Viruses: 7040215
Help
Entry
7040215 CDS
T40000
Symbol
S, ThCoV_gp2
Name
(RefSeq) Thrush coronavirus HKU12-600; spike glycoprotein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
572290
Thrush coronavirus HKU12-600
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
CoV_S1
CoV_S1_C
CoV_S2_C
DUF2959
DUF2397
Phasin
DUF16
Allexi_40kDa
Phage_GPO
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7040215
NCBI-ProteinID:
YP_002308497
RS:
NC_011549
UniProt:
B6VDX8
LinkDB
All DBs
Position
NC_011549:19433..23011
Genome browser
AA seq
1192 aa
AA seq
DB search
MQRVILICFITLASAARLVDRVFDALTFPNAHQYLRDTRQIQPRWLPSAEEPKSDGKGHF
TQNVHRFAFLTNGSSPVDQIIRTTQPLLLRCPQWFGYNGSGNWVLKFNFSESNYCNDGYN
YNGNKVVSHIRLIGAFLASPSVDYVFTLQTTSGSTYYLNCSTSQRPVGFDAEMQRNYCYV
KTANYTQFIGILPERVADVTFSREGTFYVNGFGMGSFGQLARITVDKGALATFNHSWAYF
VDEADVLLNITDSQIQGIVYCDKDLYDHLRCQQSSFSLTDGFYSTAKYTTNQQRKTIFVT
LPKHTYTETISILPNISNPAYPDGSTNGPALGWWVGTMNVLFNNSQTLCVNSSFFMVNIT
FKCWLKPHPTKPSDEYKCIGGLPTAQVKLPDWPFAPYYSFSQLCLSSTYQVGYSTFYFQY
WNQGTNKRWESKPLFYYTYQTGTQYTYVTKPVISFTDVSELSLYECVDYNIYGVIGSGII
QPSNISYLNGLYYTSSAGQLLAFKNSTTFQIYTVQPCDSPGQVIVYNNSFIGAITASNQT
ILNFKSRIATPTFYYHTNATSVQGNCNTAPLQFSSIGICPDGSIMQVNTTVDTLPATTII
TSGNITIPLNFTISIQAEYLQIQAQHTVVDCQTYVCNGNAKCLQLLQQYSTACSNIEQSL
TMSARLDNAETLAMVQTSTQGYHLSKIEQHDNQYNLTAILPNKQGGRSAIEDLLFDKVVT
NGLGTVDQDYKECTKGVSLADLACAQYYSGIMVLPGVVDAEKMAMYTASLTGGMFFGGLT
AASSIPFSVAVQARLNYVALQTDVLQKNQQILANSFNQAMGNITLAFSSVNDALQQTSEV
IQTVANALNKIQDVVNKQGSALNHLTLQLQNNFDAISHSIADIYARLDEVEANQQVDRLI
TGRLAALNAYVTQVLTQISQLKAQRQLAQEKINECVKSQSDRFGFCGNGSHLFSITQAAP
NGILFLHTVLTPTDRVQVNAIAGICVSDSAFVLREPNLAFFQHDGKWLISPRRLFQPRPA
TVADFVQIQSCEVTFYNTTYDELPQLIPDYVDVNQTVSDILANKTDPSLDLKLDIYNQTV
LNLSAEVDELFQRAQNLTLIFKQLEQYINNINNTLVDLEWLNRVETYIKWPWWVWLLIVL
AIAAFACIVITIFLCTGCCGGCFGCCGGCFGLFSKRKFDSDPTPVSFKLKEW
NT seq
3579 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcagagagttatattaatttgcttcataaccctagcatcagctgccaggctggttgat
agagtttttgatgcattaacttttccaaatgctcatcaatatcttcgagacacaaggcaa
attcaacctcgttggttgcctagtgctgaagaacctaaatcagatggcaagggacatttt
acccaaaatgtccatagatttgcttttcttactaatggttcatcacctgttgaccaaatt
attcgtacaacgcaacctctgcttttgcgttgtcctcaatggtttggttataatggtagt
ggtaattgggtgctaaaatttaattttagtgaatctaattactgtaatgatggttacaat
tataatggtaacaaagtagtctcacacataagacttattggtgcatttttagcttcacca
tctgttgattatgtgtttacattgcaaactacctctggtagcacctactacttaaactgc
agcacatcacaacgtccagttggatttgatgcagaaatgcaacgtaattactgttatgtt
aagactgctaattacacgcaatttataggcattcttcctgaaagagtagctgatgttact
ttttccagagagggcaccttttatgtcaatggctttggcatgggttcctttggtcagctg
gcccgtatcacagttgataaaggggctctagccacttttaaccattcatgggcatatttc
gttgatgaagcagatgtgcttcttaacataactgacagccagattcagggtattgtctat
tgtgacaaggacctgtatgatcatcttcgctgccagcagtcatcatttagtttaactgat
ggattttattcaacagctaaatatactacaaatcagcagaggaaaacaatttttgttact
ctgcctaaacacacatatacagagactatctcaatcttgcctaacatttcaaacccagct
taccctgatggtagtaccaatggtcctgcattgggttggtgggttggtacaatgaatgtt
ttatttaataattcacaaacactttgtgttaattcatcattttttatggttaacattact
tttaaatgttggttgaaacctcaccctaccaaaccttctgacgaatataagtgcataggt
ggtttacccacagctcaggttaaactacctgactggccttttgcaccttattattctttt
agccaactttgtttgtctagtacataccaggttggttattccactttctatttccagtat
tggaaccaaggtactaataaaagatgggaatcaaaacccctcttttattacacttatcaa
acaggtactcaatacacttatgtaacaaagccagttatatcatttactgatgtttctgaa
ttgtcactttatgagtgtgttgactacaacatttatggtgttattggttctggtatcatc
caaccttctaacatctcttatttgaatggcctctactatacttctagtgctggccaacta
ttagcatttaaaaactccacaactttccagatttacacagttcaaccttgtgattcacct
ggacaagttatagtttacaacaattcttttattggagccattactgcctccaatcaaact
attttgaattttaagagtcgcattgcaactcctacattctactatcatacaaatgccact
agtgttcaaggaaattgtaatactgcaccattgcagttttcctcaattggcatttgtcct
gatggttctattatgcaggtcaacactactgttgacacactacctgcaacaacaattatt
accagtggtaatattacaataccactgaattttacaatttcaattcaggctgaatacttg
caaatacaagcacagcatactgttgtggactgtcaaacatatgtctgcaatggtaatgca
aaatgcttgcaattacttcagcaatattctactgcctgttcaaacattgaacaatcactt
actatgtctgctcgacttgacaatgctgaaacgcttgccatggtgcagacttctacgcaa
ggttatcatctgtcaaagattgaacagcatgataatcaatataatttaactgctatacta
cctaataaacaaggtggtagatcagcaattgaagatctactttttgacaaagtagttaca
aatggacttggcactgttgaccaggattacaaggaatgcaccaaaggtgtttcacttgca
gacctggcatgtgctcaatattattcaggtattatggttcttccaggcgttgttgacgct
gaaaagatggccatgtacactgcttcacttacaggtggtatgttctttggaggacttacc
gctgcttcttccatacctttttccgtagctgttcaagcacgtcttaattatgttgcactt
cagactgatgtgctgcagaaaaaccaacaaatacttgccaatagctttaatcaggccatg
ggcaatataacacttgcattttcttctgttaatgatgctcttcagcaaacctctgaagta
atccaaacagttgcaaatgcactcaataaaattcaggatgttgtgaacaagcaaggctct
gctttgaaccacctcaccctgcagttacaaaacaattttgatgctatttcacattcaata
gcagacatttacgctagacttgatgaagtagaagcaaatcagcaagtcgatcgcctcatt
acaggcaggcttgctgcattaaatgcatacgtcactcaagttctaacacaaatttcccag
cttaaagcccaaaggcaattagctcaggagaaaataaacgagtgtgtgaaatcacaatct
gacagatttggattctgcggaaatggttcacacttattttctattacacaggctgcaccc
aatggcatcctgtttttgcacactgttctaacaccaactgacagagtccaggttaatgct
attgctggcatttgtgtctctgattcagcttttgtgttacgtgaacctaaccttgctttc
tttcaacatgatggcaagtggttaatttcaccccgcagattgtttcaaccaagaccggcc
actgttgctgactttgtgcaaatacagtcctgtgaggttactttctacaatacaacctat
gatgagcttccacaattaatccctgattatgtggatgttaaccagacggtttctgacata
ttagccaacaaaacagatccatctttggaccttaagttggacatttacaatcaaactgtt
ttaaacctctctgctgaagttgatgaacttttccagagggctcaaaatcttactctaatt
ttcaaacaattggagcagtatatcaacaacatcaacaacactctagtagatttagagtgg
cttaatagagttgaaacctacattaaatggccttggtgggtttggctactcattgtgtta
gccatagcagcctttgcctgtatagttattaccatcttcctttgcactggttgctgtggg
ggatgttttggttgttgtggaggctgttttggattgttctcaaagagaaaatttgacagc
gacccgacaccagtttcttttaaattaaaggaatggtag
DBGET
integrated database retrieval system
