Viruses: 918758
Help
Entry
918758 CDS
T40000
Symbol
S, HCoV229Egp2
Name
(RefSeq) Human coronavirus 229E; surface glycoprotein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
11137
Human coronavirus 229E
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
CoV_S1
CoV_S1_C
CoV_S2_C
DUF2959
DUF1664
DUF16
SesA
DUF948
Laminin_II
ArsR
Exonuc_VII_L
Phage_GPO
Baculo_PEP_C
PIN_8
WXG100
DUF5082
HAUS-augmin3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
918758
NCBI-ProteinID:
NP_073551
RS:
NC_002645
UniProt:
P15423
Structure
PDB
LinkDB
All DBs
Position
NC_002645:20570..24091
Genome browser
AA seq
1173 aa
AA seq
DB search
MFVLLVAYALLHIAGCQTTNGLNTSYSVCNGCVGYSENVFAVESGGYIPSDFAFNNWFLL
TNTSSVVDGVVRSFQPLLLNCLWSVSGLRFTTGFVYFNGTGRGDCKGFSSDVLSDVIRYN
LNFEENLRRGTILFKTSYGVVVFYCTNNTLVSGDAHIPFGTVLGNFYCFVNTTIGNETTS
AFVGALPKTVREFVISRTGHFYINGYRYFTLGNVEAVNFNVTTAETTDFCTVALASYADV
LVNVSQTSIANIIYCNSVINRLRCDQLSFDVPDGFYSTSPIQSVELPVSIVSLPVYHKHT
FIVLYVDFKPQSGGGKCFNCYPAGVNITLANFNETKGPLCVDTSHFTTKYVAVYANVGRW
SASINTGNCPFSFGKVNNFVKFGSVCFSLKDIPGGCAMPIVANWAYSKYYTIGSLYVSWS
DGDGITGVPQPVEGVSSFMNVTLDKCTKYNIYDVSGVGVIRVSNDTFLNGITYTSTSGNL
LGFKDVTKGTIYSITPCNPPDQLVVYQQAVVGAMLSENFTSYGFSNVVELPKFFYASNGT
YNCTDAVLTYSSFGVCADGSIIAVQPRNVSYDSVSAIVTANLSIPSNWTTSVQVEYLQIT
STPIVVDCSTYVCNGNVRCVELLKQYTSACKTIEDALRNSARLESADVSEMLTFDKKAFT
LANVSSFGDYNLSSVIPSLPTSGSRVAGRSAIEDILFSKLVTSGLGTVDADYKKCTKGLS
IADLACAQYYNGIMVLPGVADAERMAMYTGSLIGGIALGGLTSAVSIPFSLAIQARLNYV
ALQTDVLQENQKILAASFNKAMTNIVDAFTGVNDAITQTSQALQTVATALNKIQDVVNQQ
GNSLNHLTSQLRQNFQAISSSIQAIYDRLDTIQADQQVDRLITGRLAALNVFVSHTLTKY
TEVRASRQLAQQKVNECVKSQSKRYGFCGNGTHIFSIVNAAPEGLVFLHTVLLPTQYKDV
EAWSGLCVDGTNGYVLRQPNLALYKEGNYYRITSRIMFEPRIPTMADFVQIENCNVTFVN
ISRSELQTIVPEYIDVNKTLQELSYKLPNYTVPDLVVEQYNQTILNLTSEISTLENKSAE
LNYTVQKLQTLIDNINSTLVDLKWLNRVETYIKWPWWVWLCISVVLIFVVSMLLLCCCST
GCCGFFSCFASSIRGCCESTKLPYYDVEKIHIQ
NT seq
3522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgttttgcttgttgcatatgccttgttgcatattgctggttgtcaaactacaaat
gggctgaacactagttactctgtttgcaacggctgtgttggttattcagaaaatgtattt
gctgttgagagtggtggttatataccctccgactttgcattcaataattggttccttcta
actaatacctcatctgttgtagatggtgttgtgaggagttttcagcctttgttgcttaat
tgcttatggtctgtttctggcttgcggtttactactggttttgtctattttaatggtact
gggagaggtgattgtaaaggtttttcctcagatgttttgtctgatgtcatacgttacaac
ctcaattttgaagaaaaccttagacgtggaaccattttgtttaaaacatcttatggtgtt
gttgtgttttattgtaccaacaacactttagtttcaggtgatgctcacataccatttggt
acagttttgggcaatttttattgctttgtaaatactactattggcaatgaaactacgtct
gcttttgtgggtgcactacctaagacagttcgtgagtttgttatttcacgcacaggacat
ttttatattaatggctatcgctatttcactttaggtaatgtagaagccgttaatttcaat
gtcactactgcagaaaccactgatttttgtactgttgcgttagcttcttatgctgacgtt
ttggttaatgtgtcacaaacctctattgctaatataatttattgcaactctgttattaac
agactgagatgtgaccagttgtcctttgatgtaccagatggtttttattctacaagccct
attcaatccgttgagctacctgtgtctattgtgtcgctacctgtttatcataaacatacg
tttattgtgttgtacgttgacttcaaacctcagagtggcggtggcaagtgctttaactgt
tatcctgctggtgttaatattacactggccaattttaatgaaactaaagggcctttgtgt
gttgacacatcacacttcactaccaaatacgttgctgtttatgccaatgttggtaggtgg
agtgctagtattaacacgggaaattgccctttttcttttggcaaagttaataactttgtt
aaatttggcagtgtatgtttttcgctaaaggatatacccggtggttgcgcaatgcctata
gtggctaattgggcttatagtaagtactatactataggctcattgtatgtttcttggagt
gatggtgatggaattactggcgtcccacaacctgttgagggtgttagttcctttatgaat
gttacattggacaaatgtactaaatataatatttatgatgtatctggtgtgggtgttatt
cgcgttagcaatgacacctttcttaatggaattacgtacacatcaacttcaggtaacctt
ctgggttttaaagatgttactaagggcaccatctactctatcactccttgtaacccacca
gatcagcttgttgtttatcagcaagctgttgttggtgctatgttgtctgaaaattttact
agttacggcttttctaatgttgtagaactgccgaaatttttctatgcgtccaatggcact
tataattgcacagacgctgttttaacttattctagttttggcgtttgtgcagatggttct
ataattgctgttcaaccacgtaatgtttcatatgatagtgtttcagctatcgtcacagct
aatttgtctataccttccaattggaccacttcggtccaggttgagtatttacaaattaca
agtacacctatcgtagttgattgctccacttatgtttgcaatggtaatgtgcgctgtgtt
gaattgcttaagcagtatacttctgcttgtaaaactattgaagacgccttaagaaatagc
gccaggctggagtctgcagatgttagtgagatgctcacttttgacaagaaagcgtttaca
cttgctaatgttagtagttttggtgactacaaccttagcagcgtcatacctagcttgccc
acaagtggtagtagagtggctggtcgcagtgccatagaagacatactttttagcaaactt
gttacttctggacttggcactgtggacgcagactacaaaaagtgcactaagggtctttcc
attgctgacttggcttgtgctcaatattataatggcattatggttttgcctggcgtcgct
gatgctgaacgaatggccatgtatacaggttctttaattggtggaattgctttaggaggt
ctaacatcagccgtttcaataccattttcattagcaattcaggcacgtttaaattatgtt
gcattgcagactgatgttttacaagaaaatcagaaaattcttgctgcatcttttaacaaa
gcaatgaccaacatagtagatgcctttactggtgttaatgatgctattacacaaacttca
caagccctacaaacagttgctactgcacttaacaagatccaggatgttgttaatcaacaa
ggcaactcattgaaccatttaacttctcagttgaggcagaattttcaagctatctctagc
tctattcaggctatctatgacagacttgacactattcaggctgatcaacaagtagatagg
ctgattactggtagattggctgctttgaatgtattcgtttctcatacattgactaagtac
actgaagttcgtgcttccagacagcttgcacaacaaaaagtgaatgagtgtgtcaaatcc
cagtctaagcgttatggcttctgtggaaatggcactcacattttctcaattgttaatgct
gctcctgaggggcttgtttttctccacactgtcttgttgccgacacaatataaggatgtt
gaagcgtggtctgggttgtgcgttgatggtacaaacggttatgtgttgcgacaacctaat
cttgctctttacaaagaaggcaattattatagaatcacatctcgcataatgtttgaacca
cgtattcctaccatggcagattttgttcaaattgaaaattgcaatgtcacatttgttaac
atttctcgctctgagttgcaaaccattgtgccagagtatattgatgttaataagacgctg
caagaattaagttacaaattgccaaattacactgttccagacctagttgtcgaacagtac
aaccagactattttgaatttgaccagtgaaattagcacccttgaaaataaatctgcggag
cttaattacactgttcaaaaattgcaaactctgattgacaacataaatagcacattagtc
gacttaaagtggctcaaccgggttgagacttacatcaagtggccgtggtgggtgtggttg
tgcatttcagtcgtgctcatctttgtggtgagtatgttgctattatgttgttgttctact
ggttgctgtggcttctttagttgttttgcatcttctattagaggttgttgtgaatcaact
aaacttccttattacgacgttgaaaagatccacatacagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
