Viruses: 4836012
Help
Entry
4836012 CDS
T40000
Symbol
S, BatCoVHKU9_gp2
Name
(RefSeq) Rousettus bat coronavirus HKU9; spike glycoprotein
KO
K24325
Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
694006
Rousettus bat coronavirus HKU9
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
4836012
NCBI-ProteinID:
YP_001039971
RS:
NC_009021
UniProt:
A3EXG6
Structure
PDB
LinkDB
All DBs
Position
NC_009021:20974..24798
Genome browser
AA seq
1274 aa
AA seq
DB search
MLLILVLGVSLAAASRPECFNPRFTLTPLNHTLNYTSIKAKVSNVLLPDPYIAYSGQTLR
QNLFMADMSNTILYPVTPPANGANGGFIYNTSIIPVSAGLFVNTWMYRQPASSRAYCQEP
FGVAFGDTFENDRIAILIMAPDNLGSWSAVAPRNQTNIYLLVCSNATLCINPGFNRWGPA
GSFIAPDALVDHSNSCFVNNTFSVNISTSRISLAFLFKDGDLLIYHSGWLPTSNFEHGFS
RGSHPMTYFMSLPVGGNLPRAQFFQSIVRSNAIDKGDGMCTNFDVNLHVAHLINRDLLVS
YFNNGSVANAADCADSAAEELYCVTGSFDPPTGVYPLSRYRAQVAGFVRVTQRGSYCTPP
YSVLQDPPQPVVWRRYMLYDCVFDFTVVVDSLPTHQLQCYGVSPRRLASMCYGSVTLDVM
RINETHLNNLFNRVPDTFSLYNYALPDNFYGCLHAFYLNSTAPYAVANRFPIKPGGRQSN
SAFIDTVINAAHYSPFSYVYGLAVITLKPAAGSKLVCPVANDTVVITDRCVQYNLYGYTG
TGVLSKNTSLVIPDGKVFTASSTGTIIGVSINSTTYSIMPCVTVPVSVGYHPNFERALLF
NGLSCSQRSRAVTEPVSVLWSASATAQDAFDTPSGCVVNVELRNTTIVNTCAMPIGNSLC
FINGSIATANADSLPRLQLVNYDPLYDNSTATPMTPVYWVKVPTNFTLSATEEYIQTTAP
KITIDCARYLCGDSSRCLNVLLHYGTFCNDINKALSRVSTILDSALLSLVKELSINTRDE
VTTFSFDGDYNFTGLMGCLGPNCGATTYRSAFSDLLYDKVRITDPGFMQSYQKCIDSQWG
GSIRDLLCTQTYNGIAVLPPIVSPAMQALYTSLLVGAVASSGYTFGITSAGVIPFATQLQ
FRLNGIGVTTQVLVENQKLIASSFNNALVNIQKGFTETSIALSKMQDVINQHAAQLHTLV
VQLGNSFGAISSSINEIFSRLEGLAANAEVDRLINGRMMVLNTYVTQLLIQASEAKAQNA
LAAQKISECVKAQSLRNDFCGNGTHVLSIPQLAPNGVLFIHYAYTPTEYAFVQTSAGLCH
NGTGYAPRQGMFVLPNNTNMWHFTTMQFYNPVNISASNTQVLTSCSVNYTSVNYTVLEPS
VPGDYDFQKEFDKFYKNLSTIFNNTFNPNDFNFSTVDVTAQIKSLHDVVNQLNQSFIDLK
KLNVYEKTIKWPWYVWLAMIAGIVGLVLAVIMLMCMTNCCSCFKGMCDCRRCCGSYDSYD
DVYPAVRVNKKRTV
NT seq
3825 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgttgatattggtgttaggggtgtcgcttgcagcggcgtctaggcctgagtgcttc
aatccgcgttttacactaacacctcttaaccatactttaaattacacgtctattaaggct
aaagtttcaaatgttttgttaccagatccatacatagcgtactctggtcaaactttgcgt
cagaatttgtttatggcagatatgtctaataccattctataccctgtaacgccacctgcg
aatggtgctaatggcgggttcatttataatacttctattattcctgtttctgcaggtcta
tttgtgaatacttggatgtataggcaacctgcgtcttcgcgtgcttattgtcaagagcct
tttggtgtagcttttggtgatacatttgaaaatgacaggattgctattcttattatggcc
ccagataacttaggttcttggagtgctgtggcgcctagaaatcaaactaatatttattta
ttggtttgtagtaatgcgaccctatgcataaaccctggttttaacaggtggggtcctgct
ggtagctttatagcacccgatgcacttgttgaccattctaattcatgtttcgtcaacaac
accttttcggtgaatattagtactagtcgtattagcctagcgttcctttttaaggatggt
gacttgcttatctaccattctggttggttacctacgtctaattttgaacatggtttcagt
aggggtagtcatcctatgacatattttatgtcgttgcctgtcggcggaaatttacctaga
gctcaatttttccagtctatagtgcgtagtaatgccatagataagggtgatggtatgtgt
actaattttgacgtaaatttgcatgttgcacatttaattaatagggaccttttagtgtct
tattttaataatggtagcgttgctaacgctgccgattgtgcggatagtgcggctgaagag
ctatattgtgttacaggctcgtttgatccgcctactggtgtctatcctttaagtagatat
agagcccaggtggctgggtttgtacgcgttactcagcgtggtagttattgcacaccacca
tatagcgtattacaagacccgccgcaacctgtagtatggcggcgttatatgctatatgat
tgtgtgtttgattttactgttgttgttgatagtttacctacacatcaattgcaatgttat
ggcgtgtcccctaggcgtctggcatccatgtgttatggtagtgtaacgctcgatgttatg
cgcattaatgagacgcatttgaataatttgtttaatcgcgtaccagatacttttagttta
tataattatgctttgcctgacaacttttacggttgtttgcatgcattctatttgaattct
acagctccttatgccgtagcgaataggtttcctattaaacctgggggccgccagagtaat
agtgcatttattgatactgttattaatgcagcccattatagccctttttcttatgtttat
ggtttggcagttattacattaaaaccggcggctggtagtaaacttgtttgtcctgttgct
aatgatactgttgttattacggatcgttgtgttcagtacaatctctatggttacactggt
actggcgttttgtcgaaaaacacttctttagttattccagatggtaaagtgtttactgct
tctagcacgggcactattataggtgtgtctattaatagtaccacttatagtatcatgcct
tgtgttacagtgcctgtatctgtaggctaccaccctaattttgaaagggcattgttgttt
aacggtctatcttgttcacagcgctcccgcgccgtgacggagcccgtatctgttttatgg
tctgctagtgcaacggctcaggatgcatttgacacaccatctggttgcgtggttaatgtt
gaactacgtaatactactatagttaatacatgtgctatgcctattggtaatagtttgtgt
tttattaatggttctattgctacggctaatgcagatagtttacctcgactgcagttagtc
aattatgatccattgtatgacaactctactgcgactcctatgacaccggtttattgggtt
aaggtccctacaaattttactctttctgctacagaggagtacatccagactactgcacct
aagattactattgattgtgcacgttacttgtgcggtgattcctcacggtgccttaatgtg
ctgttacattatggtactttttgtaatgacattaataaggcactatctagggttagcact
atcctagacagtgcccttttatccctagttaaagagttgtctattaatactagggatgaa
gtcactacattttcttttgatggggactataattttactggccttatgggttgtttaggc
cctaattgtggtgccaccacctataggtctgctttctctgatctgttatacgataaagtg
cgtattacagatcctgggtttatgcagtcttatcagaaatgtatagactctcagtggggt
ggcagtatacgtgaccttttatgtactcagacgtacaacggtatcgctgtattgccgcct
attgtatcaccagcgatgcaagctctttatacgtcactgcttgttggtgctgtggcgtcc
tctggttatacatttggtattacctctgcgggtgtcataccttttgccactcagttgcag
tttaggttaaatggcattggtgttactacacaagttcttgttgaaaatcagaagttgata
gcttcttcgttcaacaatgctcttgttaatatccaaaagggttttactgagactagtata
gcccttagtaagatgcaggatgttattaatcaacatgctgcgcagttgcacacccttgtg
gtacaattgggtaattcttttggtgcaatttcttctagtattaatgaaattttcagccgc
ttagagggtttagccgctaatgctgaagttgaccgtcttattaatggtcgtatgatggtc
cttaatacttatgtaacacaactgttaattcaggcttctgaagctaaggctcaaaatgca
cttgcagctcagaagattagtgagtgcgttaaggcgcagtctttacgtaacgatttttgt
ggtaatggtactcacgtgctaagtataccacaattagcgcctaatggtgtgttgtttata
cattatgcatacactcctactgagtatgcatttgtacagacctcggcgggcctctgtcat
aatggcacgggttatgccccgcgtcagggtatgtttgtgctacctaataatactaatatg
tggcactttactactatgcagttttataatcctgttaatatatctgctagtaatactcaa
gttcttactagttgtagtgttaattatactagcgtaaattacacagtactcgaacctagt
gtaccgggtgattacgattttcaaaaagagtttgacaagttttataaaaacttgtcaact
atctttaataatactttcaatcctaatgattttaatttttcaactgttgatgttactgct
cagattaaatcgttgcatgacgttgtcaatcagctcaaccagtcttttattgacttgaag
aagcttaatgtgtacgagaagaccattaaatggccttggtatgtttggttagcaatgata
gcgggtatagtaggtcttgtactcgctgttattatgcttatgtgcatgaccaattgttgt
tcatgttttaagggcatgtgtgactgcaggcgttgctgcggttcttatgattcatatgat
gatgtatatcctgctgtccgtgttaataagaaacgaacagtatga
DBGET
integrated database retrieval system
