtttgtttggtaacacttcctataccgtagtt
ttagagccatataataatattataatggcttctgtttgtacatataccatttgtcaatta
ccttacacaccctgtaagcctaataccaatggtaatcgtgttattggattttggcacaca
gatgtcaaaccgccgatttgtcttttaaagcgtaattttacgtttaatgttaatgcccct
tggctttatttccatttttatcagcagggtggtactttttatgcgtactatgcggataaa
ccttccgctactacgtttttgtttagtgtgtatattggcgacattttaacacagtatttt
gtgttaccttttatttgtactccaacagctggtagcactttactgccgctctattgggtt
acacctttacttaagcgccaatatttgtttaattttaatgaaaagggtgtcattactagt
gctgttgattgcgccagcagctacattagtgaaataaaatgtaagacccaaagtctctta
ccgagtactggtgtctatgatctatccggttacacggtccaacctgttggagttgtgtac
cggcgtgttcctaacctacctgattgtaaaatagaggaatggctcactgctaaatctgtg
ccgtcacctctcaattgggagcgtaggactttccaaaattgtaattttaatttaagcagc
ctgctacgttatgtccaggctgagtctttgtcgtgtaataatattgatgcgtccaaagtg
tatggtatgtgctttggtagtgtctcagttgataagtttgctatcccccgaagccgtcaa
attgatttacaaattggcaactccggatttttgcaaacggctaattataagattgatacc
gctgccacatcatgtcagctgtattacagtcttcctaagaataatgttaccataaataac
tataacccctcgtcttggaataggaggtatggttttaatgatgctggtgtgtttggcaaa
agtaaacatgatgttgcctacgcccagcaatgttttactgtgcgacctagctattgtccg
tgtgcacaaccggacatagttagcgcttgcactagtcagaccaaacccatgtctgcttat
tgccccacaggcacaattcatcgtgagtgttctctttggaatgggccccatttgcgctcg
gcacgtgtaggttccggcacgtacacgtgtgagtgcacttgtaaacccaatccatttgat
acgtatgatctccgctgtgggcaaattaaaactattgttaatgtgggcgatcattgtgaa
ggtctgggtgttttagaagataaatgtggcaatagcgatccacataagggctgttcttgt
gccaatgattcttttatcggatggtcacatgacacttgtttagtaaatgatcgctgccaa
atttttgctaacatattgttaaatggcattaatagtgggactacgtgttccacagattta
caattgcctaatactgaagtggccactggcgtttgcgtcagatatgacctctatggtatt
actggtcaaggtgtttttaaagaggtcaaggctgactattataatagctggcaggcccta
ttatatgatgttaatggtaacttaaacgggttccgtgaccttaccactaacaagacttat
acgataaggagctgttatagtggccgtgtttctgctgcatatcataaagaagcacccgaa
ccggctctgctctatcgtaatataaattgtagttatgtttttactaataatatttcccgt
gaggaaaacccccttaactattttgatagttatttgggttgtgttgttaatgctgataac
cgcacggatgaggcgcttcctaattgcgatctccgtatgggtgctggactatgcgtagat
tattcaaagtcacgcagagcccgccgatcagtttctactggctatcgattaaccacattc
gagccatacatgccgatgttagtcaatgatagcgttcaatccgtaggtggattatatgag
atgcaaataccaaccaattttactattggtcatcatgaggaattcatccagataagggct
cccaaggtgactatagattgtgctgcatttgtttgtggtgataacgctgcatgcagacag
cagttggttgagtatggctctttttgtgataatgttaatgccattcttaatgaggttaat
aacctcttggataatatgcaattacaagttgctagtgcattaatgcagggtgttactata
agttcgaggctgccagatggcatctccggccctatagatgacattaatttcagtcctcta
cttggatgcataggttcaacatgtgctgaagacggcaatggacctagtgcgatacggggg
cgttcagctatagaggatttattatttgacaaggtcaaactatctgacgttggctttgtc
gaggcttataacaattgcactggtggtcaagaagttcgcgacctcctttgcgtacagtct
tttaatggcatcaaagtattacctcccgtgttgtctgagagtcaaatctctggctacaca
gcgggtgctactgcggcagctatgttcccaccttggactgcagctgctggtgtgccattc
agtttaaatgttcaatataggattaatggtttaggtgtcactatgaatgttcttagtgag
aaccaaaagatgattgctagtgcttttaacaacgcgctcggtgctattcaggaagggttc
gatgcaaccaattctgctctaggtaagatccagtccgttgttaatgcaaacgctgaagca
cttaataatttattaaaccaactttctaataggtttggtgctattagtgcttctttacaa
gaaattctaacgcggcttgacgctgtagaagcaaaggcccagatagatcgtcttattaat
ggcaggttaactgcacttaatgcgtatatatccaagcaactcagtgatagtacgcttatt
aaatttagtgctgctcaggccatcgaaaaggtcaatgagtgcgttaagagccaaactacg
cgcattaatttctgtggcaatggtaatcacatattatcacttgtccagaatgcgccttat
ggcttatgttttattcatttcagctacgtgccaacatcctttaaaacggcaaatgtgagt
cctggactatgcatttctggtgatagaggattggcacctaaagctggatattttgttcaa
gataatggagagtggaagttcacaggcagtaattattactaccctgaacccattacagat
aaaaatagtgttgtcatgatcagttgcgctgtgaattacacaaaagcgcctgaagttttc
ttgaacaactcaataccaaatctacccgactttaaggaggagttagataaatggtttaag
aatcagacgtctattgcgcctgatttatccctcgatttcgagaagttaaatgttactttc
ctggacctgacttatgagatgaacaggattcaggatgcaattaagaagttaaatgagagc
tacatcaacctcaaggaagttggcacatatgaaatgtatgtgaaatggccttggtatgtt
tggttgctaattggtttagctggtgtagccgtttgtgtgttattattctttatatgttgc
tgcacaggttgcggctcatgttgttttagaaaatgcggaagttgttgtgatgagtatgga
ggacaccaggacagtattgtgatacataatatttcagcccatgaggattga

DBGET integrated database retrieval system