KEGG   Viruses: 55060221
Entry
55060221          CDS       T40000                                 
Symbol
S, HO263_gp2
Name
(RefSeq) Wencheng Sm shrew coronavirus; spike glycoprotein
  KO
K19254  Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
1508228  Wencheng Sm shrew coronavirus
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 bCoV_S1_N CoV_S1_C CoV_S2_C Penicillinase_R
Other DBs
NCBI-GeneID: 55060221
NCBI-ProteinID: YP_009824974
RS: NC_048211
LinkDB
Position
NC_048211:19192..22596
AA seq 1134 aa
MKLIILFLVLPCVECVEYIKCSTTQLGFLDLEKITYSLFDLGDVGVNSTTLINGYFPSKD
INNWLCEKTGVSELYYGQAFYTILNKEGSASLKFLIQPIVYSNSSYVVFMVYKSGVLDFS
ICYRNYFQFAWNIDPPPPISCAFNRRIYFGDRHIYLGVIWRHGYVKIITPNFVQQFELDN
MHLEVIRVATGRYGSTSSYVIVMPFQIVDKRSIFLVNYNQSGYVSNLLNCSESIEAQLKC
KSRSFELQSGVYELALEERVGGYYTVVTNVTGDCNNIKYLFSNFTGNKQPLYAGNFASMS
CIVPFNFSINNGLLNNNSQLRGPNGEFKPFIDCKGINPIGLFGSNGTCYSGMKWRYWTRR
FSGYNMSIEGVAESFYDGGIGENECYGLLKGGQYNDLWRFTEVLYYKVRFMEKGLDVCYG
NLPPAPQVNKCNVWTFNDITFEGVLLETNKTFNPQLKALYKGSMVVMIRIFGIVYEVVPC
IKTRLSVIYNANNKNYSTLYRVANCNQIDTKRSVHPVGLLSRDGINTPCGCLRNAMFSPN
ITVDSYSCKTLLSDGYCVVFNNGSTEVVPIGIVGANTTYNMPILEESFVELALDHVLVSE
SEYFQTEMPVFDIDCEKYICDNSESCRMLLEQYAGFCSKITSDVKGNSQLLNANTLAMYK
NIVPSGSIKPIENFGDFNMSMFIDKSGRSVLEDLLFDKIVTTGPGFYDDYYKCRTTTVKD
LVCAQYYNGIMVIPPIQDAETIGMYGGIVAAGMTMGLFGGQATMGTWQTAMSARLNAVGV
TQGMIMEDVQKLANGFNTLATSVSKMASVTADALSRIQGVVNANALQVELLARATMDNFG
AISSNFEIIEKRLKQVQAEQQMDRVINGKMNALLNFVSNYKLKVSELTSIQQLVKQKVQE
CVHAQSLRNGFCGSGLHVMSIPQLVPNGVMFLHFSLVKNNSIIVKQTPGLCKEDKINCIV
PKSGIFVSKNDSNWYITPRNKYVPKNITNSDIIFTTYSENFTVINNTIQFPGIEFPQDGD
FDGQIKNVTLELQSLKDVVANMSYLDLSNHTALLKNISEEVKKMNITVSQFKQYVKYVKW
PWYVWLLIVMALIAFGLVCFWIFMCTGCCGLCDCIRRSCRDSNTYEPIEKIHIQ
NT seq 3405 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaacttattattttatttttagttttaccctgtgttgaatgtgttgaatatattaaa
tgtagtactacacaattgggttttttagatctagagaaaataacatattctctctttgat
ctaggtgatgttggtgttaatagtactacattgattaatggatattttcctagtaaagat
attaataattggttgtgtgaaaaaacaggtgttagtgagttgtattatggtcaagctttt
tataccatattaaataaggagggtagtgctagtttaaagtttttaattcaacctattgtt
tatagtaatagttcttatgtagtttttatggtttataagagtggtgtgttggattttagt
atatgttataggaattattttcaatttgcatggaacatagatccaccgccacccattagt
tgtgcttttaatagacgtatttattttggagatagacatatttatttaggtgttatttgg
cgtcatggttatgttaaaattattacgccaaattttgtgcaacagtttgaattggataat
atgcatttagaagttataagagttgcaactggtcgttatggtagtactagtagttatgtt
atagtaatgccctttcaaattgtagataaaagatctatatttttagttaattataatcaa
agtggttatgtaagtaatttattaaattgttcagaatctattgaagcacaattaaaatgt
aaaagtagaagttttgaacttcaaagtggtgtttatgaacttgcattagaagaaagagtt
ggaggttattatactgttgtgacaaatgttacaggtgattgtaataacattaaatatctt
tttagtaattttactggaaataaacaaccgctttatgctggtaattttgcaagtatgtct
tgtatagtaccatttaatttttccattaataatggtttgttaaataataattcgcaattg
agaggtcctaatggtgagtttaaaccttttatagattgtaagggtattaatccaattggt
ttatttggaagtaatggtacttgttattcaggtatgaaatggaggtattggaccagaagg
tttagtggttataatatgtctattgaaggtgtagctgaaagtttttatgatggtggtata
ggtgaaaatgaatgttatggtcttcttaaaggtgggcagtataatgacttatggcgattt
acagaggtcctttactataaagtgcgctttatggaaaaaggattagatgtttgttatggt
aatttaccaccagcaccacaagttaataagtgtaatgtatggacttttaatgatattact
tttgaaggtgtgttgttagaaaccaataaaactttcaatcctcagttgaaagctttatat
aaaggtagtatggttgttatgattagaatttttggcattgtgtatgaagtagtaccatgt
ataaaaactcggcttagcgttatttataatgctaataataagaactattcaacattgtat
cgtgttgctaattgtaatcaaatagacacaaaaaggagtgttcatccagttggattgttg
tctagagatggaattaatactccttgtggttgtcttagaaatgcaatgttttcgcctaat
ataaccgttgattcatatagttgtaaaactttattgagtgatggttattgtgttgttttt
aataatggtagtactgaggttgttcctattggtattgttggtgctaataccacctataat
atgccaatattagaagaatcttttgttgaattagcattagatcatgttttagtttctgaa
tctgaatattttcagacagaaatgccggtttttgatatagattgtgaaaagtatatttgt
gacaattctgaaagttgtcggatgttattagaacaatacgctggtttttgttctaaaata
acatctgacgtcaaaggaaattcacaacttcttaatgctaacacattggctatgtataaa
aacatagttccaagtggtagtattaagcctatagaaaattttggtgattttaatatgtct
atgtttattgataaaagcggtagaagtgttttagaagatttattgtttgataaaattgta
accactggtcctggtttttatgatgattattataaatgtcgcacaacaactgttaaagat
ttggtttgtgcgcaatattataatggtattatggtaatacccccaattcaagatgctgaa
actattggtatgtatggtggtattgtggcagcaggtatgactatgggtctttttggaggc
caagcaaccatgggaacatggcaaactgctatgtctgctcgtttgaatgctgttggtgtt
actcagggtatgattatggaagatgttcaaaagttggccaatggttttaatacattggct
acctcagtgtctaaaatggctagtgtaacagctgatgcgcttagtcgaattcaaggtgtt
gttaatgctaatgcattgcaagttgaattattggctagagctaccatggataattttggt
gcaatttcatcaaattttgaaattattgagaaacggttgaaacaagtgcaggctgaacaa
caaatggatcgagtgattaatgggaaaatgaacgcacttttgaattttgtgtctaattat
aagttgaaagtgtcagagttgacaagtattcaacagttggttaagcagaaagttcaagaa
tgtgtgcatgctcaaagtttaagaaatggattttgtggttctggcttgcatgtaatgtca
attccgcaattggttcctaatggtgtaatgtttttacatttttcattggttaagaataat
agtataattgttaaacaaacacctggtttgtgtaaagaagataagattaattgtattgta
cctaaaagtggaatttttgtgagtaaaaatgattcaaactggtacattacaccaaggaat
aagtacgtacctaagaatatcacgaatagtgatattatatttactacttattcggagaat
tttaccgttattaataacacaattcaatttccaggtattgaatttccacaagatggtgat
tttgatggacaaattaaaaatgtcacattagaattacaaagtttgaaagatgtggttgct
aatatgtcttatttagatttaagcaatcacacagcgttgttgaaaaatattagtgaagaa
gtgaaaaaaatgaacatcaccgtttcccaatttaaacaatatgttaaatatgtgaaatgg
ccttggtatgtttggcttttgatagtaatggctttgattgcttttggtttggtgtgtttt
tggatttttatgtgtactggttgttgtggtttgtgtgattgtattagaagaagttgtcgt
gattctaatacatatgaaccaatcgaaaaaatacacattcaataa

DBGET integrated database retrieval system