Wolbachia endosymbiont of Spodoptera picta: JKF54_02200
Help
Entry
JKF54_02200 CDS
T07615
Name
(GenBank) DNA-directed RNA polymerase subunit beta/beta'
KO
K13797
DNA-directed RNA polymerase subunit beta-beta' [EC:
2.7.7.6
]
Organism
wes
Wolbachia endosymbiont of Spodoptera picta
Pathway
wes03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
wes00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
JKF54_02200
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
wes03021
]
JKF54_02200
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
wes03400
]
JKF54_02200
Enzymes [BR:
wes01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
JKF54_02200
Transcription machinery [BR:
wes03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
RNA polymerase
Core subunits
JKF54_02200
DNA repair and recombination proteins [BR:
wes03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
NER (nucleotide excision repair)
TCR (transcription coupled repair) factors
DNA-directed RNA polymerase complex (RNAP)
JKF54_02200
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb2_6
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb2_3
RNA_pol_Rpb2_7
RNA_pol_Rpb2_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb2_45
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb2_1
RPOC_hybrid
Biotin_lipoyl_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QUI60749
LinkDB
All DBs
Position
complement(519572..528091)
Genome browser
AA seq
2839 aa
AA seq
DB search
MVDSSYMCASSAFVPRVSYSRSIDLKDSLLDLVKVQKGSYNSFTPNDESNERLEAIFHTI
FPISDPLHRATIEFLNCRVDDLKYSESECIKRGITFSAQVIASIRLVIMQDGVSLEKYQE
IKEDDDHSKLATVIKSAEEQEVRFCELPMMTDKGTFIINGVEKVIVSQMHRSPGVFFDSD
KGKTYNSGKLIYSARVIPYRGSWLDIEFDVKDHLYFRIDRKRKLPISVLLKALGLSNNDI
LNKFYEKIEYIKHKSGWRVPFSPDKFKGVRLPFDLKNVEGNVLLKANVRITSKLAKNLYD
NGLKEYLIPYDSICGLFLAEDLIDSASSTKVLSAGESIKLEDIKKLELLSIDKISVLNID
NVSVGPYILNTLFLDENMSYENALYEIYKVLRPGEVPVLKIVEEFFRNLFFSSEYYDLSN
IGRLKLNSCLGLNYEENLTTLTHEDIIEIIRKIVLLRDGQGSVDDIDHLANRRVRSVGEF
IENQFRTGLLKLGRAVVDSMSTSSLDKVSPSDFINPKVLTNVLRDFFNSSQLSQFMDQTN
PLSEITHKRRLSALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRICPIETPEGQNIGLINSLAIYA
RINKYGFIESPYRKVVNKVVIDQIEYLSAIDEGLYYIADTSAKLDENNCFVDDMLYCRYA
GTFVMVNSSQVSYIDLSPKQVISVAASLIPFLENDDANRALMGSNMQRQAVPLLKPTAPL
VATGMESFVASGSGAVVLAKRGGIVDSSDSNSIVIRAFDKGGINYLDVDIYHLRKFQRSN
HNTCINQKPLVHVGDCVKEGDVIADGPAINNGELALGQNLLVAFMSWQGYNFEDSIIISS
EVVKKDLFTSIHIEEFECVVHDTPLGSEKITRAIPGVNEENLYHLDDSGIVKVGTRVGPG
YILVGKVTPKHSLSLPPETKLLMTIFGEKSFDCVDSSLYTSPDIEGIVIDVQVFTRRGEE
ENERAFLIKQKEANDFEKERDHIINVINQYFYDELRKILINSGSQDRESINFIEREGWWD
IGLKNQSISKQVESLKKDFDEKVSHAIANFKRKVEKLHEGYDLPQGVSMSVKVFIAVKHS
LQPGDKMAGRHGNKGVISRVVPVEDMPYLEDGTPIDIILNPLGVPSRMNVGQILETHVGW
ACKKLGEKVGNILDEINKIKRAFCEAIRSLSDDDFEKFAALYLDNKKFEDINDDEITASI
LDTPNKDKLNNELTTLVENYFNSCKDAHSSLRHFLIEVYSCGSNLSICNNIRDINDNHLI
EFAYKLRDGIPVTAPVFEGPKDEQIVKLFELAGLDNSGQVVLYDGCSGEKFDRKVTVGYM
YMLKLHHLVDGKIHARSVGPYSLVTQQPLGGKSHFGGQRFGEMECWALQAYGAAYTLQEM
LTVKSDDINGRVKIYESVIKGDSNFECGIPESFNVMIKELRSLCFNVDLKQNYIVIEDIS
HTNIAQSFNEVSISIASPESIKRMSYGEITDVSTANYRTFKVEKGGLFCPKIFGPVNDDE
CLCGKYKKRRHRGRICEKCGVEVTSSKVRRERMGHIELASPVAHIWFLKSLPSRIGALLD
MSLRDIESILYSDNYVVIDPLVSSFEKGEIISEKAYNEAKDSYGVDSFIAMQGVEAIREL
LIRLDLHEIRKNLRQELESVASEMRRKKIIKRLRIVENFIKSGNRPEWMILTAIPILPPD
LRPLVSLESGRPAVSDLNHHYRTIINRNNRLRKLLSLNPPEIMIRNEKRMLQEAVDSLFD
NSRRNALVNKAGATGYKKSISDMLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPTLKLNQCG
LPKRMALELFKPFVYSRLKIYGMAPTIKFASKLIRAEKPEVWDMLEEVIKEHPVLLNRAP
TLHRLGIQAFEPVLIEGKAIQLHPLVCTAFNADFDGDQMAVHVPISLEAQLEARVLMMSI
NNVLSPSNGRPIIVPSKDIVLGIYYLTLQQLKEDDLPLFCAFCEVEHSLNNGTLHIHSHI
KYKMEYINSDGNIQYKTIFTTPGRLILWQIFPKHKNLSFDLINQVLTVKEITSIVDLVYR
SCGQSATVVFSDKLMTLGFEYATFSGTSFSRCDMVIPETKATHVDYTRGEIKKFSAQYQD
GLITKSERYNKVIDEWSKCTDIIANDMLKAISLYDENSKYNSIYMMVSSGARGSTSQMKQ
LAGMRGLMTKPSGEIIETPIISNFREGLNVFEYFNSTHGARKGLADTALKTANSGYLTRR
LVDVSQNCIVTKHDCKTKNGLIVRAIVEGSTIVASLESVVLGRTAANDIYNPVTKELLLK
AGELIDEDKVKQINIAGLDAIKIRSPLTCEISPGVCSLCYGRDLATGKIVSIGEAVGVIA
AQSVGEPGTQLTMRTFHIGGVMTRGVESSNIIASINARIKLNNSNIIIDKNGNKIVISRS
CEVVLIDSLGSEKLKHSVPYGAKLYVNEGELVKIGDKVAEWDPYTLPIITEKSGTISYQD
LKDGISITEVMDESTGISNRVVKDWKLHSGVANLRPRIALLDDNEKVITLSSGVEACYFI
PVGAVLNVQDGQKVHAGDVITRTPRESVRTRDITGGLPKVIELFEARRPKEHAIVSEIDG
YVTFSEKDRRGKRSIVIKPLDEQASPVEYLVSRSKHVIVNEGDFVRKGDLLMDGDPDLHD
ILRVLGLEALAHYMISEIQQVYRLQGVRIDNKHLEVILKQMLQKVEITDPGDTMYLIGEN
IDRLEIDRENDAMNNSGKRPAHYLPILQGITRASLETNSFISAASFQETTKVLTEAAFCG
KSDPLSGLKENVIVGRLIPAGTGLVMNKVKALSLCENIDKYEKYFDIETYDEKLLSDNSY
QLHSDEEESVVVSHYDQSS
NT seq
8520 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttgattcttcttatatgtgtgcttctagtgcttttgttcctagagtttcttattcc
aggtcgattgatttaaaagattctttgttggatttggttaaagtccaaaaggggtcatat
aattcctttactcctaatgatgagagtaatgaaagacttgaagctatctttcatacaatt
tttccaatatctgatcctttgcatagggctactatcgaatttttgaattgtagggtagat
gatcttaagtatagtgaatctgaatgtataaaacgtggtataactttttctgctcaggtt
attgcttctatacgtcttgttattatgcaggatggtgtttctcttgaaaaatatcaagag
attaaagaagatgatgatcattctaagcttgcaactgttataaaatctgctgaagagcag
gaggttcgcttttgtgaactgcctatgatgactgataaaggtactttcatcatcaatggc
gtagagaaagttatcgtttcacaaatgcatagatctcctggagtgttttttgatagtgat
aagggaaaaacttacaattctggcaaattaatctattctgctagagttattccttataga
ggttcttggcttgatattgagtttgatgttaaagatcatttgtattttcgtattgataga
aagagaaagttgccaatatcagttttattaaaggctttgggcttatcaaacaatgacata
cttaataaattttatgaaaaaatagagtatataaaacataaaagtggctggagagtacct
ttttcccctgataaattcaagggagtgaggcttccttttgatttaaagaatgttgaaggc
aatgtgttacttaaagctaatgttcgtattacttcaaaattagctaaaaatctatatgat
aacggattgaaagagtatctaattccttatgattctatatgtggtttatttcttgcagaa
gatttaatagatagtgctagttctacaaaagtcttatctgctggtgaatctataaaatta
gaggatataaaaaagcttgaattattatctatagataaaatatcagtgttgaacatagat
aatgtttctgttggaccttacatattaaacacacttttcttagatgaaaacatgtcttat
gagaacgctctatatgaaatatataaggttttgcgtcctggtgaagttcctgttttaaag
atagtagaggagttttttcgtaatcttttcttcagttcggaatattatgatttgtctaac
attggtagattaaaacttaactcttgccttgggttaaattatgaggaaaatttaactact
ttaacacatgaagacattattgaaattataagaaaaatagtattgttacgtgatggtcaa
ggatctgtagatgatattgatcatttagcaaatagaagagtccgttcagttggagagttt
atagaaaatcaatttagaactggattattaaaattgggacgggcagtagttgattctatg
tctacttctagtttagataaagtctctccatctgattttataaatccaaaagtgttaacc
aatgtcttaagagattttttcaactcttcccaattatctcaatttatggatcagactaat
ccattatctgaaataacacataaaagaaggttgtcagcgttaggtcctggtggtttaaca
agagagagggcgggatttgaagtgcgtgatgttcatccaactcattacggaagaatttgc
cctattgaaactcctgaggggcagaatataggcttaattaacagcttagctatatacgct
cgtattaataaatatgggttcattgaaagtccttataggaaagtagttaataaggttgtt
attgatcaaattgagtatctgtctgctatagatgaaggtttatattatatagccgatacc
agcgcaaagcttgatgagaacaactgctttgttgatgatatgttatactgtaggtatgct
ggtacctttgtaatggtaaatagtagtcaagtaagttacattgatttatctcctaagcag
gtaatatcggttgctgcttctttaattccatttttagagaatgatgatgctaatagagcg
ttaatgggttcaaatatgcagcgtcaagctgtacctttattgaagcctactgctcctttg
gttgctactggcatggaatctttcgtagcttctggctctggtgctgtagttttagcaaaa
cgtggtggcatagttgacagctcagatagtaactctatagttatacgtgcttttgacaaa
ggaggaattaactacttggatgtagatatttatcatctaagaaaatttcagcgttctaac
cataatacttgtattaaccagaaaccactggtgcatgtaggtgattgtgttaaggaaggt
gatgtgatagctgatggtcctgctattaataacggtgaattggcacttggccaaaacttg
ctagtcgcttttatgtcttggcaaggttataattttgaagactcaatcattatttctagt
gaagttgttaaaaaagatctatttacttctattcatatagaagaatttgaatgtgttgta
catgacactcctttagggtcggaaaaaataactcgtgccatacccggtgttaatgaagaa
aatctttatcacttggatgatagtggtatagtaaaggttggtacaagagttggtccaggt
tatattttggtggggaaagttacacctaagcattctctttcattgcctcctgagacaaaa
ttgttaatgacaatttttggtgaaaagtcatttgattgtgtggattcctctttatataca
tctccagatattgaagggatagtaattgatgtgcaggtctttacacgcagaggggaagaa
gaaaacgaaagggcatttcttattaaacaaaaagaggcaaacgactttgagaaagaacga
gaccatataatcaatgttattaatcaatatttctatgatgaattaagaaaaattcttatt
aattctggctctcaagatcgagaaagtattaattttattgaacgtgagggatggtgggat
ataggattgaaaaaccaatctatttctaagcaagttgagagcttaaaaaaagattttgat
gaaaaagtatcacatgcgatagcaaactttaagcgaaaagtagaaaaattgcatgaaggc
tatgatctgcctcaaggtgtgtcgatgtcagtaaaagtttttattgctgtaaaacatagt
ttgcagccaggggataaaatggctggtagacatggaaataaaggtgtgatttctcgagtt
gttccagtagaagatatgccttatttagaagatggtactcctattgatattattcttaac
cctcttggcgttccttcgcgaatgaatgtaggtcaaatattggaaacgcatgtaggttgg
gcttgtaaaaaattaggagaaaaagtaggcaatattcttgatgagatcaataaaatcaaa
cgtgctttttgtgaggcaattagatctctcagtgatgatgattttgaaaaatttgcagca
ttatatcttgataataaaaaatttgaggatattaatgatgatgaaataacggcttctatt
ttagatacgcctaataaggataaattaaataatgaattgactacattagtagagaattat
ttcaactcttgtaaagatgcacacagtagtttacgtcacttcctgattgaggtttatagt
tgtggcagtaatttatctatttgtaataacattcgcgatattaatgataatcacctcatt
gaatttgcgtataagttgcgtgatggcattcctgttactgcacctgtatttgaaggtcca
aaagatgaacaaatagtaaagctatttgaacttgctggattggataactctgggcaagtt
gtattatatgatggttgctcgggtgagaagtttgatcgcaaagttacagttggttacatg
tacatgcttaagttgcatcacttagtagatggtaaaattcatgcgcgttcagtaggacct
tatagtttggttactcaacaacctcttggaggaaagtctcattttggtggtcagcgtttt
ggtgaaatggaatgttgggcattgcaagcctatggtgctgcttacactttgcaggaaatg
ttaactgtgaagtctgatgatattaatggcagggttaagatttatgaatcggtaataaaa
ggtgacagtaactttgaatgtggaattcctgaatcctttaatgtcatgataaaagagttg
cgttctttgtgttttaatgtggatttgaagcaaaattacatagtaattgaagatatatct
cacactaatatcgcacaatcttttaatgaggttagcatttccattgctagccctgaaagt
attaaacgtatgtcttatggagagataacagatgtttcaactgcaaactaccgtacattc
aaagttgagaaaggtggattattttgtcctaaaatttttggtcctgtcaatgatgatgaa
tgtttatgtggaaagtacaaaaaaagaagacataggggccgtatatgcgaaaaatgtgga
gtagaagttacatcttctaaagtaagaagagaaagaatgggtcatatagagcttgcatct
cctgttgctcatatatggtttttgaagtcacttccttcaagaattggagcattattagat
atgtctcttagagatatcgaaagtattttgtatagtgataattatgttgtaatagatcct
cttgtttcctcttttgaaaaaggtgaaattattagtgagaaagcttataatgaagctaaa
gatagctatggggtcgatagctttatagctatgcaaggtgttgaagctataagagaattg
ctaatacgccttgatttacatgaaattaggaagaatttaagacaggagttagagtctgtt
gcttctgaaatgagaagaaagaaaattataaagagattacgtattgttgaaaattttatc
aagtctggaaacagacctgagtggatgatacttacagctatacctattttaccacctgac
ttgcgtcccttggtatcccttgaaagtggtcgacctgcagtttctgatttaaatcatcat
tatagaactattattaatagaaataatagattgagaaaattgttaagtttaaatcctcct
gagattatgattcgtaatgagaaaagaatgttacaagaggcagttgattctctttttgat
aatagtcgtcgtaatgctctggtaaataaagctggcgctactggatataaaaagtctatt
agcgatatgctgaaaggaaagcaaggtcgtttccgtcagaatcttttaggaaaaagggta
gattactctggacgttctgtaatagttgttggtccaactttgaaactaaatcagtgtgga
ttaccgaaaagaatggctcttgagttattcaaaccttttgtttactcaaggcttaaaata
tatggaatggctccaactattaaatttgctagtaagttaataagagcagaaaagccagaa
gtctgggatatgcttgaagaagtaataaaagagcatcctgttttgctaaatagagcgcct
acgctacataggcttggtattcaggcttttgagccagtccttattgaaggtaaagcaata
cagcttcatccacttgtttgtacagcatttaacgctgactttgatggtgatcaaatggcg
gtacatgtgccaatttcattggaagctcaacttgaagctagagtgttgatgatgtcaatt
aataacgttttaagtccttctaatggaagaccgattatagttcctagtaaagatatagtg
cttggtatatactacctaactttacagcaacttaaggaggatgatttaccacttttctgt
gccttttgtgaagttgagcattccttaaacaacggtactctacatattcattctcatata
aagtacaaaatggaatacatcaatagcgatggaaacattcagtataaaactatttttaca
actcctggacgtttaatattatggcagatttttcctaaacataagaatctaagcttcgat
ttaataaatcaggtattaacagttaaggaaataactagcattgttgatttagtatatcgt
agctgcggtcaaagtgctacagtggtattttctgataaattgatgacacttggctttgag
tatgctacattttccggtacttcttttagtcgttgcgatatggtcatacctgaaactaaa
gctacacacgttgattatacaaggggtgaaattaagaaattttctgcacagtatcaagac
ggactaatcactaaaagtgagaggtataataaagttatagatgagtggtctaagtgcaca
gatataatagcgaatgatatgttaaaagcgatatctctgtatgatgaaaatagtaagtac
aattcaatatatatgatggttagctccggtgcaagaggttctacttcccagatgaagcag
ttagcaggaatgcgagggttaatgaccaaaccttctggtgaaattatagaaacacctata
atttctaattttcgcgaaggattaaatgtatttgaatactttaattctactcacggtgcg
cgtaaaggtttagctgatactgcacttaaaactgcaaactctggatacttaactcgtcgc
ttggttgatgtatctcaaaattgcatagttacaaaacatgactgtaaaacgaaaaatggc
cttattgtaagagctatagttgaaggtagtactatagttgcatctctagagagtgttgta
ctgggtagaacagctgcaaatgatatatataacccagtaaccaaagagttattattaaaa
gcaggagaactaattgatgaagataaagtaaagcaaatcaacattgcaggtcttgatgct
ataaaaattagatcgcctttaacttgtgaaataagtcctggtgtgtgttctttgtgttat
ggaagagaccttgcaactggtaaaattgtttcaataggtgaagcagttggtgttatcgct
gctcaatctgttggagagccaggtactcagttaacgatgcgtactttccatataggtggg
gtaatgactagaggtgttgaatcctcaaatattatagcttctattaatgctagaataaaa
ctaaacaatagtaatataattatagataaaaacggaaataaaattgtgataagccgttcc
tgtgaagtcgttttaattgatagccttggtagtgaaaaattgaagcacagtgtgccttat
ggtgctaaactttatgtaaatgagggtgagttagtaaaaattggtgataaagttgcggaa
tgggatccgtatacactacctattattacggaaaagagtggtacaatatcttaccaggat
ttaaaagatggaatttcaatcactgaagtgatggatgaatctacaggaatatcaaataga
gtagtaaaagattggaaattgcactctggtgtagctaatttacgtcctcgtattgcactg
cttgatgataatgaaaaagtaataacactttcaagtggtgtggaagcatgttactttata
ccagttggtgcagtgcttaatgtacaggatggccaaaaggttcatgcaggtgatgttatc
acaagaacgccgagagagtcagttagaactcgtgatattactggtggcttgcctaaggtt
atagaattatttgaagcacgtcgtcctaaagagcatgctatcgttagtgaaatagatggc
tatgtaacgttctctgaaaaagaccgtagaggaaaacgcagtatagtaattaaaccttta
gatgagcaagcttctccagttgagtatttagtatcaagaagtaagcatgtaatagtcaat
gaaggtgattttgtgcgtaaaggtgatttattgatggatggcgatcctgatcttcatgat
attctacgtgtgcttgggttagaagcgttagcacactatatgatttctgaaatacagcaa
gtttatagattgcaaggtgtgcgcatagataacaagcatttagaagtgatcttaaagcaa
atgctacaaaaagtagaaattaccgatcctggtgatactatgtacttaattggagaaaat
atcgacaggctggaaattgatagagaaaatgatgctatgaataactctggaaaacgacct
gctcattatcttcctattctgcagggaattactagagcaagccttgaaactaattccttt
atttctgctgcctctttccaagaaacaacaaaagtacttacggaagcagcattttgtgga
aagagtgatcctttgagtgggttaaaagaaaatgttatagtaggaagattaattcctgct
ggtacgggtttggttatgaataaggtgaaagcactttcgctttgtgaaaatatagataaa
tatgaaaaatattttgatattgagacttatgacgaaaaattgctgagtgataatagttat
caattacattctgatgaagaagagagtgtggtggtatcgcactatgatcagtcaagttga
DBGET
integrated database retrieval system
