Viruses: 55060279
Help
Entry
55060279 CDS
T40000
Symbol
S, HO264_gp06
Name
(RefSeq) Murine hepatitis virus; spike glycoprotein
KO
K24325
Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
11138
Murine hepatitis virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
DUF2959
HSBP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55060279
NCBI-ProteinID:
YP_009824982
RS:
NC_048217
LinkDB
All DBs
Position
NC_048217:23930..27904
Genome browser
AA seq
1324 aa
AA seq
DB search
MLFVFILFLPSCLGYIGDFRCIQLVNSNGANVSAPSISTETVEVSQGLGTYYVLDRVYLN
ATLLLTGYYPVDGSKFRNLALTGTNSVSLSWFQPPYLSQFNDGIFAKVQNLKTSTPSGAT
AYFPTIVIGSLFGYTSYTVVIEPYNGVIMASVCQYTICQLPYTDCKPNTNGNKLIGFWHT
DVKPPICVLKRNFTLNVNADAFYFHFYQHGGTFYAYYADKPSATTFLFSVYIGDILTQYY
VLPFICNPTAGSTFAPRYWVTPLVKRQYLFNFNQKGVITSAVDCASSYTSEIKCKTQSML
PSTGVYELSGYTVQPVGVVYRRVANLPACNIEEWLTARSVPSPLNWERKTFQNCNFNLSS
LLRYVQAESLFCNNIDASKVYGRCFGSISVDKFAVPRSRQVDLQLGNSGFLQTANYKIDT
AATSCQLHYTLPKNNVTINNHNPSSWNRRYGFNDAGVFGKNQHDVVYAQQCFTVRSSYCP
CAQPDIVSPCTTQTKPKSAFVNVGDHCEGLGVLEDNCGNADPHKGCICANNSFIGWSHDT
CLVNDRCQIFANILLNGINSGTTCSTDLQLPNTEVVTGICVKYDLYGITGQGVFKEVKAD
YYNSWQTLLYDVNGNLNGFRDLTTNKTYTIRSCYSGRVSAAFHKDAPEPALLYRNINCSY
VFSNNISREENPLNYFDSYLGCVVNADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKSRRAHRSVS
TGYRLTTFEPYTPMLVNDSVQSVDGLYEMQIPTNFTIGHHEEFIQTRSPKVTIDCAAFVC
GDNTACRQQLVEYGSFCVNVNAILNEVNNLLDNMQLQVASALMQGVTISSRLPDGISGPI
DDINFSPLLGCIGSTCAEDGNGPSAIRGRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGQEV
RDLLCVQSFNGIKVLPPVLSESQISGYTTGATAAAMFPPWSAAAGVPFSLSVQYRINGLG
VTMNVLSENQKMIASAFNNALGAIQDGFDATNSALGKIQSVVNANAEALNNLLNQLSNRF
GAISASLQEILTRLEAVEAKAQIDRLINGRLTALNAYISKQLSDSTLIKVSAAQAIEKVN
ECVKSQTTRINFCGNGNHILSLVQNAPYGLYFIHFSYVPISFTTANVSPGLCISGDRGLA
PKAGYFVQDDGEWKFTGSSYYYPEPITDKNSVIMSSCAVNYTKAPEVFLNTSIPNPPDFK
EELDKWFKNQTSIAPDLSLDFEKLNVTLLDLTYEMNRIQDAIKKLNESYINLKEVGTYEM
YVKWPWYVWLLIGLAGVAVCVLLFFICCCTGCGSCCFKKCGNCCDEYGGHQDSIVIHNIS
SHED
NT seq
3975 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgttcgtgtttattctatttttgccctcttgtttagggtatattggtgattttaga
tgtatccagcttgtgaattcaaacggtgctaatgttagtgctccaagcattagcactgag
accgttgaagtttcacaaggcctggggacatattatgtgttagatcgagtttatttaaat
gccacattattgcttactggttactacccggtcgatggttctaagtttagaaacctcgct
cttacgggaactaactcagttagcttgtcgtggtttcaaccaccctatttaagtcagttt
aatgatggcatatttgcgaaggtgcagaaccttaagacaagtacgccatcaggtgcaact
gcatattttcctactatagttataggtagtttgtttggctatacttcctataccgttgta
atagagccatataatggtgttataatggcctcagtgtgccagtataccatttgtcagtta
ccttacactgattgtaagcctaacactaatggtaataaattaatagggttttggcacacg
gatgtaaaacccccaatttgtgtgttaaagcgaaatttcacgcttaatgttaatgctgat
gcattttattttcatttttaccaacatggtggtactttttatgcgtactatgcggataaa
ccctccgctactacgtttttgtttagtgtatatattggcgatattttaacacagtattat
gtgttacctttcatctgcaacccaacagctggtagcacttttgctccgcgctattgggtt
acacctttggttaagcgccaatatttgtttaatttcaaccagaagggtgtcattactagt
gctgttgattgtgctagtagttataccagtgaaataaaatgtaagacccagagcatgtta
cctagcactggtgtctatgagttatccggttatacggtccaaccagttggagttgtatac
cggcgtgttgctaacctcccagcttgtaatatagaggagtggcttactgctaggtcagtc
ccctcccctctcaactgggagcgtaagacttttcagaattgtaattttaatttaagcagc
ctgttacgttatgttcaggctgagagtttgttttgtaataatatcgatgcttccaaagtg
tatggcaggtgctttggtagtatttcagttgataagtttgctgtaccccgaagtaggcaa
gttgatttacagcttggtaactctggatttctgcagactgctaattataagattgataca
gctgccacttcgtgtcagctgcattacaccttgcctaagaataatgtcaccataaacaac
cataacccctcgtcttggaataggaggtatggctttaatgatgctggcgtctttggcaaa
aaccaacatgacgttgtttacgctcagcaatgttttactgtaagatctagttattgcccg
tgtgctcaaccggacatagttagcccttgcactactcagactaagcctaagtctgctttt
gttaatgtgggtgaccattgtgaaggcttaggtgttttagaagataattgtggcaatgct
gatccacataagggttgtatctgtgccaacaattcatttattggatggtcacatgatacc
tgccttgttaatgatcgctgccaaatttttgctaatatattgttaaatggcattaatagt
ggtaccacatgttccacagatttgcagttgcctaatactgaagtggttactggcatttgt
gtcaaatatgacctctacggtattactggacaaggtgtttttaaagaggttaaggctgac
tattataatagctggcaaacccttctgtatgatgttaatggtaatttgaatggttttcgt
gatcttaccactaacaagacttatacgataaggagctgttatagtggccgtgtttctgct
gcatttcataaagatgcacccgaaccggctctgctctatcgtaatataaattgtagctat
gtttttagcaataatatttcccgtgaggagaacccacttaattactttgatagttatttg
ggttgtgttgttaatgctgataaccgcacggatgaggcgcttcctaattgtgatctccgt
atgggtgctggcttatgcgttgattattcaaaatcacgcagggctcaccgatcagtttct
actggctatcggttaactacatttgagccatacactccgatgttagttaatgatagtgtc
caatccgttgatggattatatgagatgcaaataccaaccaattttactattgggcaccat
gaggagttcattcaaactagatctccaaaggtgactatagattgtgctgcatttgtctgt
ggtgataacactgcatgcaggcagcagttggttgagtatggctctttctgtgttaatgtt
aatgccattcttaatgaggttaataacctcttggataatatgcaactacaagttgctagt
gcattaatgcagggtgttactataagctcgagactgccagacggcatctcaggccctata
gatgacattaattttagtcctctacttggatgcataggttcaacatgtgctgaagacggc
aatggacctagtgcaatccgagggcgttctgctatagaggatttgttatttgacaaggtc
aaattatctgatgttggctttgtcgaggcttataataattgcaccggtggtcaagaagtt
cgtgacctcctttgtgtacaatcttttaatggcatcaaagtattacctcctgtgttgtca
gagagtcagatctctggctacacaaccggtgctactgcggcagctatgttcccaccgtgg
tcagcagctgccggtgtgccatttagtttaagtgttcaatatagaattaatggtttaggt
gtcactatgaatgtgcttagtgagaaccaaaagatgattgctagtgcttttaacaatgcg
ctgggtgctatccaggatgggtttgatgcaaccaattctgctttaggtaagatccagtcc
gttgttaatgcaaatgctgaagcactcaataacttactaaatcaactttctaacaggttt
ggtgctattagtgcttctttacaagaaattctaactcggcttgaggctgtagaagcaaaa
gcccagatagatcgtcttattaatggcaggttaactgcacttaatgcgtatatatccaag
caacttagtgatagtacgcttattaaagttagtgctgctcaggccatagaaaaggtcaat
gagtgcgttaagagccaaaccacgcgtattaatttctgtggcaatggtaatcatatatta
tctcttgtccagaatgcgccttatggcttatattttatacacttcagctatgtgccaata
tcctttacaaccgcaaatgtgagtcctggactttgcatttctggtgatagaggattagca
cctaaagctggatattttgttcaagatgatggagaatggaagttcacaggcagttcatat
tactaccctgaacccattacagataaaaacagtgtcattatgagtagttgcgcagtaaac
tacacaaaggcacctgaagttttcttgaacacttcaatacctaatccacccgactttaag
gaggagttagataaatggtttaagaatcagacgtctattgcgcctgatttatctctcgat
ttcgagaagttaaatgttactttgctggacctgacgtatgagatgaacaggattcaggat
gcaattaagaagttaaatgagagctacatcaacctcaaggaagttggcacatatgaaatg
tatgtgaaatggccttggtatgtttggttgctaattggattagctggtgtagctgtttgt
gtgttgttattctttatatgttgctgcacaggttgtggctcatgttgttttaagaagtgt
ggaaattgttgtgatgagtatggaggacaccaggacagtattgtgatacataatatttcc
tctcatgaggattga
DBGET
integrated database retrieval system