Viruses: 935184
Help
Entry
935184 CDS
T40000
Symbol
PEDVgp2
Name
(RefSeq) Porcine epidemic diarrhea virus; spike protein
KO
K19254
Coronaviridae (excluding betacoronavirus) spike glycoprotein
Virus
28295
Porcine epidemic diarrhea virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
CoV_S1
CoV_S1_C
CoV_S2_C
Prominin
Baculo_F
Phasin
Pox_EPC_I2-L1
DUF2959
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
935184
NCBI-ProteinID:
NP_598310
RS:
NC_003436
UniProt:
Q91AV1
A0A2N8Z1W1
Structure
PDB
LinkDB
All DBs
Position
NC_003436:20638..24789
Genome browser
AA seq
1383 aa
AA seq
DB search
MRSLIYFWLLLPVLPTLSLPQDVTRCQSTTNFRRFFSKFNVQAPAVVVLGGYLPSMNSSS
WYCGTGIETASGVHGIFLSYIDSGQGFEIGISQEPFDPSGYQLYLHKATNGNTNAIARLR
ICQFPDNKTLGPTVNDVTTGRNCLFNKAIPAYMRDGKDIVVGITWDNDRVTVFADKIYHF
YLKNDWSRVATRCYNRRSCAMQYVYTPTYYMLNVTSAGEDGIYYEPCTANCTGYAANVFA
TDSNGHIPEGFSFNNWFLLSNDSTLLHGKVVSNQPLLVNCLLAIPKIYGLGQFFSFNHTM
DGVCNGAAVDRAPEALRFNINDTSVILAEGSIVLHTALGTNLSFVCSNSSDPHLAIFAIP
LGATEVPYYCFLKVDTYNSTVYKFLAVLPPTVREIVITKYGDVYVNGFGYLHLGLLDAVT
INFTGHGTDDDVSGFWTIASTNFVDALIEVQGTSIQRILYCDDPVSQLKCSQVAFDLDDG
FYPISSRNLLSHEQPISFVTLPSFNDHSFVNITVSAAFGGLSSANLVASDTTINGFSSFC
VDTRQFTITLFYNVTNSYGYVSKSQDSNCPFTLQSVNDYLSFSKFCVSTSLLAGACTIDL
FGYPAFGSGVKLTSLYFQFTKGELITGTPKPLEGITDVSFMTLDVCTKYTIYGFKGEGII
TLTNSSILAGVYYTSDSGQLLAFKNVTSGAVYSVTPCSFSEQAAYVNDDIVGVISSLSNS
TFNNTRELPGFFYHSNDGSNCTEPVLVYSNIGVCKSGSIGYVPSQYGQVKIAPTVTGNIS
IPTNFSMSIRTEYLQLYNTPVSVDCATYVCNGNSRCKQLLTQYTAACKTIESALQLSARL
ESVEVNSMLTISEEALQLATISSFNGDGYNFTNVLGASVYDPASGRVVQKRSVIEDLLFN
KVVTNGLGTVDEDYKRCSNGRSVADLVCAQYYSGVMVLPGVVDAEKLHMYSASLIGGMAL
GGITAAAALPFSYAVQARLNYLALQTDVLQRNQQLLAESFNSAIGNITSAFESVKEAISQ
TSKGLNTVAHALTKVQEVVNSQGSALNQLTVQLQHNFQAISSSIDDIYSRLDILSADVQV
DRLITGRLSALNAFVAQTLTKYTEVQASRKLAQQKVNECVKSQSQRYGFCGGDGEHIFSL
VQAAPQGLLFLHTVLVPGDFVNVLAIAGLCVNGEIALTLREPGLVLFTHELQTYTATEYF
VSSRRMFEPRKPTVSDFVQIESCVVTYVNLTSDQLPDVIPDYIDVNKTLDEILASLPNRT
GPSLPLDVFNATYLNLTGEIADLEQRSESLRNTTEELRSLINNINNTLVDLEWLNRVETY
IKWPWWVWLIIVIVLIFVVSLLVFCCISTGCCGCCGCCGACFSGCCRGPRLQPYEAFEKV
HVQ
NT seq
4152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtctttaatttacttctggttgctcttaccagtacttccaacactcagcctacca
caagatgtcactaggtgccagtctactactaactttaggcggttcttttcaaaatttaat
gttcaggcacctgccgtcgtcgttttgggtggttacctacctagtatgaactcttctagc
tggtactgtggcacaggcattgaaactgctagtggcgttcatggtatttttctcagctac
atcgattctggtcagggctttgagattggcatttcgcaagagccgtttgatcctagtggt
taccagctttatttacataaggccactaatggtaacactaatgctattgcacgactgcgc
atttgccagtttcccgataataaaacattgggccctactgttaatgatgttacaacaggt
cgtaactgcctattcaacaaagccattccagcttatatgcgtgatggaaaagatattgtt
gtcggcataacatgggataatgatcgtgtcactgtttttgctgacaagatctatcatttt
tatcttaaaaatgattggtcccgcgttgcgacaagatgttacaatcgcagaagttgtgct
atgcaatatgtttatacacctacctactacatgcttaatgttactagtgcaggtgaggat
ggcatttattatgaaccctgtacagctaattgcactggttacgctgccaatgtatttgcc
actgattccaatggccatataccagaaggttttagttttaataattggtttcttttatcc
aatgactccactttgttgcatggtaaagtggtttccaaccaacccttgttggtcaattgt
cttttggccattcctaagatttatggactaggccaatttttctcattcaatcacacgatg
gatggcgtttgtaatggagctgctgtggatcgtgccccagaggctctgaggtttaatatt
aatgacacctccgtcattcttgctgaaggctcaattgtacttcatactgctttaggaaca
aatctttcttttgtttgcagtaattcctcagatcctcatttagccatctttgccatacct
ctgggtgctactgaagtaccctactattgctttcttaaagtggatacttacaactccact
gtttataaattcttggctgttttacctcctactgtcagggaaattgtcatcaccaagtat
ggtgatgtttatgtcaatgggtttggctatttgcatctcggtttgttggatgctgtcaca
attaatttcactggtcatggcactgacgatgacgtttcaggtttctggaccatagcatcg
actaattttgttgatgcactcatcgaggttcaaggaacttccattcagcgtattctttat
tgtgatgatcctgttagccaactcaagtgttctcaggttgcttttgaccttgacgatggt
ttttaccccatctcttctagaaaccttctgagtcacgaacagccaatttcttttgttact
ttgccatcatttaatgatcattcttttgttaatattactgtctctgcggcttttggtggt
cttagtagtgccaatctcgttgcatctgacactactatcaatgggtttagttctttctgt
gttgacactagacaatttaccattacactgttttataatgttacaaacagttatggttat
gtgtctaaatcacaggatagtaattgtcctttcaccttgcaatctgttaatgattacctg
tcttttagcaaattttgtgtttcaaccagccttttggctggtgcttgtaccatagatctt
tttggttaccctgcgttcggtagtggtgttaagttgacgtccctttattttcaattcaca
aaaggtgagttgattactggcacgcctaaaccacttgaaggtatcacagacgtttctttt
atgactctggatgtgtgtaccaagtatactatctatggctttaaaggtgagggtattatt
acccttacaaattctagcattttggcaggtgtttattatacatctgattctggacagttg
ttagcctttaagaatgtcactagtggtgctgtttattctgtcacgccatgttctttttca
gagcaggctgcatatgttaatgatgatatagtgggtgttatttctagtttgtctaactcc
acttttaacaatactagggagttgcctggtttcttctaccattctaatgacggctccaat
tgtacagagcctgtgttggtgtatagtaacataggtgtttgtaaatctggcagtattggc
tatgttccatctcagtatggccaagtcaagattgcacccacggttactgggaatattagt
attcccaccaactttagtatgagtattagaacagaatatttacagctttacaacacgcct
gttagtgttgattgtgctacatatgtttgtaatggtaactctcgttgtaaacaattactc
acccagtacactgcagcatgtaagaccatagagtcagcattacaactcagcgctaggctt
gagtctgttgaagttaactctatgcttaccatttctgaagaggctttacagttagctacc
atcagttcgtttaatggtgatggatataactttactaatgtgctgggtgcttccgtgtac
gatcctgcaagtggcagggtggtacaaaaaaggtctgttattgaagacttgctttttaat
aaagtggttactaatggccttggtactgttgatgaagactataagcgctgttctaatggt
cgctctgtggctgatctagtctgtgcgcagtattactctggtgtcatggtactacctggc
gttgttgacgctgagaagcttcacatgtacagtgcgtctctcataggtggtatggcgcta
ggaggtataactgctgcagcggcattgccttttagctatgctgttcaagcgagactcaat
tatcttgctttacagacggatgttctacagcggaaccagcaattgcttgctgagtctttt
aactctgctattggtaatataacttcagcctttgagagtgttaaagaggctattagtcaa
acttccaagggtttgaacactgtggctcatgcgcttactaaggttcaagaggttgttaat
tcgcagggttcagctttgaaccaacttaccgtacagctgcaacacaacttccaagccatt
tctagttctattgatgacatttattcccgactggacattctttcagccgatgttcaggtt
gatcgtctcatcaccggcagattatcagcacttaatgcttttgttgcccaaaccctcact
aagtatactgaggttcaggctagcaggaagctagcacagcaaaaggttaatgagtgcgtc
aaatcgcaatctcagcgttacggtttttgtggtggtgatggcgagcacattttctctctg
gtacaggccgcacctcagggcctgctgttcttacatacagtacttgtaccgggtgatttt
gtaaatgttcttgccatcgctggcttatgcgttaatggtgaaattgccttgactctacgt
gagcctggcttagtcttgtttacgcatgaacttcaaacttatactgcgacggaatatttt
gtttcatcgcgacgtatgtttgaacctagaaaacctaccgttagtgattttgttcaaatt
gagagttgtgtggtcacctatgtcaatctgactagcgaccagctaccagatgtaatccca
gattacatcgatgttaacaaaacacttgatgagattttagcttctctgcccaatagaact
ggtccaagtcttcccctagatgtttttaatgccacttatcttaatcttactggtgaaatt
gcagatctagagcagcgttcagagtctctccgtaatactacagaagagctccgaagtctc
attaacaacatcaacaacacacttgttgaccttgagtggctcaaccgagttgagacatac
atcaagtggccgtggtgggtttggttgatcattgttattgttctcatctttgttgtgtca
ttactagtgttctgctgcatttccacgggttgttgtggatgctgcggttgctgcggtgct
tgtttttcaggttgttgtaggggtcctagacttcaaccttacgaagcttttgaaaaggtc
cacgtgcagtga
DBGET
integrated database retrieval system