KEGG   Viruses: 6020262
Entry
6020262           CDS       T40000                                 
Symbol
S, BatCoVHKU8_gp2
Name
(RefSeq) Miniopterus bat coronavirus HKU8; spike protein
  KO
K19254  Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
694001  Miniopterus bat coronavirus HKU8
SSDB
Motif
Pfam: CoV_S2 CoV_S1 CoV_S1_C CoV_S2_C Prominin DUF2959 Collagen_mid DUF1664 Exonuc_VII_L Syntaxin COG3_N Allexi_40kDa Sec8_N CCDC144C DUF16 PhageMin_Tail
Other DBs
NCBI-GeneID: 6020262
NCBI-ProteinID: YP_001718612
RS: NC_010438
UniProt: B1PHK2
LinkDB
Position
NC_010438:20956..25083
AA seq 1375 aa
MKSLLVLSLLALLATLSVNAQVTGEGGVAEGNYWVNASCAGWSYFYALKLGLPPNASAIV
TGYLPKPKGWICPRFNGAGIYTRNNANAVFVMYRTKALAFEIGVSSSAGGEQYSAYMAQQ
NGKYLVLRICKWQNGTLAAPTLQSTSGKDCIVNVKVDNHMFYHAAHDIVGMSWSGDAVRL
YTQTDTKTYYIPNSWDRVSIRCPDKFSCSSQIVTKAITVNVTTFANGTIDKYAICDNCNG
YPAHIFPVSEGGLIPADFNFSNWFLLTNSSTIVDGRIVSEQPVLLMCLWAVPGLMSTNSF
VYFNGTAPNKQCNGYATDSAFEALRFSLNFTDERVFAGSGSVVLLVSGLQYKFSCTNNSE
AVIDSGIPFGNVVEPFYCFVSINGTSIFVGMLPAVLREIVITRYGSIYLNGFSIFQGPPI
QGVLFNVTNRGATDLWTVALSNFTEVLAEVQSTAIKALLYCDDPLSQLKCQQLQFSLPDG
FYATASLFQHELPRTFVTLPRHFTHSWINLRIKWKNGVCYNCPPASSWIDFVTFNSNGTE
NVLPERTLCVNTTQFTTNLTLIEEAFSYSTPVVVRADDCPFDFQSLNNYLTFGSICFSLN
GTIGKGCTLGIYKRASSQYIPIWNVWVAYTSGDNILGVREPNVGVRDQSVVHQNVCTSYT
IFGHSGRGIIRPANISYIAGVYYTAASGQLLGFKNTTTGEVFSVTPCNPSQQAVVVKDRL
VGVMSSTSTVSIPFNNTIPTPSFYYHSNATSSCDDPSVVYSSIGICDDGGITFVNSTRVR
GEPDPAISMGNISVPSNFTVSIQVEYLQMSIRPVSIDCAMYVCNGNPHCTRLLQQYISAC
RTIEEALQLSARLESFEVNSMLTVSETALDLVNISTFGGDYNLTALLPQGGGKRSVIEDI
LFDKVVTSGLGTVDEDYKRCTNGIGIADVPCAQYYNGIMVLPGVVDEEKMSIYTASLLGG
MTMGGFTPVAALPFALSVQSRLNYVALQTDVLQKNQQILANAFNSAIGNITVAFDQVTTA
VQQTSDAIKTVASALNKVQSVVNSQGQALHQLTKQLASNFQAISASIEDIYNRLDGLAAD
ANVDRLITGRLAALNAFVTQTLTKYTEVRASRLLAQEKINECVKSQSTRYGFCGNGTHLF
SIPNAAPEGIMLFHTVLVPTEYVSVTAWSGYCHNGVGYAVKDVGNSLFQFNNTFYITPRN
MYQPRTPTSADFIRISGCNVVYVNITDEQLPQVQPEFIDVNKTLEELMSRLPNNTGPNLP
LDIFNQTYLNISAEIDALENKSLELQATADKLQLTIEQLNATLVDLEWLNRFEQYVKWPW
WVWLTMIIALVLLTGLMLWCCLATGCCGCCSCMASTLDFRGSRLQQYEVEKVHIQ
NT seq 4128 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaatctttacttgtcttaagccttttggccttgttggccacattgtctgtcaatgcg
caggttactggtgaaggcggtgtggcagaaggtaattattgggttaatgcctcttgtgct
ggttggagctatttttatgctcttaagcttggcctaccacccaatgcctctgccatagtc
actggttatttacccaaacctaagggttggatatgtcctagatttaatggtgccggtatc
tatacacgtaataatgccaatgctgtttttgttatgtatagaaccaaagcccttgccttt
gagattggtgttagttcttctgctggtggtgagcagtatagtgcttacatggctcagcag
aatggcaaataccttgtgcttcgtatatgcaagtggcagaatggcactttggctgccccc
actttgcagtccacttctgggaaggattgtattgtcaatgttaaagttgacaatcatatg
ttctatcatgcagctcatgatatagtcggcatgtcctggtctggtgacgctgtacgtcta
tatacccagactgacacaaaaacttattacatccctaattcttgggacagagtgtctatt
aggtgccctgataagttctcgtgttcctcacaaattgtcactaaggctattactgtcaat
gtcaccacttttgctaatggtaccattgacaagtatgccatttgtgacaattgtaatgga
tatccggctcacatctttcctgtatctgaaggtggacttattccagctgattttaatttt
tctaactggttcctgcttactaatagttctactattgttgatggccgcattgtttcagaa
cagcctgtgctacttatgtgtctttgggctgtacctggactgatgtcaactaatagcttt
gtctatttcaatggtacagcccctaataagcaatgcaatggctatgctacggatagtgct
tttgaggcattacggttttcccttaattttaccgatgaaagagtctttgctggcagcggc
agtgttgtactacttgtgtctggtttgcagtacaagtttagttgcactaataattctgag
gctgtgatcgattccggaattccttttggtaatgttgttgagccgttttattgttttgtc
tctattaatggcacttctatttttgttggcatgctccctgctgttttacgtgaaattgtt
atcactcgttatggcagtatttatctcaatggtttctccatttttcaaggcccacccatt
cagggtgttttgttcaatgtaactaatagaggtgcaactgatctttggaccgttgcactc
tctaactttacggaagtccttgctgaagttcaaagtactgccattaaagctctgctttat
tgtgatgacccattgtctcagcttaagtgtcaacaattgcaattttcgctgcctgatggg
ttttatgcaactgcctcactttttcaacatgagttgccacgtacttttgtcactttacca
cgccattttacgcattcttggattaacctgcgtattaaatggaagaatggtgtttgttac
aattgtccacctgcttcttcttggattgattttgtaacattcaattctaatggcaccgag
aatgttcttcctgaacgcactttatgcgttaacaccactcagtttactaccaatttgact
cttattgaggaggcttttagttattccactcctgttgttgttcgtgctgatgattgtcct
tttgacttccagtccttgaacaattacctaacttttggttccatttgtttttctttgaat
ggcaccattggtaagggttgcacacttggaatatataaacgagcctcgtctcagtacatt
cctatttggaatgtttgggtggcttacactagtggtgataatatcctcggtgtcagagag
cccaatgttggtgttagagatcagagtgtagtgcaccagaatgtttgtacatcatataca
atttttgggcattcaggtcgcggtattatcagacctgctaatatttcatatatagcaggt
gtgtattatactgctgcttctggtcaactattgggctttaagaataccaccactggtgaa
gtgttttctgttacaccatgtaacccatcacagcaggctgttgttgtgaaggatcgtctt
gttggtgttatgtcatctactagcactgtttcgattccgtttaataatacgattccaact
cctagtttttactatcatagtaatgccactagtagttgtgatgatccatctgttgtttat
tcatctattggtatttgtgatgatggcggtattacttttgttaatagtactagggttcgt
ggtgaaccagatcctgctatttcaatgggtaatatttctgttccatcaaatttcactgtt
tccattcaggttgagtacttgcagatgtccattaggcctgtttcgatagattgtgctatg
tatgtctgtaatggcaatcctcattgtactaggttgttgcagcaatatatttctgcttgc
cgaaccattgaggaggccttacagcttagcgcgcgcctagagagttttgaagttaatagc
atgctgactgtttctgaaacagcgttagacctagtcaacatcagcacatttggtggcgat
tacaatctcactgctttgttgccgcaaggtggtggtaaacgcagtgttattgaagatatc
ttgtttgacaaggttgtcaccagtgggctgggcactgttgatgaggattacaagcgttgt
accaatggtattggtattgctgatgtcccatgtgcgcagtattataatggtattatggta
ctgccaggtgttgttgatgaggagaagatgtccatctatactgcttcccttcttggtggc
atgactatgggtggttttacacctgtcgctgctttgccttttgctttgtcggtacagtcc
cgtcttaattatgttgcactccaaactgatgttttgcagaaaaatcaacagattttggca
aatgcctttaattctgcaattggtaatatcactgttgcgtttgatcaggtaacaactgca
gtgcaacaaacttctgatgctattaaaactgttgccagcgctcttaataaggttcagagc
gttgttaactctcaaggtcaggccttgcatcaacttactaaacagcttgcttccaatttt
caagctatttctgcttctattgaagatatttataataggcttgatgggcttgctgctgat
gctaatgttgatcgcttaattacaggacgccttgctgctttgaatgcttttgttactcag
actcttactaagtacacagaagttcgtgctagcaggttgttggcgcaggagaagattaat
gagtgtgttaagtcacaatccactcgttatggattttgtggaaatggcactcatttgttc
tccatccctaatgctgcacctgaaggtattatgctgtttcatacagttcttgtacccact
gaatatgtctcagttactgcctggtctggctattgtcataacggtgttggttatgccgtg
aaagatgtaggcaattcgctgtttcagtttaataatacattttacatcacacctcgaaat
atgtatcagccacgtacacctacgtccgctgactttattcgtatttcaggttgtaatgtt
gtctatgtcaacattactgatgaacagctgccacaagttcagcctgagtttattgatgtc
aacaagactcttgaagagttaatgtccaggttgccaaacaatacagggccgaacttgcct
cttgatatttttaaccagacatatcttaatatcagtgctgagattgatgctcttgaaaat
aagtcattggagcttcaggctactgctgacaaattacagctaaccattgagcagctcaat
gccactctcgttgatcttgaatggcttaatcgctttgaacagtatgttaagtggccctgg
tgggtatggctcaccatgattattgccttggtcttgttgactgggcttatgttatggtgt
tgccttgctactggatgctgtggttgctgtagttgtatggctagtactcttgattttaga
ggcagtaggttacaacaatacgaagttgaaaaagtgcacatccagtaa

DBGET integrated database retrieval system