Viruses: 5656561
Help
Entry
5656561 CDS
T40000
Symbol
Pol, AKAV_sLgp1
Name
(RefSeq) Akabane virus; RNA-dependent RNA polymerase
KO
K25345
Peribunyaviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
70566
Akabane virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
Bunya_RdRp
L_thumb_ring_vir
L_protein_N
COMPASS-Shg1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
5656561
NCBI-ProteinID:
YP_001497159
RS:
NC_009894
UniProt:
A4UVN7
LinkDB
All DBs
Position
NC_009894:31..6786
Genome browser
AA seq
2251 aa
AA seq
DB search
MDNYKINQYRARINDANDPETAKDILADLLMDRHNYFGRELCYYLDIEYKNDTPIDDILL
DFLPPGTDFKARYCTPDNYIIHNRKLYVLDYKVAVDNESSAKTFEKYDKIFGDVLVPLGL
DYEIVIVRADPVRDVIHVNSEDFLHEFGPINMNLDFTWFYNLRALIYDKFKDDERFLEIA
SQGEFTMTGPWLDDETPELYDHPIFKEFYDSLPNESKITFQRSMNFDATKGDKWNQNLVD
TIHEYTPSYNLFIKTASSGIFKCHGDYPKPSNSEITQGWQLMTERITSERELTNDINKQK
PSIHFLWCPPSQESNENIKKLLRLSKMLQKLDGTSTYLDAFKAIGILMDFSSNVGLYESH
TSKLKNMSRQTSKKIDKKIEAIKIGTSTVMWEQQFVFDTNIIDHQSKGKLFKEFIGIGNH
KQFSKKTIEDIDISQPTILDFNNKNIIDKCTFQYKNVDKILSKPNMLDKMGCYLEEYGPQ
ICAASEETWETLKLICNMSYWSAIKDFSTLMKNMLAVSQYNRHNTFRVVTCANNNLFAIV
MPSSDIKTKRATLAYFIICIHDHKDNIMHHGALHATFKSEGKYVSISKGIRLDKERCQRI
VSSPGLFLLTTLLMYNNNPTIKIEDVANFAFHTSLSITKAMLSLTEPSRYMIMNSLAISS
HVKDYISEKFSPYTKTSFSVIMANLIKKGCYNAYKQRSKVDLRSIHLTDYEITQKGVNNN
RDLSSIWFEGKVSLKEYINQIYMPFYFNSKGLHEKHHVMIDLAKTVLEIEHDQRLNIPGI
WSSTPQKQTVNLPVLIYAISKNLLMDTSRHNYIRSRIENSNNLKRSITTISTFTSSKSCI
KVGDFADFKSRESRVVNAKLEKDIRKYTIANPEFVEDLTEKAIIRHAIYDDLKKAIPDYI
DVMSTKVFDALYYKIKHGEITDKPAVEHILQVMKNHKRFVFTYFNKGQKTAKDREIFVGE
FEAKMCLYLVERISKERCKLNPDEMISEPGDGKLKKLEDMAEYEIRYTANTLKSMKDKAL
QEFSKFADDFNFKPHSTKIEINADMSKWSAQDVLFKYFWLFALDPALYKPEKERILYFLC
NYMDKVLVIPDDVMTSILDQRVKREKDIIYEMTNGLKQNWVSIKRNWLQGNLNYTSSYLH
SCCMNVYKDIIKNVATLLEGDVLVNSMVHSDDNHTSITMIQDKFPDDIIIEYCIKLFEKI
CLSFGNQANMKKTYVTNFIKEFVSLFNIYGEPFSVYGRFLLTAVGDCAFLGPYEDTASRL
SATQTAIKHGAQPSVAWVAIALTQWITHSTYNMLPGQNNDPLNVLTSQNRFDIPIELCGL
LNTDLPTLAIAGLESGNLTYLVNLSRRMSKVQLLRESIQSQYTDIESWDLSKLTQMDKFK
LKLLRFMTLDSAMSSDDGMGGTSDMRSRSLLTPRKFTTHASLVRLESYNDFQKLVQDQGQ
IDDLFEFFIRMPQLLVTKGETTEEFMKSILFRYNSRKFKESLSIQNPAQLFIEQVLFANK
PMIDYTSIHDRLFGIQDDPNIDDSTMIIGKKTFVETYRQIQIDLNKFEITNQDVKTIYAF
CLMNDPILVACANNILLSMHGLQMNRNGMTCCMMPEIKSLKVIYHSPALVLRAYVQENNN
IKGAEPDEMQRDLYHLEEFIAKTKLRESMQARIAKNELKTMGRDFKFEIQELTKFYQICY
DYIKSTEHKIKIFILPKRAYTPIDFCGMITGNTLKDQCWFTIHYLKQITVPARKAQIATS
LDLEIQIAYESLRLIAHFADTFIAENSRIPFLKQVISNFLYKGIQMQVLYNKIKASRLRT
KILPILFYMGDLEQLDVDRYDAEKAEEQITWNNWQVSREFTTGPIDLSIKGYGRSIRIVG
EDTRLTAAELQINRMRNDIVSRHGQSLLNKPHGLKFEKMDEVEFLDDKLHYIVYQLRDRK
RYYYNILSTNAIYEHNERLSQTRSRRNNRWIPVCPVAISKYINTDRPILDRIEMLNIDNT
KLTSLQVAVSDTAMVKKAALAKMSFFEGPPIQCGGIDLSKLMQNQTIINLDINKISSISL
LDLCRIFSCRGYSNDQDAFEFLSDEVMNEDISEELDSSPVLKITYTKKSNSQNTFKNAIV
KALVRECDRFEEIFDLSDDGFTSDSNLELLENLVWILNHLKTNQWSTELMECIHMCLYRN
EMDHIYHNFQIPDVFVTNPIELSIKWLDVMEFLEMILSHDFKSEPWISIMNHSITKAIDY
SRLEHKKTSAQANISKFIKGKKMGGRSKFDF
NT seq
6756 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaattacaagatcaatcaatatcgtgctaggatcaacgatgcaaatgatccagaa
actgctaaagatatattagctgatctattaatggatcgacataactactttggcagagaa
ctctgttactatcttgatattgagtataaaaatgacacgccaattgatgatatcctgctg
gatttcttgccaccggggactgatttcaaggctagatactgtacaccagacaattacatt
attcacaacaggaaattatatgtattggattacaaggttgctgtcgataatgaatcttca
gctaaaacttttgaaaaatacgacaagatattcggcgatgttttggtgccattgggcctg
gattatgagatagtcattgttagggctgacccggtacgggatgtgatacatgtcaactca
gaagatttcctccacgaattcggcccgattaatatgaacttagattttacttggttttac
aatcttcgtgcattaatatatgataagtttaaagatgatgaacgcttcttagaaatagct
agccaaggtgaatttacaatgactgggccgtggcttgatgatgaaacgccagaattgtat
gatcatcctatattcaaagaattctatgactccctgccaaatgagtcaaaaattaccttc
cagcgctcaatgaactttgatgcaacaaaaggcgacaaatggaaccaaaacctggttgat
acaatacatgaatacaccccaagttacaatctctttataaaaactgcctcatctggtatt
ttcaaatgtcatggagattacccgaaacccagcaattctgaaattacacaaggttggcaa
ctaatgacagagagaataaccagcgaaagagaactaactaatgacataaacaaacaaaaa
ccttctatccacttcctttggtgtccaccaagtcaagagtccaatgaaaatatcaaaaag
ttattacggctatctaaaatgctccaaaagctagatggcaccagcacatatttggacgca
tttaaagccattggcattctaatggatttctcatccaatgttgggttgtacgaatcacat
acaagtaagttgaaaaatatgtcaaggcaaacatcaaaaaagattgacaaaaaaattgaa
gctataaaaattggtacctcaactgtaatgtgggaacagcaatttgtctttgacacaaac
atcatagatcaccaatcgaaggggaagctcttcaaagaatttataggaattggcaaccat
aaacaattttcaaagaaaacaattgaggacattgatatctcacagcctactatattagac
ttcaataacaaaaacataattgacaagtgtacattccaatataaaaacgttgacaagata
ttatcaaagccaaatatgctagacaagatgggatgttatcttgaagagtatggcccacaa
atttgtgctgcatcagaagaaacatgggaaacacttaagcttatatgcaacatgtcatat
tggtcagcaataaaggatttttcaaccttaatgaaaaacatgttggcagtgtcacagtac
aataggcacaacacattccgggtagtgacttgtgcaaataataacttatttgctatcgtt
atgccatcttcagatattaagacaaagagggcaacattggcatactttataatatgtatt
catgatcataaagacaacattatgcaccatggggctttacatgcaacatttaaaagtgaa
ggaaaatatgtaagtatctcaaaagggatcagattagataaggagaggtgccaaaggata
gtttcttcccctggactatttttactaacaacactattgatgtacaataacaacccgacg
attaagattgaggatgttgcaaattttgcttttcatacatctctatctattacgaaggcc
atgttatctttaactgagccatctaggtatatgataatgaattcacttgctatatcaagt
cacgttaaagattacatatcagagaaattttcaccatatacaaaaacgagcttctcagta
attatggctaatttgattaaaaagggctgttacaacgcatataagcaaagatcaaaggtt
gatcttagaagcatacatctaacagattacgaaataactcagaagggtgttaataataat
cgagatttgtcatcaatctggtttgagggcaaagtgtcgttgaaagaatatataaatcag
atttatatgcccttttactttaattcaaaaggattgcacgaaaagcaccatgttatgatt
gatcttgcaaaaacagtactagaaatagagcatgatcaacggctcaatatacctggtata
tggtctagtactcctcagaaacagacagtgaatctgcctgttttgatatatgctatttct
aaaaatctcctaatggacacatctagacacaattatattcgatctagaatagagaactca
aataacttaaagcgatctatcactactatcagcacttttactagttcaaagtcgtgtatt
aaggttggtgattttgcagacttcaaatcaagagaatcaagagttgtcaatgctaaactt
gagaaggatatcaggaagtacacaatagccaacccagaatttgttgaagatctgacagaa
aaagccattataaggcatgccatttatgatgacttaaaaaaagctataccagattatatt
gatgtgatgtccactaaagtatttgacgcattgtattataaaattaagcatggtgaaata
acagacaaaccagctgtcgagcatatactccaagtcatgaaaaatcataagagatttgtc
tttacatattttaataaaggccaaaaaacagcaaaagatagagaaatatttgtgggagag
tttgaagctaaaatgtgcttatacttagtagaaaggatatctaaagaaaggtgcaaactc
aatccagatgagatgattagcgaacctggagatggtaagcttaaaaagcttgaagatatg
gcagaatacgaaattcgatatactgctaacacattaaagtccatgaaagacaaggcattg
caagaatttagtaaatttgcagatgacttcaattttaagccacattcaacaaaaatagag
ataaatgcagacatgtcgaaatggagtgcacaagatgttctcttcaaatatttttggtta
tttgctcttgaccctgcactttataaaccagagaaagaaaggattttatacttcttgtgt
aattacatggataaggtgctagttattcctgatgatgtgatgacgtcgatattagatcaa
cgtgtaaagcgagaaaaggatattatatatgaaatgacaaacgggctgaagcaaaactgg
gtttctatcaaaagaaactggcttcagggcaacctgaattacacatctagctatttacat
tcttgttgtatgaatgtttacaaagacattatcaagaatgtagctacgctcctagaaggc
gatgttttagtgaattcaatggttcactcagatgataaccacacttcaataacaatgatt
caagacaaattcccagatgatatcattattgaatactgcattaaattatttgaaaaaata
tgcctgtcctttggaaaccaagctaacatgaagaagacctatgtcacaaatttcatcaaa
gaatttgtttctctgttcaatatctatggagaaccgttctcagtgtacggtcgattttta
ctcaccgcagtaggtgattgtgcattcctcggtccgtatgaagatacggcaagcaggtta
tctgctactcaaactgcaattaaacatggtgctcagccatctgttgcttgggtggcaatc
gcccttactcagtggataacacatagcacttataacatgttacctggacaaaacaatgat
ccactgaatgttttaacttcgcaaaatagatttgatatacctatagaactttgcggattg
ttaaatacagatctgccaacattggcgatagcaggtttagaatcaggcaatctgacttat
ttggttaatttgtccagaaggatgtccaaagtccagctactacgtgaaagtattcaatct
caatatacagacatagagtcttgggacttaagtaagttgacacagatggataagtttaag
cttaagttactgaggttcatgacgttagattcagctatgagtagcgacgacggtatggga
gggactagtgatatgcgttctcggtctctgttaacaccacggaaatttacaacacatgcg
tccttagtcaggttagaatcttataatgatttccaaaagctagtgcaggaccaggggcaa
atagacgacttattcgaattctttattagaatgccacaattgctggttactaaaggggaa
acaactgaagaatttatgaaatcaatcttgtttaggtacaatagcaggaaattcaaagaa
tctttatcaatacaaaacccagcacaactctttatagaacaggtactatttgcaaacaag
cccatgattgattataccagcatacatgacagactttttggtatacaagatgatcctaac
atagatgacagtacgatgataatagggaagaagacctttgttgagacgtatcgacagata
caaatagatcttaataaatttgagatcaccaatcaagatgtcaaaaccatttatgcattt
tgtctaatgaatgatcctatattggtagcctgtgccaacaatattttgctatctatgcat
ggcctgcaaatgaatcgtaacggaatgacatgttgtatgatgccagaaataaaatctcta
aaagtaatataccactccccggctctggtgctacgagcatatgtacaagaaaataacaat
atcaagggagctgaaccagatgaaatgcagcgtgatctgtaccatctagaggaattcatt
gccaaaactaaacttcgtgaaagtatgcaagctagaattgcaaaaaacgaacttaaaact
atgggtagagactttaaatttgagatccaagaattaacaaaattttatcagatatgttat
gactatattaaatctactgagcataaaattaagatattcattttacctaaacgagcttat
actccaattgacttctgtggcatgattacaggtaatacattgaaagatcaatgctggttt
actatacattatttaaagcaaattacagtaccggcaagaaaagcccagatagcaacatcg
ttagacttagagatacaaatagcctacgagtcattgcgattaattgcacattttgcagac
acatttattgctgagaattcaagaattccattccttaaacaagttatatcaaatttccta
tataagggtattcaaatgcaagtgctatacaataaaataaaggcttcgcgacttaggaca
aaaatattgccaattttgttttacatgggcgatttagaacagcttgatgtagacaggtat
gatgctgaaaaggcagaagagcagataacatggaacaattggcaggtatctagagaattt
acaactggaccaattgacctgtcaataaaaggatatgggagatctataagaattgtaggg
gaagatacacgactgactgcagctgaattacaaatcaaccgcatgagaaatgatatagta
tcaaggcatggacagtctctgttgaacaagccacatggcttaaaatttgaaaaaatggat
gaggtggaattcttggatgacaaactgcattatattgtctatcagttaagagatagaaaa
cgttattattataatatattgtccacaaatgcgatatatgagcataatgaaaggttaagc
caaacaaggtccagaagaaataaccggtggatacctgtttgtccagtagcaatatcaaag
tatattaatacagataggcccatactggatagaatagaaatgctcaatattgacaatact
aagttaactagcctacaagtagctgttagcgatactgcaatggttaagaaagcagcactt
gcaaaaatgtctttttttgaaggtccacctatacaatgtgggggtatagatctttcaaaa
ttgatgcagaatcaaaccatcataaacttggatatcaacaagatttcctcaataagttta
ctggatctttgtagaatattctcatgcaggggctattcaaatgatcaagatgcatttgag
ttcttatctgatgaagttatgaatgaagacatctctgaagagctagacagttcaccagtt
ttaaaaatcacatatacaaagaagtctaattcgcaaaacacatttaaaaatgctatagta
aaggctttagtacgtgaatgcgatcgatttgaagagatatttgatctttcagatgatggt
ttcacttcagatagcaatttggaactgttagaaaatctagtttggatactaaaccacttg
aagaccaaccagtggtctacagaattgatggagtgtatccacatgtgcttatacagaaat
gaaatggatcatatataccacaacttccaaataccagatgtatttgtaacaaacccaatt
gaactgagtattaaatggttagatgtaatggaattcctagaaatgatcctttctcacgat
tttaagtctgaaccctggatatcgataatgaatcattctatcacaaaagctattgattac
tcacgtttagagcataaaaagacaagtgcacaagcaaatatatccaaattcataaaggga
aagaagatgggtggtcgatcaaaatttgatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system