Viruses: 37627011
Help
Entry
37627011 CDS
T40000
Symbol
S, D1Y28_gp03
Name
(RefSeq) Betacoronavirus Erinaceus/VMC/DEU/2012; spike protein
KO
K24324
MERS coronavirus spike glycoprotein
Virus
1385427
Betacoronavirus Erinaceus/VMC/DEU/2012
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
Poty_coat
Adeno_PVIII
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
37627011
NCBI-ProteinID:
YP_009513010
RS:
NC_039207
LinkDB
All DBs
Position
NC_039207:21610..25602
Genome browser
AA seq
1330 aa
AA seq
DB search
MIRSACLLMCLLMFIKATPSEGTCISVDMQPSYFIKNWSMPINMSKADGVLYPVERTYSN
ITITLEGLFPHQADRGDMYVYSQSHKGRPFISNYSLVTNDFGNGIVIRIGSAANKTGSPI
ISNIASNFQIMKKLYPALLFGSAVGKFPANNKTGAYFNHSLVILPEKCGTVITALYCVLE
PKNDTNCTGSSGYVSYVLFENFSCDATTDGNLKNSLQQWFNIKDCLFEKNYNVTDDEREE
WFGIIQDQQGVHLYTSRKNGYSNNMFLFATLPIYDQILYYTVMPRSINASNYASYHAFSA
FYIYKLHKINYMVDFDVNGYITRAVDCGYNDYTQLQCSYGQFDMDSGVYSASYFNARSRG
YYYEAAELTECDLDVLFKNDAPIIANYSRRVFTNCNYNLTKLLSLVQVDEFVCHKTTPEA
LATGCYSSLTVDWFALPFSMKSTLAIGSAEAISMFNYNQDYSNPTCRIHAAVTANVSTAL
NFTANANYAYISRCQGVDGKPILLQPGQMTNIACRSGVLARPSDADYFGYSFQGRNYYLG
RKSYKPKTDEGDVQMVYVITPKYDKGPDTVCPLKDMGAASSSLDGLLGQCIDYDIHGVVG
RGVFQVCNTTGIASQIFVYDGFGNIIGFHSKNGTYYCMAPCVSVPVSVIYDKSSDVHATL
YSSVECNHIKSVATVFSRQTESKLRSSDNGLLQTAVGCVIGFRNTSDTVEDCTLPLGQSL
CAKPPSFSSRSTNVNNTFALVHMLFQNPLKVSVLNSTEFQVSIPQNFSFGITEEFIETSI
QKVTVDCKQYVCNGFERCEQLLVQYGQFCSKINQALHGVNLRQDDATKSLFEDIKVPQSV
PLMTSLTGDYNLSLFEAPNIGSGNNNYRSALEDLLFDKVTLSDPGYMKGYDECMKKGPPS
ARDLICAQYVSGYKVLPPLYDANMEAMYTASLTGSIAGSFWTGGLSSAAALPFAQSMFYR
MNGIGITQNVLMKNQREIANKFNQALGAMQTGFTATNQAFQKVQDVVNANAQALSKLASE
LANTFGAISSSIGDILKRLDVLEQEVQIDRLINGRLTSLNAFVSQQLVRSEAAARSSQLA
KEKINECVKAQSTRSGFCGQGTHIVSFVINAPNGFYFIHVGYHPQDYVNQTAAYGLCDSS
SSKCIAAKNGYFVKNDSDSDSWSYTGSSFYQPEPITSFNSRFVQPEFTFQNLTNNLPPPL
LSNNSDVTFEDELEEFYKNITSEIPNFGSISQINTTMLNLSREMSILQQVVKDLNNSYIE
LKELGNYTYYQKSPWYVWLGFIAGLVALALCLFFILCCTGCGTSCLGKINCTRCCDKYDD
FDMPEKIHIH
NT seq
3993 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatacgctcagcgtgtctactgatgtgcttgttaatgtttataaaagcaaccccaagc
gagggaacatgtatatctgttgacatgcagccctcatattttatcaaaaattggtctatg
ccaattaatatgagtaaagcagatggtgttttataccctgttgagcgtacttattctaat
atcacaataacgcttgaagggttatttccacaccaagcagatcgtggtgatatgtatgtt
tactcacaatctcataaaggcaggcctttcatttctaattattctctcgttactaatgat
tttggtaatggcatagtaattagaataggttctgctgctaataaaactggtagtcctatt
atttctaatattgctagtaactttcagattatgaagaaactttatccagctttgctcttt
ggtagtgctgttggtaaatttcctgctaataataaaacaggtgcttattttaatcatagc
ctcgttattttgcccgaaaaatgtggcactgttattacagcactttattgtgttttagag
cccaagaatgataccaattgtactggtagttctggttatgttagttatgtgctgtttgaa
aattttagttgtgatgcaactactgatggtaacttaaaaaatagtttacagcagtggttt
aatattaaggattgtctttttgagaaaaattacaatgttactgatgatgagagggaagag
tggtttggaattatccaagatcagcaaggtgtccacctctatacatctcggaagaatgga
tattcaaacaatatgtttttgtttgctactttaccaatttatgatcagatactatattat
actgttatgccgcgcagtattaatgctagtaattatgcatcatatcatgctttttctgca
ttttatatttacaagttacacaaaatcaactatatggttgactttgatgtaaatggttat
atcacaagggctgtcgattgtggttataatgattatacacaattgcaatgctcttatggt
caatttgatatggattctggtgtttattcagcttcgtattttaatgcccgctctagaggt
tattactatgaagctgcagaactcacagaatgtgacttagatgtattgtttaaaaacgat
gctcctataatagctaattacagtaggcgagtttttactaattgtaattataatttaaca
aaactcctttctcttgtgcaagtagatgagtttgtttgtcataaaacaacaccagaagcg
cttgctactggctgttattcctctctaacggtagactggtttgcgctgccttttagtatg
aagtcaacattagctataggatcagcagaagctatatctatgtttaattataatcaggat
tattccaatcctacgtgtagaattcatgcagctgtaacagctaatgtttcaacagcgttg
aattttactgctaatgctaattatgcttatatttccaggtgccaaggtgttgatggtaaa
ccaattctattacaaccaggacaaatgactaatattgcttgtcgttctggtgttttggca
cggccatcagatgcagattattttggctattcatttcaaggacgcaactattatttaggg
cgtaaatcttataaacctaaaaccgatgagggcgacgttcaaatggtttatgtaataacg
cctaaatatgataaaggccctgatactgtatgccctcttaaagatatgggtgctgcctct
tctagtttagatggcttgttagggcagtgcatagattatgacattcatggagtagtaggc
cgtggtgtttttcaagtttgcaataccacaggaattgctagtcaaatttttgtctatgac
ggatttggtaatatcataggctttcattctaaaaatggtacatactattgtatggcacca
tgcgtatcagtacctgtttctgtaatttatgataaaagcagtgatgttcatgctacgctt
tatagtagcgttgagtgcaatcatataaaatcagttgcaacagtttttagtcgtcaaact
gagtctaagcttagatcgagtgataacggccttttacaaacagctgtaggctgtgttatt
ggattccgtaacacaagtgacactgttgaagattgtaccttacctttaggccaatctctc
tgtgcaaaaccaccttctttttccagtcgtagtaccaatgttaataacacatttgcttta
gtgcatatgttgttccaaaatccattaaaagttagtgttctcaattcaactgagtttcag
gtttcaatacctcagaattttagttttggtattactgaagaatttatagaaacatccata
caaaaggttactgttgattgtaagcagtatgtttgtaatggatttgagcgttgtgaacaa
ttgttggtgcagtatggccaattttgttcaaaaattaatcaagcattacatggtgttaat
ttgcgccaagatgatgctactaagagtctttttgaggacattaaagtaccccaatcagta
cccttaatgacaagcctcactggtgattataatttatcattattcgaggcacctaatatt
ggcagtggtaataataactaccgcagtgctttagaagatctgctttttgataaggttaca
ttatcagatccaggttatatgaaaggatatgacgagtgcatgaaaaaaggaccacctagt
gctagggacctaatttgtgcacaatatgtatctggttataaagttttaccgcctttgtat
gatgctaatatggaggctatgtatactgcttctttaactggtagtatagcaggttctttt
tggacaggaggactatcgtctgctgctgcactaccatttgcacagtcaatgttttatcgt
atgaatggtattggcatcactcaaaatgttcttatgaagaaccagagggagatagccaat
aagttcaaccaggcattaggtgctatgcaaacaggattcacagctaccaatcaagctttt
cagaaggttcaagatgttgtgaatgccaatgcacaagcattatctaaattagctagtgaa
ttagctaacacattcggtgctatttcctcttctataggcgacatcttaaaacgcttggat
gttttagaacaggaagtgcaaatagaccgccttattaacggacgtctcacatcgttgaat
gcgtttgtaagtcagcaactggtgagaagcgaagctgctgcccgctcatctcagttagct
aaagagaaaattaatgaatgtgtcaaagctcaatccacacgtagtgggttttgcggacaa
ggcactcatatagtgtcatttgttattaatgctcctaatgggttctattttatacatgtg
ggttatcacccgcaggattatgtgaatcaaacagctgcatatggtctgtgtgattcttct
tcttctaaatgcatagccgccaagaacggctattttgttaaaaatgattctgatagtgat
agttggtcttatacaggcagtagtttttatcaacctgaacctatcactagttttaactcg
cgctttgttcagcctgagtttacatttcaaaatctaactaataaccttccacctccactc
ctaagtaataatagtgatgttacttttgaggatgagctggaagagttttataaaaatatt
acgtctgagatacctaattttggttctatcagccagatcaataccactatgcttaacttg
agtcgagaaatgagcattttacaacaagtggtaaaagatttaaacaactcttatatagag
cttaaagaattaggtaactacacatactatcaaaaatcgccgtggtatgtgtggttaggt
ttcattgctggtcttgttgcactagcactatgcttatttttcatactgtgttgcacagga
tgtggcactagctgccttggaaaaataaattgtactcgttgttgtgataagtatgatgat
tttgacatgccagagaaaattcacatacattaa
DBGET
integrated database retrieval system