KEGG   Viruses: 55060248
Entry
55060248          CDS       T40000                                 
Symbol
S, HO267_gp03
Name
(RefSeq) Duck coronavirus; spike protein
  KO
K19254  Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
300188  Duck coronavirus
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 CoV_S2_C CoV_S1_C Sec8_N IFT57 DUF3418
Other DBs
NCBI-GeneID: 55060248
NCBI-ProteinID: YP_009825008
RS: NC_048214
LinkDB
Position
NC_048214:20318..23893
AA seq 1191 aa
MLATLVLLTTVLCVANPCLTFNGTSHGVHDGNFTARVCDGPAGYYSSSPIRPSDGVYSVN
GFYKPVYTCCIRHTYPKNTTQCANKKVSVLYYINDTTEAFSITIPRAVVIKPDTESFILS
LGDFLLTAKQLLVYGTIQSLMFLRNGTWYINGVPALPVSYTFNTTLNVTHTSCYESIGAQ
TFYFTSLILSNGLVEFSAGNLLRSVACEDNTIINSMQCSHQRFNFSTGLHSYDSVVPVSG
NVTYIPYPGVGDNSSLELYSLNVSLRSKGNYGVHYNYTCVNASLYTYFRVYCQDEHDWNT
EKLCTVSDYYVPGRHLYGSQHQYVGIVPHYTTCSSLGLSLSNINNNLGFDTFCITNARST
YNIAEVTQFQCLFVIDVMVFDATGGSSWGQPIEYFYVGLDFSFGNRMYGVLQIPPQVIYE
DQCHSYDIYGIKGTGHIYNVTGYDNYTLSTGGLAISGGNGLLAFRNNGSLYTVKPCSTVS
TQAVIVANQLAGLYLPLSCDIVFNLNLGNETTPVDGGCLVFNSTFKNRQSQLYGSECYGV
FATIGSSCIYANSSVLNRTLPRAGVDTTVEPLLDVTANVSIPYTLTLAVTTEYLQTSYQK
VTIDCARYVCGESLKCRTLLQQYGSFCTSVNNILAGVNDNEDNGMLSFVEAINTGYSLNF
SSFNSSNLGGFNLSLVLPNSAKPSGRSFIEDLLFDKVVTVGVGEVDANYDKCMDSRGGKF
TNAADLTCAQFYNGIMVLPGVVDPDLMTLYTGSLLGGMSFGGLSSAASIPFATQVQARIN
YLALTQSVLLDNQNLIANSFNNALEKIQSALDVVSAGFQEVAKGFETVSVALSKVQDVVN
SHSEILNKLMAQLNVNFGAISSSLSDIYSQLDELNANAQVDRLITGRLTALSTYAASLQL
AAYKAEESRKLALQKVEECVKSQSMRYGFCGNGSHVLTIPQTAPNGMFFIHYTYPPASYI
TVEAVPGLCVTTRTGSYGVMPKTGSGIIFRANGTFFVTARTLYQPKLLSYSDVVNLTSCE
ANYYNVSQDETPFQPELPSFDDEFDNIYTELNTSKDLIDSIYKDFNYTIPILNLEDDICR
LNSSINALWNYSSIIDEINAALNDTYINLEQLNKVTRYIKWPWYVWLAIGFACLIFVLIL
CWIFFMTGCCGCCCGCFGIIPLMYKCSKKSSYYTTFDDDVVGEQIRPKKFV
NT seq 3576 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttggcaacgttagttttgttgacgacagttttgtgtgttgctaatccatgtttaact
tttaatggtacttctcatggtgtacatgatggtaatttcactgcacgtgtttgtgatggg
cctgctggttattattcttcatcaccaattcgtccatctgacggtgtctatagtgttaac
ggtttttataaacccgtttatacatgttgtataaggcatacctatccgaaaaatacgacg
cagtgtgcgaataaaaaagtttctgttttgtattatattaacgacacaacagaggctttt
tccattaccatacccagagccgttgttattaaaccggacacagaatctttcattttgtcg
ctgggtgattttttactcacagctaaacagctgttagtttatggcactattcagtctctt
atgtttttgcgtaatggtacttggtatattaacggtgttccggctcttcctgtcagttac
acctttaataccactttaaatgtcactcatactagctgttatgagagtattggtgcacaa
actttttattttacttcactaatcctttctaatgggttagttgaattttctgctggcaac
cttcttcggtctgttgcttgtgaagacaacactattataaactctatgcaatgtagtcac
cagcgatttaatttttcgactggtttgcattcttatgacagtgttgttcctgtttctggt
aatgtcacctacattccttaccctggtgtcggggacaattcgagtttggagttgtacagt
cttaatgtttcgcttcgttctaaaggtaactatggcgttcattataactatacttgtgtt
aatgcttctctgtacacctattttcgtgtttattgtcaggatgaacatgattggaataca
gaaaagctatgtactgtgtctgactattatgtgcctggtagacatttgtatggcagccaa
catcaatatgttggcattgtccctcattatactacctgttcttcgttagggcttagcctt
agtaatattaataataatttgggttttgatactttttgtattactaatgctaggtctact
tataatatagcagaagtcacccagtttcaatgtctttttgtgattgatgttatggttttt
gatgctacaggtggtagtagttggggtcaacctattgaatatttttatgttggcctcgat
ttttcttttggtaatagaatgtatggtgtcttgcaaattcctccgcaagttatatatgaa
gaccagtgtcattcttatgatatttatggtattaaaggcactggtcacatctataatgtc
actggttatgacaattacaccttatctacaggtggtttggctatatcaggtggtaatggt
ctattggcctttcgtaataatggttctttgtatactgtcaaaccgtgttctacagtatct
actcaggctgttattgtagctaaccagttggcagggttgtatttaccgctctcatgtgac
atagtttttaatcttaatcttggtaatgaaactactcctgttgatggcggctgtttagtt
tttaattcaacttttaagaaccgacaatcacagctttatggcagtgagtgttatggtgta
tttgccactattggttcttcgtgtatttatgctaattcttctgtgttaaatcgtacactg
ccgagggcaggcgtagataccactgtagaaccattattggatgtgacggccaatgtttcc
ataccctataccctgacactggcggtcactactgaatacttacaaacatcttaccagaaa
gtcactattgactgtgcccggtatgtgtgtggtgagtctcttaaatgtcgtactcttttg
cagcagtatggcagtttttgtaccagcgttaataatatattagctggtgttaacgataat
gaggataacggcatgctttcttttgtggaggctattaatactggttattctcttaacttt
tctagttttaacagttcaaaccttggtgggtttaatctgtcgttagtcttacctaattca
gcaaagccctcgggacgttcctttattgaagatttactctttgataaagtggttactgtc
ggtgtgggtgaagttgatgctaattatgataagtgcatggattcaagaggcggcaagttt
actaatgctgctgacttgacatgtgctcagttttataatggtatcatggtgcttcctgga
gtggtggacccagaccttatgacactttatacaggctcacttctgggtggcatgtctttt
ggtggtctttcttctgctgcctctataccttttgccacacaggtgcaggcccgtattaat
tatttggcacttactcagtctgtgcttttggataatcaaaaccttattgctaattcattt
aataatgctcttgaaaaaatacagtcagcacttgatgtggtgtcagctggttttcaagag
gttgcaaaaggctttgagactgtttctgtagcactttctaaggttcaggatgttgttaat
tcacattctgagattttgaataaacttatggcgcagcttaatgttaattttggcgccatc
tcttcttctttgtctgatatctattctcaacttgacgagcttaatgctaacgctcaagtt
gatagattgataacaggtaggttgacagcactctctacatatgcagcttctttacagttg
gctgcatataaagcagaagagtcgcgtaaattggctttgcagaaagttgaagaatgtgtt
aaatcacagtctatgcgttatgggttttgtggtaatggcagtcatgttttaaccatacca
caaacagcacctaatggtatgttttttatacactatacctatccccctgcctcatatata
actgttgaggcggtaccagggttgtgtgttaccacacgtactggttcttatggtgttatg
cctaaaactggtagtggtattatatttagggctaacggcacgttctttgtaactgcccgt
actctttatcagcccaaattgctttcttattcagacgtcgttaatttaacgtcgtgtgaa
gctaattattataatgttagccaagatgaaacaccgtttcagcctgagctacctagtttt
gatgatgagttcgataatatatataccgaactcaacacttctaaagacctcatagactca
atctataaggattttaattataccatccctattcttaatttagaggatgatatatgtagg
ttgaactcttctattaatgcgctgtggaattacagctctattatagatgagatcaatgct
gcgctcaatgacacttacattaacctggaacaacttaataaggttaccaggtacattaag
tggccttggtacgtttggcttgctataggttttgcatgccttatttttgtgttaatccta
tgctggattttctttatgactggttgttgcggatgttgctgtggttgttttggtataata
cctcttatgtacaagtgcagcaaaaaatcttcgtattacaccacctttgatgatgatgtc
gtaggtgaacaaatcagacctaaaaagtttgtttaa

DBGET integrated database retrieval system