Viruses: 6020275
Help
Entry
6020275 CDS
T40000
Symbol
S, BatCo1A_gp2
Name
(RefSeq) Bat coronavirus 1A; spike protein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
393767
Bat coronavirus 1A
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
CoV_S1
CoV_S1_C
CoV_S2_C
DUF16
DUF2959
HMMR_N
Baculo_PEP_C
Syntaxin-6_N
Dynamitin
Exonuc_VII_L
Laminin_II
PIN_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
6020275
NCBI-ProteinID:
YP_001718605
RS:
NC_010437
UniProt:
B1PHJ5
LinkDB
All DBs
Position
NC_010437:21071..25198
Genome browser
AA seq
1375 aa
AA seq
DB search
MLFILCIALCFNFVSANIGCESNGNLDMQRLKLGLPSNITNAYVSGYLPSPDSWNCTQNP
VGVANITYNAKAVFISYYKFGREVAVGVGNSKSNDSIGIYFNHHNGNKSTILRVCRWHKY
YMPSYTPTITTGGKDCVINTNLKLSFVDQGNHSDIFGLSWSGDRLTIYSLDGVKSYYIPG
IGELDVVSFRCVYKETCAHQVITKPITAIVNTTADGLISGYSVCDDCDGFPKYVFAVTEG
GEVPPNFRLDNWFYLTNSSTPISGMFTSVQPFNLSCVWTVPVLTNNSLPVYFNMSMNENV
TCNGYSNFDVGVVDAMRFSLNFTDNQIIRKGVISVFTSTNVYNFSCTNNSVLDGDAVIPF
GDVAQTHYCFIKYFTNITSGESVSQFVGILPPQVKEFVIMRNGDFHLNGYRIFSVDRVES
AIFNISTNDGRDFWTVAFANNAEVLTEINATSIQNLLYCNNPVNSIKCQQLRFNLDDGFY
SHTFDSADNLPRTIVRLPKYVTHSYINVTVGVNFENGTLTNYLVDFAPDGTSIGKDNITT
VCVDTTTFTTRLNVLAFSAFSTAVDIQAGTCLFSYNNLNNYLGLVSLCFSTKPNGGCMMS
VVARGYFGEFQKVGVLYVSFTKGDNVLGVPPNNIPTIGVSDMSDVKLNVCTTFTIYGHTG
RGIINKSNNTFVSGLFYTSVTGNLLGFKNSTTGEIFSISPCQLTTQVAAVSDKIVGVAAA
TKEVTLPFDTHVSLGSFYYHYKNSNAELCKNPSLMYGGLGVCEDGRLVNISRSEDTFVPS
AVISGNITIPANFSFVVQPEYIQIMTKPVSVDCSVYVCNGNPRCLQLLTQYASVCRTVEE
PLQLNARLEALELTSMIIVQDKTLKLGVASNFNDTFDLTLALPRQHQSRSAIEDLLFSKI
VTSGLGTVDDDYKECAAKMANTIAEAGCVQYYNGIMVLPGVVDPSLLSQYTAALTGAMVL
GGVTAAAAIPFSLAVQARLNYLACQTDVLQRNQMILAQSFNAAMGNITVAFSGVSNAIQQ
TAQSLNTISQALNKVENVVNEQGTALSQLTKQLASNFQAISSSIEDLYNRLDTLEADQQV
DRLITGRLAALNAFVTQQLLRYSEVRASRQLAQEKINECVKSQSSRYGFCGNGTHVFSVA
NAAPDGIMFLHANLVPTAFIEVSAFAGVCVDGRALVLRGRDEVLFQKPDTDQYLITPRLL
FEPRVPVSADFVEVSSCNVTFINLTINELPELLPDYIDVNKTLKEFAATIPNRTEMQLTL
NTYNATVLNLTDEVKSLMSQADDLTKIASELNLTISKINNTLVELEWLNRVETYIKWPWY
VWLAIAVTLIILVGPMLWCCLATGCCGCCSCLVNSCSDCGGRRLQRYEIEKVHVQ
NT seq
4128 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttttcattttatgcattgcattgtgttttaattttgtcagtgccaatattggttgt
gagtccaatggtaatttggacatgcaacgcttgaaactaggtttacctagtaatatcaca
aatgcatatgtttctggttacttaccttcacctgattcttggaattgtacacaaaaccct
gttggtgttgctaatataacttataatgctaaagctgtttttatcagctattataagttt
ggaagagaagttgccgttggtgtgggtaattctaagtctaacgactctattggaatttac
tttaatcatcataatggtaataaaagcaccattctaagagtttgtaggtggcataagtat
tacatgccatcatacacacctaccatcactacaggtggtaaagattgtgttataaataca
aaccttaagctgagttttgttgatcaaggtaaccacagtgatatatttggtcttagttgg
tcaggtgacagactgaccatttattcacttgatggtgtgaaatcctactatattcctgga
ataggtgaacttgatgttgtatcattcaggtgtgtttataaagaaacttgtgctcaccaa
gttataactaaacccattacagctattgttaacaccactgcagatggtcttatttctggt
tactctgtttgtgatgattgcgatggctttcctaagtatgtttttgctgtaactgagggt
ggtgaagtaccaccaaattttcggttggacaattggttttatttaaccaatagttctaca
cctatttctggtatgttcacttcagttcagccttttaatttatcatgtgtttggacagtt
cctgtgttgactaataactcactacctgtttattttaacatgtcaatgaatgaaaatgtg
acttgcaacggctacagcaactttgatgttggtgttgttgatgcaatgcgcttttctctt
aatttcactgacaatcaaattatacgcaagggtgttatttctgtgtttactagcactaat
gtgtataattttagttgtactaataacagtgttcttgatggtgatgctgtcatacctttt
ggtgatgttgcacaaacacattactgttttatcaagtactttactaatattacttcaggt
gaaagtgttagtcaatttgttggtattttaccaccacaggttaaagagtttgtaattatg
cgtaatggtgattttcacctgaatggctacaggatattttctgtggatcgcgttgaaagt
gctattttcaacatttctacaaatgatggtagagatttttggacagttgcatttgccaac
aatgctgaggtgttgactgagataaatgctactagtatccaaaacttgctttactgtaat
aaccctgtgaacagcatcaagtgtcagcaattgcgctttaatcttgatgatggcttttat
tcacatacttttgacagtgctgataatttacctcgaactatagttcgtttgcctaagtat
gtgactcattcttacattaatgtcacggttggcgttaattttgagaatggaacgcttact
aactatcttgttgactttgcacctgatggtacatccataggcaaagataacataactact
gtttgtgttgacactacgacgtttactactcgtcttaatgtattagcattttctgctttc
agtactgctgttgacatacaagctggaacttgtctttttagttacaacaatttaaacaac
tacctaggtttggtttctttgtgtttttccacaaaaccaaatggtggctgtatgatgagt
gttgttgctaggggttattttggcgagtttcaaaaagttggcgttctgtacgtttcattt
actaagggtgataacgtacttggtgttcctccaaacaatattcctactataggtgttagt
gatatgagtgatgtcaaactaaatgtttgcactacattcaccatctatggtcatactggc
agaggtataattaacaaatctaataacacttttgtttcaggtttgttttacacatccgtc
actggtaatttgcttggttttaagaactctactactggagagatttttagtatttctccg
tgccaacttacaactcaagttgctgctgtttctgacaagattgttggtgttgctgcagca
acgaaagaagttacattgccttttgacactcatgtcagtttgggctctttttattatcat
tataaaaattctaatgctgagctttgtaagaatccaagtttaatgtatggtggtcttggt
gtctgtgaagatggtaggctcgtcaacatttcaagatctgaagacacttttgtaccttca
gctgtaataagtggcaacattacaatacctgctaatttcagttttgtagttcaacctgaa
tacattcagattatgacaaaacccgttagtgtggattgtagtgtttatgtttgtaatgga
aatcctaggtgtctacagttactgactcagtatgccagtgtctgtagaactgttgaagaa
ccattgcagctaaatgcacgtttagaagcactagagcttaccagtatgattattgttcaa
gacaaaactttgaaacttggtgtggcatccaattttaatgatacatttgatcttactttg
gctttacctagacaacatcagtctaggtctgctattgaagatctgttgttcagtaaaatt
gtaaccagtggtctcggtactgtagatgacgattacaaggaatgtgctgctaaaatggct
aatactattgctgaggctggttgtgtccagtattataatggcattatggtgttgcctggt
gtagttgatccttctttgctttctcagtacacagctgcacttactggtgctatggtactt
ggtggtgtcaccgctgctgctgcaatacctttttcacttgctgttcaagctagacttaat
tatctggcttgccaaactgatgtgttgcagcgtaatcagatgatattagctcagtctttt
aatgctgcaatgggtaatattacagttgcttttagtggtgtaagtaatgccattcaacaa
acagcccagtcattgaataccatttcccaagcccttaataaggttgagaatgttgtcaat
gaacaaggaactgctttgtctcagttaaccaagcaacttgcttctaattttcaagccatt
tcttcttctatagaagatctgtataataggcttgatactttggaagcagatcagcaggtt
gacagattgattacaggacgtcttgctgcacttaatgcttttgtgactcaacagttgttg
cgttattcagaggttcgtgcttctagacaattggctcaagaaaagattaatgagtgtgtt
aaatcacagtcttctagatatgggttctgtggtaatggaacacatgtcttttctgttgct
aatgctgctcctgatggtattatgtttttacatgctaatcttgtacccactgcatttatt
gaagtctctgcctttgctggagtttgtgttgatggtagagcattggttcttagaggtcgt
gatgaggttttatttcaaaagcctgatactgatcagtatctaatcacaccaaggcttctt
tttgaaccacgagttcctgtcagtgctgattttgttgaagttagcagttgtaatgttacc
tttattaatttgactatcaatgagttgccagagcttttgcctgactacattgacgttaat
aaaactttgaaggaattcgctgctaccattccaaatcgcactgaaatgcaattgacgttg
aacacttataatgctactgttcttaatctcactgacgaagttaaatcacttatgtcacaa
gctgacgatttgacaaaaatcgctagtgagcttaatcttaccatttctaagattaataat
actcttgttgaacttgagtggcttaacagagttgaaacttacattaaatggccttggtat
gtgtggttggctattgctgttacacttatcatattggtcggacctatgctatggtgttgt
ctcgcaactggttgttgtggttgttgcagctgtttggtcaactcttgcagtgactgtggc
ggtagacgcttacaacgttacgaaattgagaaagtccacgttcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
