Viruses: 921689
Help
Entry
921689 CDS
T40000
Symbol
S, BCoVgp04
Name
(RefSeq) Bovine coronavirus; spike structural protein
KO
K24325
Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
11128
Bovine coronavirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
HSBP1
DUF2959
DUF4351
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
921689
NCBI-ProteinID:
NP_150077
RS:
NC_003045
UniProt:
Q91A26
LinkDB
All DBs
Position
NC_003045:23641..27732
Genome browser
AA seq
1363 aa
AA seq
DB search
MFLILLISLPTAFAVIGDLKCTTVSINDVDTGVPSISTDTVDVTNGLGTYYVLDRVYLNT
TLLLNGYYPTSGSTYRNMALKGTLLLSTLWFKPPFLSDFTNGIFAKVKNTKVIKDGVMYS
EFPAITIGSTFVNTSYSVVVQPHTTILGNKLQGFLEISVCQYTMCEYPNTICNPNLGNQR
VELWHWDTGVVSCLYKRNFTYDVNADYLYFHFYQEGGTFYAYFTDTGVVTKFLFNVYLGT
VLSHYYVMPLTCNSALTLEYWVTPLTSKQYLLAFNQDGVIFNAVDCKSDFMSEIKCKTLS
IAPSTGVYELNGYTVQPIADVYRRIPNLPDCNIEAWLNDKSVPSPLNWERKTFSNCNFNM
SSLMSFIQAYSFTCNNIDAAKIYGMCFSSITIDKFAIPNGRKVDLQLGNLGYLQSFNYRI
DTTATSCQLYYNLPAANVSVSRFNPSTWNRRFGFTEQSVFKPQPAGVFTDHDVVYAQHCF
KASTNFCPCKLDGSLCVGNGPGIDAGYKTSGIGTCPAGTNYLTCHNAAQCDCLCTPDPIT
SKATGPYKCPQTKYLVGIGEHCSGLAIKSDHCGGNPCTCQPQAFLGWSVDSCLQGDRCNI
FANFILHDVNSGTTCSTDLQKSNTDIILGVCVNYDLYGITGQGIFVEVNATYYNSWQNLL
YDSNGNLYGFRDYLTNRTFMIRSCYSGRVSAAFHANSSEPALLFRNIKCNYVFNNTLSRQ
LQPINYFDSYLGCVVNADNSTSSVVQTCDLTVGSGYCVDYSTKRRSRRSITTGYRFTNFE
PFTVNSVNDSLEPVGGLYEIQIPSEFTIGNMEEFIQTSSPKVTIDCSAFVCGDYAACKSQ
LVEYGSFCDNINAILTEVNELLDTTQLQVANSLMNGVTLSTKLKDGVNFNVDDINFSPVL
GCLGSDCNKVSSRSAIEDLLFSKVKLSDVGFVEAYNNCTGGAEIRDLICVQSYNGIKVLP
PLLSENQISGYTLAATSASLFPPWSAAAGVPFYLNVQYRINGIGVTMDVLSQNQKLIANA
FNNALGAIQEGFDATNSALVKIQAVVNANAEALNNLLQQLSNRFGAISSSLQEILSRLDA
LEAQAQIDRLINGRLTALNAYVSQQLSDSTLVKFSAAQAMEKVNECVKSQSSRINFCGNG
NHIISLVQNAPYGLYFIHFSYVPTKYVTAKVSPGLCIAGDRGIAPKSGYFVNVNNTWMFT
GSGYYYPEPITGNNVVVMSTCAVNYTKAPDVMLNISTPNLPYFKEELDQWFKNQTSVAPD
LSLDYINVTFLDLQDEMNRLQEAIKVLNQSYINLKDIGTYEYYVKWPWYVWLLIGFAGVA
MLVLLFFICCCTGCGTSCFKKCGGCCDDYTGHQELVIKTSHED
NT seq
4092 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttttgatacttttaatttccttaccaacggcttttgctgttataggagatttaaag
tgtactacagtttccattaatgatgttgacactggtgttccttctattagcactgatact
gtcgatgttactaatggtttaggtacttattatgttttagatcgtgtgtatttaaatact
acgttgttgcttaatggttactaccctacttcaggttctacatatcgtaatatggcactg
aagggaactttactattgagcacactgtggtttaaaccaccttttctttctgattttact
aatggtatttttgctaaggtcaaaaataccaaggttattaaagatggtgtaatgtatagt
gagtttcctgctataactataggtagtacttttgtaaatacatcttatagtgtggtagta
caaccacatactaccattttgggtaataaattacaaggtttcttagagatctctgtttgc
cagtatactatgtgcgagtacccaaatacgatttgtaatcctaatctgggtaatcaacgc
gtagaactatggcattgggatacaggtgttgtttcctgtttatataagcgtaatttcaca
tacgatgtgaatgctgattatttgtatttccatttttatcaagaaggtggtactttttat
gcatattttacagacactggtgttgttactaagtttctgtttaatgtttatttaggcacg
gtgctctcacattattatgtcatgcctttgacttgtaatagtgctctgactttagaatat
tgggttacacccctcacttctaaacaatatctactagctttcaatcaagatggtgttatt
tttaatgctgttgattgtaagagtgattttatgagtgagattaagtgtaaaacactatct
atagcaccatctactggtgtttatgaattaaacggttacactgttcagccaattgcagat
gtttaccgacgtatacctaatcttcccgattgcaatattgaggcttggcttaatgataag
tcggtgccctctccattaaattgggaacgtaagaccttttcaaattgtaattttaatatg
agcagcctgatgtcttttattcaggcatactcatttacttgtaataatattgatgctgct
aagatatatggtatgtgtttttccagcataactatagataagtttgcaatacccaatggt
aggaaggttgacctacaattgggtaatttgggctatttgcagtcttttaattatagaatt
gatactactgctacaagttgtcagttgtattataatttacctgctgctaatgtttctgtt
agcaggtttaatccttctacttggaataggagatttggttttacagaacaatctgttttt
aagcctcaacctgcaggtgtttttactgatcatgatgttgtttatgcacaacattgtttt
aaagcttccacaaatttctgtccgtgtaaattggatgggtctttgtgtgtaggtaatggt
cctggtatagatgctggttataaaactagtggcataggcacttgtcctgcaggtactaat
tatttaacttgccataatgctgcccaatgtgattgtttgtgcaccccagaccccattaca
tctaaagctacagggccttacaagtgcccccaaactaaatatttagttggcataggtgag
cactgttcgggtcttgctattaaaagtgatcattgtggaggtaatccttgtacttgccaa
ccacaagcatttttgggttggtctgttgactcttgtttacaaggggataggtgtaatatt
tttgctaattttattttgcatgatgttaatagtggtactacttgttctactgatttacaa
aaatcaaacacagacataattcttggtgtttgtgttaattatgatctttatggtattact
ggccaaggtatttttgttgaggttaatgcgacttattataatagttggcagaacctttta
tatgattctaatggtaatctctatggttttagagactacttaacaaatagaacttttatg
attcgtagttgctatagtggtcgtgtttcagcggcctttcatgctaactcttccgaacca
gcattgctatttcggaatatcaaatgcaattacgtttttaataacactctttcacgacag
ctgcaacctattaactattttgatagctatcttggttgtgttgtcaatgctgataatagt
acttctagtgttgttcaaacatgtgatctcacagtaggtagtggttactgtgtggattac
tctacaaaaagacgaagtcgtagatcgattaccactggttatcggtttactaattttgag
ccatttactgttaattcagtaaatgatagtttagaacctgtaggtggtttgtatgaaatt
caaataccttcagagtttactataggtaatatggaggagtttattcaaacaagctctcct
aaagttactattgattgttctgcttttgtctgtggtgattatgcagcatgtaaatcacag
ttggttgaatatggtagcttctgtgacaatattaatgctatactcacagaagtaaatgaa
ctacttgacactacacagttgcaagtagctaatagtttaatgaatggtgtcactcttagc
actaagcttaaagatggcgttaatttcaatgtagacgacatcaatttttcccctgtatta
ggttgtttaggaagcgattgcaataaagtttccagtagatctgctatagaggacttactt
ttttctaaagtaaagttatctgatgtcggtttcgttgaggcttataataattgtactgga
ggtgccgaaattagggacctcatttgtgtgcaaagttataatggtatcaaggtgttgcct
ccactgctctcggaaaatcagatcagtggatacactttggctgccacttctgctagcctg
tttcctccatggtcagcagcagcaggtgtaccattctatttaaacgttcagtatcgtatt
aatggtattggtgttaccatggatgtgttaagtcaaaatcaaaagcttattgctaatgca
tttaacaatgctcttggtgctattcaggaagggtttgatgctaccaattctgctttagtt
aaaattcaagctgttgttaatgcaaatgctgaagctcttaataacttattgcaacaactc
tctaatagatttggtgctataagttcttctttacaagaaattctatctagactggatgct
cttgaagcgcaagctcagatagacagacttattaatgggcgtcttaccgctcttaatgct
tatgtttctcaacagcttagtgactctacactagtaaagtttagtgcagcacaagctatg
gagaaggttaatgaatgtgtcaaaagccaatcatctaggataaatttttgtggtaatggt
aatcatattatatcattagtgcagaatgctccatatggtttgtattttatccactttagc
tatgtccctactaagtatgtcactgcgaaggttagtcccggcctgtgcattgctggtgat
agaggtatagcccctaagagtggttattttgttaatgtaaataatacttggatgttcact
ggtagtggttattactaccctgaacctataactggaaataatgttgttgttatgagtacc
tgtgctgttaattatactaaagcgccggatgtaatgctgaacatttcaacacccaacctc
ccttattttaaggaagagttggatcaatggtttaaaaaccaaacatcagtggcaccagat
ttgtcacttgattatataaatgttacattcttggacctacaagatgaaatgaataggtta
caggaggcaataaaagttttaaatcagagctacatcaatctcaaggacattggtacatat
gagtattatgtaaaatggccttggtatgtatggcttttaattggctttgctggtgtagct
atgcttgttttactattcttcatatgctgttgtacaggatgtgggactagttgttttaag
aaatgtggtggttgttgtgatgattatactggacaccaggagttagtaattaaaacatca
catgaagactaa
DBGET
integrated database retrieval system
