KEGG   Wolbachia endosymbiont of Corcyra cephalonica: LOK48_04725
Entry
LOK48_04725       CDS       T07919                                 
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta/beta'
  KO
K13797  DNA-directed RNA polymerase subunit beta-beta' [EC:2.7.7.6]
Organism
wee  Wolbachia endosymbiont of Corcyra cephalonica
Pathway
wee03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:wee00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    LOK48_04725
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:wee03021]
    LOK48_04725
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:wee03400]
    LOK48_04725
Enzymes [BR:wee01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     LOK48_04725
Transcription machinery [BR:wee03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Core subunits
     LOK48_04725
DNA repair and recombination proteins [BR:wee03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
      LOK48_04725
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb2_6 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb2_3 RNA_pol_Rpb2_7 RNA_pol_Rpb2_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb2_45 RNA_pol_Rpb1_4 RNA_pol_Rpb2_1 RPOC_hybrid Biotin_lipoyl_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: UFO00076
LinkDB
Position
961842..970361
AA seq 2839 aa
MVDSSYMCASSAFVPRVSYSRSIDLKDSLLDLVKVQKGSYNSFTPNNESNERLEAIFHTI
FPISDPLHRATIEFLNCRVDDLKYSESECIKRGITFSAQVIASIRLVIMQDGVSLEKYQE
IKEDDDHSKLATVIKSAEEQEVRFCELPMMTDKGTFIINGVEKVIVSQMHRSPGVFFDSD
RGKTYNSGKLIYSARVIPYRGSWLDIEFDVKDHLYFRIDRKRKLPISVLLKALGLSNNDI
LNKFYEKIEYIKHKSGWRVPFSPDKFKGVRLPFDLKNVEGNVLLKANVRITSKLAKNLYD
NGLKEYLIPYDSICGLFLAEDLIDSASSTKVLSAGESIKLEDIKKLELLSIDKISVLNID
NVSVGPYILNTLFLDENMSYENALYEIYKVLRPGEVPVLKIVEEFFRNLFFSSEYYDLSN
IGRLKLNSCLGLNYEENLTTLTHEDIIEIIRKIVLLRDGQGSVDDIDHLANRRVRSVGEF
IENQFRTGLLKLGRAVVDSMSTSSLDKVSPSDFINPKVLTNVLRDFFNSSQLSQFMDQTN
PLSEITHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRICPIETPEGQNIGLINSLAIYA
RINKYGFIESPYRKVVNKVVTDQIEYLSAIDEGLYYIADTSAKLDENNCFVDDMLYCRYA
GTFVMVNSNQVSYIDLSPKQVISVAASLIPFLENDDANRALMGSNMQRQAVPLLKPTAPL
VATGMESFVASGSGAVVLAKRGGIVDSSDSNSIVIRAFDKGGINYLDVDIYHLRKFQRSN
HNTCINQKPLVHVGDCVKEGDVIADGPAINNGELALGQNLLVAFMSWQGYNFEDSIIISS
EVVKKDLFTSIHIEEFECVVHDTPLGSEKITRAIPGVNEENLYHLDDSGIVKVGTRVGPG
YILVGKVTPKHSLSLPPETKLLMTIFGEKSFDCVDSSLYTSPDIEGIVIDVQVFTRRGEE
ENERAFLIKQKEANDFEKERDHIINVINQYFYDELRKILINSGSQDRESINFIEREGWWD
IGLKNQSISKQVESLKKDFDEKVSHAIANFKRKVEKLHEGYDLPQGVSMSVKVFIAVKHS
LQPGDKMAGRHGNKGVISRVVPVEDMPYLEDGTPIDIILNPLGVPSRMNVGQILETHVGW
ACKKLGEKVGNILDEINKIKRAFCEAIRSLSDDDFEKFAALYLDNKKFEDINDDEITASI
LDTPNKDELNNELTTLVENYFNSCKDAHSSLRHFLIEVYSCGSNLSICNNIRDINDNHLI
EFAYKLRDGIPVTAPVFEGPKDEQIVKLFELAGLDNSGQVVLYDGCSGEKFDRKVTVGYM
YMLKLHHLVDGKIHARSVGPYSLVTQQPLGGKSHFGGQRFGEMECWALQAYGAAYTLQEM
LTVKSDDINGRVKIYESVIKGDSNFECGIPESFNVMIKELRSLCFNVDLKQNDIVIEDIS
HTNIAQSFNEVSISIASPESIKRMSYGEITDVSTANYRTFKVEKGGLFCPKIFGPVNDDE
CLCGKYKKRRHRGRICEKCGVEVTSSKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGALLD
MSLRDIESILYSDNYVVIDPLVSSFEKGEIISEKAYNEAKDSYGVDSFIAMQGVEAIREL
LIRLDLHEIRKNLRQELESVASEMRRKKIIKRLRIVENFIKSGNRPEWMILTAIPILPPD
LRPLVSLESGRPAVSDLNHHYRTIINRNNRLRKLLSLNPPEIMIRNEKRMLQEAVDSLFD
NSRRNALVNKAGATGYKKSISDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPTLKLNQCG
LPKRMALELFKPFVYSRLKIYGMAPTIKFASKLIRAEKPEVWDMLEEVIKEHPVLLNRAP
TLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAFNADFDGDQMAVHVPISLEAQLEARVLMMSI
NNVLSPSNGRPIIVPSKDIVLGIYYLTLQQLKKDDLPLFCAFCEVEHSLNNGTLHIHSHI
KYKMEHINSDGNIQYKTICTTPGRLILWQIFPKHENLSFDLINQVLTVKEITSIVDLVYR
SCGQSATVVFSDKLMTLGFEYATFSGTSFSRCDMVIPETKATHVDYTRGEIKKFSAQYQD
GLITKSERYNKVIDEWSKCTDIIANDMLKAISLYDENSKYNSIYMMVSSGARGSTSQMKQ
LAGMRGLMTKPSGEIIETPIISNFREGLNVFEYFNSTHGARKGLADTALKTANSGYLTRR
LVDVSQNCIVTKHDCKTKNGLIVRAIVEGSTIVASLESVVLGRTAANDIYNPVTKELLLK
AGELIDEGKVKQINIAGLDVIKIRSPLTCEISPGVCSLCYGRDLATGKIVSIGEAVGVIA
AQSVGEPGTQLTMRTFHIGGVMTRGVESSNIIASINARIKLNNSNIIIDKNGNKIVISRS
CEVVLIDSLGSEKLKHSVPYGAKLYVNEGELVKIGDKVAEWDPYTLPIITEKSGTISYQD
LKDGISITEVMDESTGISNRVVKDWKLYSGVANLRPRIALLDDNEKVITLSSGVEACYFI
PVGAVLNVQDGQKVHAGDVITRTPRESVRTRDITGGLPKVIELFEARRPKEHAIVSEIDG
YVMFSEKDRRGKRSIVIKPVDKQASPVEYLVSRSKHVIVNEGDFVRKGDLLMDGDPDLHD
ILRVLGLEALAHYMISEIQQVYRLQGVRIDNKHLEVILKQMLQKVEITDPGDTMYLIGEN
IDRLEIDRENDAMNNSGKRPAHYLPILQGITRASLETNSFISAASFQETTKVLTEAAFCG
KSDPLSGLKENVIVGRLIPAGTGLIMNKVKALSLCENIDKYEKYFDIETYDEKLLSDNSY
QLHSDEEESVVASHYDQSN
NT seq 8520 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggttgattcttcttatatgtgtgcttctagtgcttttgttcctagagtttcttattcc
aggtcgattgatttaaaagattctttgttggatttggttaaagtccaaaaggggtcatat
aattcctttactcctaataatgagagtaatgaaagacttgaagctatctttcatacaatt
tttccaatatctgatcctttgcatagggctactatcgaatttttgaattgtagggtagat
gatcttaagtatagtgaatctgaatgtataaaacgtggtataactttttctgctcaggtt
attgcttctatacgtcttgttattatgcaggatggtgtttctcttgaaaaatatcaagag
attaaagaagatgatgatcattctaagcttgcaactgttataaaatctgctgaagagcag
gaggttcgcttttgtgaactgcctatgatgactgataaaggtactttcatcatcaatggc
gtagagaaagttatcgtttcacaaatgcatagatctcctggagtgttttttgatagtgat
aggggaaaaacttacaattctggcaaattgatctattctgctagagttattccttataga
ggttcttggcttgatattgagtttgatgttaaagatcatttgtattttcgtattgataga
aagagaaagttgccaatatcagttttattaaaggctttgggcttatcaaataatgacata
cttaataaattttatgaaaaaatagagtatataaaacataaaagtggctggagagtacct
ttttcccctgataaattcaagggagtgaggcttccttttgatttaaagaatgttgaaggc
aatgtgttacttaaagccaatgttcgtattacttcaaaattagctaaaaatctatatgat
aacggattgaaagagtatctaattccttatgattctatatgtggtttatttcttgcagaa
gatttaatagatagtgctagttctacaaaagtcttatctgctggtgaatctataaaatta
gaggatataaaaaagcttgaattattatctatagataaaatatcagtgttgaacatagat
aatgtttctgttggaccttacatattaaacacacttttcttagatgaaaacatgtcttat
gagaacgctctatatgaaatatataaggttttgcgtcctggtgaagttcctgttttaaag
atagtagaggagttttttcgtaatcttttcttcagttcggaatattatgatttgtctaac
attggtagattaaaacttaactcttgccttgggttaaattatgaggaaaatttaactact
ttaacacatgaagacattattgaaattataagaaaaatagtattgttacgtgatggtcaa
ggatctgtagatgatattgatcatttagcaaatagaagagtccgttcagttggagagttt
atagaaaatcaatttagaactggattattaaaattgggacgggcagtagttgattctatg
tctacttctagtttagataaagtctctccatctgattttataaatccaaaagtgttaacc
aatgtcttaagagattttttcaactcttcccaattatctcaatttatggatcagactaat
ccattatctgaaataacacataaaagaaggttgtcagcgttaggtcctggtggtttaaca
agagagagggcgggatttgaagtgcgtgatgttcatccaactcattacggaagaatttgc
cctattgaaactcctgaggggcagaatataggcttaattaatagcttagctatatacgct
cgtattaataaatatgggttcattgaaagtccttataggaaagtagttaataaggttgtt
actgatcaaattgagtatctgtctgctatagatgaaggtttatattatatagccgatacc
agcgcaaagcttgatgagaacaactgctttgttgatgatatgttatactgtaggtatgct
ggtacctttgtaatggtaaatagtaatcaagtaagttacattgatttatctcctaagcag
gtaatatcggttgctgcttctttaattccatttttagaaaatgatgatgctaatagagcg
ttaatgggttcaaatatgcagcgtcaagctgtacctttattgaagcctactgctcctttg
gttgctactggcatggaatctttcgtagcttctggctctggtgctgtagttttagcaaaa
cgtggtggcatagttgacagctcagatagtaactctatagttatacgtgcttttgacaaa
ggaggaattaactacttggatgtagatatttatcatctaagaaaatttcagcgttctaac
cataatacttgtattaaccagaaaccactggtgcatgtaggtgattgtgttaaggaaggt
gatgtgatagctgatggtcctgctattaataacggtgaattggcacttggccaaaacttg
ctagtcgcttttatgtcttggcaaggttataattttgaagactcaatcattatttctagt
gaagttgttaaaaaagatctatttacttctattcatatagaagaatttgaatgtgttgta
catgacactcctttagggtcggaaaaaataactcgtgccatacccggtgttaatgaagaa
aatctttatcacttggatgatagtggtatagtaaaggttggtacaagagttggtccaggt
tatattttggtggggaaagttacacctaagcattctctttcattgcctcctgagacaaaa
ttgttaatgacaatttttggtgaaaagtcatttgattgtgtggattcctctttatataca
tctccagatattgaagggatagtgattgatgtgcaggtctttacacgcagaggggaagaa
gaaaacgaaagggcgtttcttattaaacaaaaagaggcaaacgactttgagaaagaacga
gaccatataatcaatgttattaatcaatatttctatgatgaattaagaaaaattcttatt
aattctggctctcaagatcgagaaagtattaattttattgaacgtgagggatggtgggat
ataggattgaaaaaccaatctatttctaagcaagttgagagcttaaaaaaagattttgat
gaaaaagtatcacatgcgatagcaaactttaagcgaaaagtagaaaaattgcatgaaggc
tatgatctgcctcaaggtgtgtcgatgtcagtaaaagtttttattgctgtaaaacatagt
ttgcagccaggggataaaatggctggtagacatggaaataaaggtgtgatttctcgagtt
gttccagtagaagatatgccttatttagaagatggtactcctattgatattattcttaac
cctcttggcgttccttcgcgaatgaatgtaggtcaaatattggaaacgcatgtaggttgg
gcttgtaaaaaattaggagaaaaagtaggcaatattcttgatgagatcaataaaatcaaa
cgtgctttttgtgaggcaattagatctctcagtgatgatgattttgaaaaatttgcagca
ttatatcttgataataaaaaatttgaggatattaatgatgatgaaataacggcttctatt
ttagatacgcctaataaggatgaattaaataatgaattgactacattagtagagaattat
ttcaactcttgtaaagatgcacacagtagtttacgtcacttcctgattgaggtttatagt
tgtggcagtaatttatctatttgtaataacattcgcgatattaatgataatcacctcatt
gaatttgcgtataagttgcgtgatggcattcctgttactgcacctgtatttgaaggtcca
aaagatgaacaaatagtaaagctatttgaacttgctggattggataactctgggcaagtt
gtattatatgatggttgctcgggtgagaagtttgatcgcaaagttacagttggttacatg
tacatgcttaagttgcatcacttagtagatggtaaaattcatgcgcgttcagtaggacct
tatagcttagttactcaacaacctcttggaggaaagtctcattttggtggtcagcgtttt
ggtgaaatggaatgttgggcattgcaagcctatggtgctgcttacactttgcaggaaatg
ttaactgtgaagtctgatgatattaatggcagggttaagatttatgaatcggtaataaaa
ggtgacagtaactttgaatgtggaattcctgaatcctttaatgtcatgataaaagagttg
cgttccttgtgttttaatgtggatttgaagcaaaatgacatagtaattgaagatatatct
catactaacatcgcgcaatcttttaatgaggttagcatttccattgctagccctgaaagt
attaaacgtatgtcttatggagagataacagatgtttcaactgcaaactaccgtacattc
aaagttgagaaaggtggattattttgtcctaaaatttttggtcctgtcaatgatgatgaa
tgtttatgtggaaagtacaaaaaaagaagacataggggccgtatatgcgaaaaatgtgga
gtagaagttacatcttctaaagtaagaagagaaagaatgggtcatatagagcttgcatct
cctgttgctcatatatggtttttgaagtcacttccttcaagaattggagcattattagat
atgtctcttagagatatcgaaagtattttgtatagtgataattatgttgtaatagatcct
cttgtttcctcttttgaaaaaggtgaaattattagtgagaaagcttataatgaagctaaa
gatagctatggggtcgatagctttatagctatgcaaggtgttgaagctataagagaattg
ctaatacgccttgatttacatgaaattaggaagaatttaagacaggagttagagtctgtt
gcttctgaaatgagaagaaagaaaattataaagagattacgtattgttgaaaattttatc
aagtctggaaacagacctgagtggatgatacttacagctatacctattttaccacctgac
ttgcgtcccttggtatcgcttgaaagtggtcgacctgcagtttctgatttaaatcatcat
tatagaactattattaatcgaaataatagattgagaaaattgttaagtttaaatcctcct
gagattatgattcgtaatgagaaaagaatgttacaagaggcagttgattctctttttgat
aatagtcgtcgtaatgctctggtaaataaagctggcgctactggatataaaaagtctatt
agcgatatgctgaaaggaaagcaaggtcgtttccgtcagaatcttttaggaaaaagggta
gattattctggacgttctgtaatagttgttggtccaactttgaaactaaatcagtgtgga
ttaccgaaaagaatggctcttgagctattcaagccttttgtttactcaaggcttaaaata
tatggaatggctccaactattaaatttgctagtaagttaataagagcagaaaagccagaa
gtttgggatatgcttgaagaagtaataaaagagcatcctgttttgctaaatagagcgcct
acgctacataggcttggtattcaggcttttgagccagtccttattgaaggtaaagcaata
cagcttcatccacttgtttgtacagcatttaacgctgactttgatggtgatcaaatggca
gtacatgtgccaatttcattggaagctcaacttgaagctagagtgttgatgatgtcaatt
aataacgttttaagtccttctaatggaagaccgattatagttcctagtaaagatatagtg
cttggtatatactacctaactttacagcaacttaagaaggatgatttaccacttttttgt
gctttttgtgaagttgagcattccttaaacaacggtactctgcatattcattctcatata
aagtacaaaatggaacacatcaatagcgatggaaacattcagtataaaactatttgtaca
actcctggacgtttaatattatggcagatttttcctaaacatgagaatctaagcttcgat
ttaataaatcaggtattaacagttaaggaaataactagtattgttgatttagtatatcgt
agctgcggtcaaagtgctacagtggtattttctgataaattgatgacacttggctttgag
tatgctacattttctggtacttcttttagtcgttgcgatatggtcatacctgaaactaaa
gctacacacgttgattatacaaggggtgaaattaagaaattttctgcacagtatcaagac
ggactaatcactaaaagtgagaggtataataaagttatagatgagtggtctaagtgcaca
gatataatagcgaatgatatgttaaaagcgatatctctgtatgatgaaaatagtaagtac
aattcaatatatatgatggttagctccggtgcaagaggttctacttcccagatgaagcag
ttagcaggaatgcgagggttaatgaccaaaccttctggtgaaattatagaaacacctata
atttctaattttcgcgaaggattaaatgtatttgaatactttaattctactcacggtgcg
cgtaaaggtttagctgatactgcacttaaaactgcaaactctggatacttaactcgtcgc
ttggttgatgtatctcaaaattgcatagttacaaaacatgactgtaaaacgaaaaatggc
cttattgtaagagctatagttgaaggtagtactatagttgcatctctagagagtgttgta
ctgggtagaacagctgcaaatgatatatataacccagtaaccaaagagttattattaaaa
gcaggggaactaattgatgaaggtaaagtaaagcaaatcaacattgcaggtcttgatgtt
ataaaaattagatcgcctttaacttgtgaaataagtcctggtgtgtgttctttgtgttat
ggaagagaccttgcaactggtaaaattgtttcaataggtgaagcagttggtgttatcgct
gctcaatctgttggagagccaggtactcagttaacgatgcgtactttccatataggtggg
gtaatgactagaggtgttgaatcctcaaatattatagcttctattaatgctagaataaaa
ttaaacaatagtaatataattatagataaaaacggaaataaaattgtgataagccgttcc
tgtgaagtcgttttaattgatagccttggtagtgaaaaattgaagcacagtgtgccttat
ggtgctaaactttatgtaaatgagggtgagttagtaaaaattggtgataaagttgcggaa
tgggatccgtatacactacctattattacggaaaagagtggtacaatatcttaccaggat
ttaaaagatggaatttcaatcactgaagtgatggatgaatctacagggatatcaaataga
gtagtaaaagattggaaattgtactctggtgtagctaatttacgtcctcgtattgcactg
cttgatgataatgaaaaagtaataacactttcaagtggtgtggaagcatgttactttata
ccagttggtgcagtgcttaatgtacaggatggccaaaaggttcatgcaggtgatgttatc
acaagaacgccgagagagtcggttagaactcgtgatattactggtggcttgcctaaggtt
atagaattatttgaagcacgtcgtcctaaagagcatgctatcgttagtgaaatagatggc
tatgtaatgttctctgaaaaagaccgtagaggaaaacgcagtatagtaattaaacctgta
gataagcaagcttctccagttgagtatttagtatcaagaagtaagcatgtaatagttaat
gaaggtgattttgtgcgtaaaggtgatttattgatggatggcgatcctgatcttcatgat
attctacgtgtgcttgggttagaagcgttagcacactatatgatttctgaaatacagcaa
gtttatagattgcaaggtgtgcgcatagataacaagcatttagaagtgatcttaaagcaa
atgctacaaaaagtagaaattaccgatcctggtgatactatgtacttaattggagaaaat
attgacaggctggaaattgatagagaaaatgatgctatgaataactctggaaaacgacct
gctcattatcttcctattctgcagggaattactagagcaagccttgaaactaattccttt
atttctgctgcctctttccaagaaacaacaaaagtacttacggaagcagcattttgcgga
aagagtgatcctttgagtgggttaaaagaaaatgttatagtaggaaggttaattcctgct
ggtacgggtctgattatgaataaggtgaaagcactttcgctttgtgaaaatatagataaa
tatgaaaaatattttgatattgagacttatgacgaaaaattgctgagtgataatagttat
caattacattctgatgaagaagagagtgtggtggcatcgcactatgatcagtcaaattga

DBGET integrated database retrieval system