Viruses: 37616432
Help
Entry
37616432 CDS
T40000
Symbol
S, D1P20_gp02
Name
(RefSeq) Betacoronavirus England 1; spike protein
KO
K24324
MERS coronavirus spike glycoprotein
Virus
1263720
Betacoronavirus England 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S2_C
CoV_S1_C
Phasin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
37616432
NCBI-ProteinID:
YP_007188579
RS:
NC_038294
LinkDB
All DBs
Position
NC_038294:21455..25516
Genome browser
AA seq
1353 aa
AA seq
DB search
MIHSVFLLMFLLTPTESYVDVGPDSVKSACIEVDIQQTFFDKTWPRPIDVSKADGIIYPQ
GRTYSNITITYQGLFPYQGDHGDMYVYSAGHATGTTPQKLFVANYSQDVKQFANGFVVRI
GAAANSTGTVIISPSTSATIRKIYPAFMLGSSVGNFSDGKMGRFFNHTLVLLPDGCGTLL
RAFYCILEPRSGNHCPAGNSYTSFATYHTPATDCSDGNYNRNASLNSFKEYFNLRNCTFM
YTYNITEDEILEWFGITQTAQGVHLFSSRYVDLYGGNMFQFATLPVYDTIKYYSIIPHSI
RSIQSDRKAWAAFYVYKLQPLTFLLDFSVDGYIRRAIDCGFNDLSQLHCSYESFDVESGV
YSVSSFEAKPSGSVVEQAEGVECDFSPLLSGTPPQVYNFKRLVFTNCNYNLTKLLSLFSV
NDFTCSQISPAAIASNCYSSLILDYFSYPLSMKSDLSVSSAGPISQFNYKQSFSNPTCLI
LATVPHNLTTITKPLKYSYINKCSRFLSDDRTEVPQLVNANQYSPCVSIVPSTVWEDGDY
YRKQLSPLEGGGWLVASGSTVAMTEQLQMGFGITVQYGTDTNSVCPKLEFANDTKIASQL
GNCVEYSLYGVSGRGVFQNCTAVGVRQQRFVYDAYQNLVGYYSDDGNYYCLRACVSVPVS
VIYDKETKTHATLFGSVACEHISSTMSQYSRSTRSMLKRRDSTYGPLQTPVGCVLGLVNS
SLFVEDCKLPLGQSLCALPDTPSTLTPRSVRSVPGEMRLASIAFNHPIQVDQLNSSYFKL
SIPTNFSFGVTQEYIQTTIQKVTVDCKQYVCNGFQKCEQLLREYGQFCSKINQALHGANL
RQDDSVRNLFASVKSSQSSPIIPGFGGDFNLTLLEPVSISTGSRSARSAIEDLLFDKVTI
ADPGYMQGYDDCMQQGPASARDLICAQYVAGYKVLPPLMDVNMEAAYTSSLLGSIAGVGW
TAGLSSFAAIPFAQSIFYRLNGVGITQQVLSENQKLIANKFNQALGAMQTGFTTTNEAFH
KVQDAVNNNAQALSKLASELSNTFGAISASIGDIIQRLDVLEQDAQIDRLINGRLTTLNA
FVAQQLVRSESAALSAQLAKDKVNECVKAQSKRSGFCGQGTHIVSFVVNAPNGLYFMHVG
YYPSNHIEVVSAYGLCDAANPTNCIAPVNGYFIKTNNTRIVDEWSYTGSSFYAPEPITSL
NTKYVAPQVTYQNISTNLPPPLLGNSTGIDFQDELDEFFKNVSTSIPNFGSLTQINTTLL
DLTYEMLSLQQVVKALNESYIDLKELGNYTYYNKWPWYIWLGFIAGLVALALCVFFILCC
TGCGTNCMGKLKCNRCCDRYEEYDLEPHKVHVH
NT seq
4062 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacactcagtgtttctactgatgttcttgttaacacctacagaaagttacgttgat
gtagggccagattctgttaagtctgcttgtattgaggttgatatacaacagactttcttt
gataaaacttggcctaggccaattgatgtttctaaggctgacggtattatataccctcaa
ggccgtacatattctaacataactatcacttatcaaggtctttttccctatcagggagac
catggtgatatgtatgtttactctgcaggacatgctacaggcacaactccacaaaagttg
tttgtagctaactattctcaggacgtcaaacagtttgctaatgggtttgtcgtccgtata
ggagcagctgccaattccactggcactgttattattagcccatctaccagcgctactata
cgaaaaatttaccctgcttttatgctgggttcttcagttggtaatttctcagatggtaaa
atgggccgcttcttcaatcatactctagttcttttgcccgatggatgtggcactttactt
agagctttttattgtattctagagcctcgctctggaaatcattgtcctgctggcaattcc
tatacttcttttgccacttatcacactcctgcaacagattgttctgatggcaattacaat
cgtaatgccagtctgaactcttttaaggagtattttaatttacgtaactgcacctttatg
tacacttataacattaccgaagatgagattttagagtggtttggcattacacaaactgct
caaggtgttcacctcttctcatctcggtatgttgatttgtacggcggcaatatgtttcaa
tttgccaccttgcctgtttatgatactattaagtattattctatcattcctcacagtatt
cgttctatccaaagtgatagaaaagcttgggctgccttctacgtatataaacttcaaccg
ttaactttcctgttggatttttctgttgatggttatatacgcagagctatagactgtggt
tttaatgatttgtcacaactccactgctcatatgaatccttcgatgttgaatctggagtt
tattcagtttcgtctttcgaagcaaaaccttctggctcagttgtggaacaggctgaaggt
gttgaatgtgatttttcacctcttctgtctggcacacctcctcaggtttataatttcaag
cgtttggtttttaccaattgcaattataatcttaccaaattgctttcacttttttctgtg
aatgattttacttgtagtcaaatatctccagcagcaattgctagtaactgttattcttca
ctgattttggattatttttcatacccacttagtatgaaatccgatctcagtgttagttct
gctggtccaatatcccagtttaattataaacagtccttttctaatcccacatgtttgatt
ttagcgactgttcctcataaccttactactattactaagcctcttaagtacagctatatt
aacaagtgctctcgttttctttctgatgatcgtactgaagtacctcagttagtgaacgct
aatcaatactcaccctgtgtatccattgtcccatccactgtgtgggaagacggtgattat
tataggaaacaactatctccacttgaaggtggtggctggcttgttgctagtggctcaact
gttgccatgactgagcaattacagatgggctttggtattacagttcaatatggtacagac
accaatagtgtttgccccaagcttgaatttgctaatgacacaaaaattgcctctcaatta
ggcaattgcgtggaatattccctctatggtgtttcgggccgtggtgtttttcagaattgc
acagctgtaggtgttcgacagcagcgctttgtttatgatgcgtaccagaatttagttggc
tattattctgatgatggcaactactactgtttgcgtgcttgtgttagtgttcctgtttct
gtcatctatgataaagaaactaaaacccacgctactctatttggtagtgttgcatgtgaa
cacatttcctctaccatgtctcaatactcccgttctacgcgatcaatgcttaaacggcga
gattctacatatggcccccttcagacacctgttggttgtgtcctaggacttgttaattcc
tctttgttcgtagaggactgcaagttgcctcttggtcaatctctctgtgctcttcctgac
acacctagtactctcacacctcgcagtgtgcgctctgttccaggtgaaatgcgcttggca
tccattgcttttaatcatcctattcaggttgatcaacttaatagtagttattttaaatta
agtatacccactaatttttcctttggtgtgactcaggagtacattcagacaaccattcag
aaagttactgttgattgtaaacagtacgtttgcaatggtttccagaagtgtgagcaatta
ctgcgcgagtatggccagttttgttccaaaataaaccaggctctccatggtgccaattta
cgccaggatgattctgtacgtaatttgtttgcgagcgtgaaaagctctcaatcatctcct
atcataccaggttttggaggtgactttaatttgacacttctagaacctgtttctatatct
actggcagtcgtagtgcacgtagtgctattgaggatttgctatttgacaaagtcactata
gctgatcctggttatatgcaaggttacgatgattgcatgcagcaaggtccagcatcagct
cgtgatcttatttgtgctcaatatgtggctggttacaaagtattacctcctcttatggat
gttaatatggaagccgcgtatacctcatctttgcttggcagcatagcaggtgttggctgg
actgctggcttatcctcctttgctgctattccatttgcacagagtatcttttataggtta
aacggtgttggcattactcaacaggttctttcagagaaccaaaagcttattgccaataag
tttaatcaggctctgggagctatgcaaacaggcttcactacaactaatgaagcttttcac
aaggttcaggatgctgtgaacaacaatgcacaggctctatccaaattagctagcgagcta
tctaatacttttggtgctatttccgcctctattggagacatcatacaacgtcttgatgtt
ctcgaacaggacgcccaaatagacagacttattaatggccgtttgacaacactaaatgct
tttgttgcacagcagcttgttcgttccgaatcagctgctctttcggctcaattggctaaa
gataaagtcaatgagtgtgtcaaggcacaatccaagcgttctggattttgcggtcaaggc
acacatatagtgtcctttgttgtaaatgcccctaatggcctttacttcatgcatgttggt
tattaccctagcaaccacattgaggttgtttctgcttatggtctttgcgatgcagctaac
cctactaattgtatagcccctgttaatggctactttattaaaactaataacactaggatt
gttgatgagtggtcatatactggctcgtccttctatgcacctgagcccatcacctctctt
aatactaagtatgttgcaccacaggtgacataccaaaacatttctactaacctccctcct
cctcttctcggcaattccaccgggattgacttccaagatgagttggatgagtttttcaaa
aatgttagcaccagtatacctaattttggttctctaacacagattaatactacattactc
gatcttacctacgagatgttgtctcttcaacaagttgttaaagcccttaatgagtcttac
atagaccttaaagagcttggcaattatacttattacaacaaatggccgtggtacatttgg
cttggtttcattgctgggcttgttgccttagctctatgcgtcttcttcatactgtgctgc
actggttgtggcacaaactgtatgggaaaacttaagtgtaatcgttgttgtgatagatac
gaggaatacgacctcgagccgcataaggttcatgttcactaa
DBGET
integrated database retrieval system
