Xiphophorus maculatus (southern platyfish): 102233486
Help
Entry
102233486 CDS
T02923
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like isoform X1
KO
K02599
Notch 1
Organism
xma
Xiphophorus maculatus (southern platyfish)
Pathway
xma04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
xma00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
102233486
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
Ank
EGF_2
Notch
NOD
NODP
Ank_4
Ank_3
Ank_5
EGF_3
cEGF
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102233486
NCBI-ProteinID:
XP_005798719
Ensembl:
ENSXMAG00000005227
UniProt:
M3ZSY0
LinkDB
All DBs
Position
8:18864859..18890495
Genome browser
AA seq
2478 aa
AA seq
DB search
MYRFLVKLTFLIPAIVFSEGLKCSLPTETCLNGGRCEATSNGNGECKCSSDYVGDRCQYP
SPCSPSPCRNGGECRAVSHGNTFDFHCVCRLGFTDRLCLTPRNHACMSSPCRNGGTCDLI
SLSSFRCRCPPGWSGKTCQTPNPCASNPCANGGQCSALDSNFKCTCPANFQGQTCKQDIN
ECAINPSPCLNGGFCVNEVGSYHCRCPQEFTGQHCETLYSPCSPSPCQNGGTCVQKGETT
YDCSCLLGFTGQHCEHNIDDCPEHSCQNGGVCVDGVNTYNCQCPPHYTGQYCTENVDECE
LMPNACQNGGTCHDTHGSYHCVCVNGWTGDDCSENIDDCASAACYNGATCHDRVASFFCE
CPHGRTGLLCHLDDACISNPCQKGSNCDTNPVNGKAICTCPPGYSGSACNQDIDECSLGA
NPCEHGGRCLNTLGSFQCKCLQGYEGPRCEMDINECISNPCQNDATCLDQIGGFHCICMP
GYEGVFCHINTDECASQPCLNNGKCIDKINSFHCECPKGFSGNLCQVDIDECASTPCKNG
AKCTDGPNKYTCDCAEGYTGQHCEIDINECYSDPCHYGTCEDGLASFTCYCRPGYTGRLC
ETNINECLSQPCQNGGTCQDRENSYFCSCPKGTAGSNCEVNLDDCKSQPCDYGRCIDKIN
GYECACEPGYTGTMCNINIDDCVINPCHNGGTCIDGVNSFTCICPEGYHDVTCLSEVNEC
ASNPCIHGRCQDLINGYKCTCDSGWSGHNCNINNNECESNPCMNGGICKDMTSGYHCTCR
VGFTGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGENCETLQAPCSPRPCKN
GGICKEAEDYQSFSCICPEGWQGQTCEIDINECVKSPCRNGAVCLNTMGGFQCKCQPGYT
GQWCETDIDDCKPNPCSNGGLCRDSVNRFTCTCLPGFRGSRCEHDINECESNPCKNGANC
TDCVNSYTCTCPLGFSGINCEINTNDCTDSSCFNGGTCVDGINTFTCLCLTGFTGSYCQY
DINECDSKPCLNGGTCLDGYGTYKCTCPHGYTGVNCQSLVRWCDSSPCKNGGSCWQQGAS
YTCQCQTEFTGLYCDIPSVSCEVAAKRQGVEVSQLCRNSGQCLDAGNTHYCRCQAGYTGS
YCQEQVDECSPNPCQNGATCNDYLGGYSCECVPGYHGVNCSKEINECQSQPCQNGGTCID
LINTYKCSCPRGTQGVHCEINLDDCNPPSDPLTNEPKCFNNGKCVDRIGGYQCLCPPGYV
GERCEGDVNECLSNPCDPRGSYNCIQLPNSYRCECRTGYTGQRCDKVFDGCKGRPCRNGG
TCAVASNTPHGFICKCPPGFTGSSCEYDSRSCGSLSCRNGGTCVSGHLGPRCLCPSTFTG
PECLTPTDSLCISNPCYNGGTCQITPDAPFFQCSCPSNFNGLLCHILDYSFVGGFGRDIT
PPPEVEVSCEIPQCDEWAGNHICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWQNCSAALQCWRYF
NNGKCDGQCNSPGCLYDGFDCQGQEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGLD
CANNLPEKLADGHLVLVVQIPPELLKNRSSSFLRELSNVLHTNVVFRRDAKGEPMVFPYY
GNEQDLVKHNVLKRSAEGWPEWTSVPSNVLGEVKESVSSMVNQRKRRELDPVQVKGSIVY
LEIDNRQCYQQSTECFQSATDVAAFLGALATSGNLNVPYIEAVTSVKPTPSSTELFPMHL
VFLVLAILGFICLGVIMVQKRRREHGQLWMPEGFKVSEPSKKKRREPLGEDSVGLKPMKN
SDSNLIDDNQTEWGDDDPDCRHFRYEEQAMLDLSDHTDQRKWTQQHLDAADLRITSIAPT
PPQGEIENDCMDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLDTGNSEEEEDPSAEIITDFIYHGANL
HNQTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQIL
IRNRATDLDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADANATDDSGKSALHWAAAVNN
VEAAVVLLKNGANKDMQDNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLEHFANREITDHLDQLPRDI
AQERMHHDIVRLLDEYNVVRSPGLHSATLSTSTLSPPLCSPNDYLSNLKPTPSGKKVRKP
SSGGKGGKDGGKDIRLKKKKPMDGKSNLLDTTAVLSPVESLESPHGYLSDVASPPMPSPF
QQSPPMSLNQLQGNGDSHTGQISIGKDMSCMSFDPPRLTHLPVSSPSSQGTTSAGGSRGG
QCDWLTRMHPGVSQQGSFTQGPPITHNMMGALHGVSTATLSQIMGYQNLPTSHLGSAVHM
MQQPRSRQLQHQSSNSTTVSQSLSQSFPNIELNGADMQPNGGSGRSVPIHTVLPQETQML
GTQFPTPPSQHSYTGPMDNTPNHQLQVPEHPFLTPSPGSPDQWSSSSPHSNLSDWSEGIS
SPPTSIHSQMNLIPDQFK
NT seq
7437 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatcgtttcttagtgaaactgacatttctaattccagcaatcgtcttctcagaaggt
ttaaaatgctccctgcctactgagacgtgcctaaatggaggaagatgtgaagccacctca
aatggaaatggagagtgcaagtgttccagtgactacgtaggggatcggtgccaataccca
agcccctgcagcccgtccccctgccgcaacggcggcgaatgccgtgctgtctcccatggc
aacacatttgatttccactgcgtatgccgcctgggtttcaccgatagactgtgtctaact
cccaggaaccatgcttgcatgagctccccctgtcgcaatggaggaacgtgtgaccttatc
agcctcagcagcttccgctgccgctgcccaccaggatggtcaggtaaaacctgccagact
ccaaacccgtgtgcttccaatccatgtgcaaatggcggccagtgctctgctttagattcc
aacttcaagtgcacctgccctgccaacttccaaggtcaaacctgcaagcaggacattaac
gaatgtgccatcaacccatctccatgtctcaatggcggcttctgtgtcaatgaagttggc
tcttaccactgccgctgtcctcaggagtttactggtcaacactgtgagaccctttactcc
ccttgcagcccctcaccatgccagaatggaggcacgtgtgtccagaagggagaaaccacc
tatgactgtagctgtctcctaggctttacaggccagcactgtgagcataacatcgatgac
tgcccggaacacagctgtcagaatggtggtgtgtgtgtggatggagtcaacacctacaac
tgccagtgcccacctcattacacaggtcagtattgtactgaaaacgtggatgagtgcgaa
ctgatgcccaatgcatgccaaaatggaggaacatgccacgacacgcacggcagctaccac
tgtgtgtgcgtcaacggctggacgggcgacgactgcagcgagaacattgatgactgtgcc
agcgcagcctgctacaacggcgccacctgccacgaccgcgtggcctccttcttctgcgag
tgtccacatgggcgcacaggtttgctgtgccaccttgatgatgcctgcatcagcaatcct
tgtcaaaagggctctaattgtgacaccaatccggtaaatggcaaggcaatatgcacctgt
cccccaggttactcaggatcagcctgcaaccaggacatcgatgaatgctccctcggtgcc
aacccttgtgagcatggtggtcgctgcctcaacacgttaggctctttccagtgcaagtgt
cttcaaggatatgagggacctcgatgtgagatggatattaacgagtgcatatctaatccc
tgccaaaatgatgccacctgtctagaccagattggaggtttccactgcatctgtatgcca
ggatatgagggtgtgttttgccacattaacacggatgaatgtgccagccagccttgtctt
aacaatggaaaatgcatagacaagatcaactcattccactgcgagtgtcccaaaggattt
tcaggaaatctgtgtcaggtggatattgacgagtgtgccagcacaccctgcaagaatgga
gccaaatgtactgatggacccaataagtacacatgtgattgtgccgaaggttacacaggg
cagcactgtgagattgacatcaacgagtgctactctgatccttgccactatggcacatgt
gaagatggcctggcctccttcacctgctattgccgccccggctacactggccggctgtgc
gaaaccaacatcaacgagtgtctcagccagccgtgtcagaatggaggcacttgccaggac
agggaaaactcgtacttctgttcctgccccaaaggcactgctgggtccaactgcgaggtg
aacctggacgactgcaagagtcagccctgcgactatgggaggtgcattgacaagatcaat
ggctatgagtgtgcgtgtgagccgggttatacaggcacaatgtgcaacatcaacatagac
gactgtgtcatcaacccctgccacaatggtggcacgtgcatcgatggcgtcaacagcttc
acatgcatctgccctgaaggctaccatgatgtcacctgtttgtcagaggtgaatgagtgc
gccagtaacccttgcatccacggccgatgtcaggacctcattaatggctataaatgtacc
tgcgactcgggctggagtggccacaactgcaatattaataacaacgagtgcgagtccaac
ccctgcatgaatggaggaatatgcaaggacatgaccagcgggtaccattgcacatgcaga
gttggcttcaccggacctaactgccaaactaacatcaatgagtgtgcttccaatccctgc
ctcaaccagggaacctgcattgatgatgtggctggatacaagtgcaactgtttactgcct
tatactggtgaaaactgtgagactctgcaggccccttgcagccccaggccatgtaaaaac
ggaggaatatgtaaggaggctgaagactatcagagcttttcttgcatctgccctgaagga
tggcaaggtcagacttgtgaaattgacatcaatgaatgcgtgaagagcccttgccgcaac
ggtgctgtgtgtctcaacaccatgggtggctttcagtgcaagtgccagccaggttacacc
ggtcaatggtgtgagacggatattgacgactgcaaaccaaatccatgcagtaatgggggg
ctttgccgcgatagcgtcaacaggtttacttgtacctgcctgcccgggtttcgtggcagc
cggtgtgagcatgacataaacgagtgtgagagcaacccttgtaaaaacggggctaattgc
actgactgtgttaacagctacacctgcacctgcccactgggcttcagtggcatcaattgt
gagatcaacaccaatgactgcaccgacagctcttgcttcaatggtggaacttgtgtggat
gggattaacaccttcacctgtctgtgtctaactggattcactggaagctactgccaatac
gacatcaatgagtgtgactctaaaccatgcctcaatggaggcacctgtcttgatggttat
gggacttacaagtgcacctgtcctcatggctacacaggagtcaactgtcagagtcttgtg
cgctggtgcgactcctccccttgtaaaaatggaggttcttgctggcagcagggcgcctcg
tatacctgccagtgtcagactgaatttactggcctctactgtgatatcccaagtgtgtca
tgtgaagtcgctgccaaacgacaaggtgtggaggtgtctcaactgtgtaggaactcgggc
cagtgtctggatgctggaaacacacattactgccgctgccaggctggctacactgggagt
tactgccaggaacaggtggacgaatgttcacctaacccttgccagaatggagcaacctgc
aatgattatcttggaggttacagttgtgagtgtgtccctggttaccatggtgtgaactgt
tcaaaagaaatcaatgaatgtcagtctcaaccctgtcagaatggagggacctgcatcgat
ctcattaacacctacaaatgctcctgtcctagagggacacaaggtgtccactgtgagatt
aatttggatgactgcaaccctcccagcgacccactgacgaatgagcccaaatgcttcaac
aacggaaagtgtgtagatcgcattggaggctaccagtgcttgtgtccgccaggttacgta
ggggaacgctgtgagggggacgtcaatgaatgcctgtctaacccttgtgacccccgaggg
tcgtacaactgcatccagcttcccaacagctaccgctgtgaatgtagaaccggatataca
ggacaacgttgtgacaaggtgtttgatggctgcaagggaagaccctgcaggaatggagga
acatgtgctgttgccagcaacacgcctcatggatttatctgtaaatgtccacctggcttc
actgggtcttcttgcgagtatgattctcgctcctgtggcagtctgagttgcaggaatggt
ggtacatgtgtgtctggccacctgggtccacgttgcttgtgtccctcaaccttcaccggg
cctgagtgtctgactcccactgacagcctctgcatctcaaatccctgctacaatggaggc
acctgccagatcacccctgatgctccctttttccagtgcagttgtcccagtaactttaat
ggcttactttgccacatattggactactccttcgtcggagggtttggccgggacatcaca
ccgcctccagaagtggaggtgagctgtgagattcctcagtgtgatgagtgggctggtaac
catatctgcgactcgctgtgtaacaaccatgcctgtggctgggacggaggtgactgctca
ctcaactttgatgatccctggcaaaactgctcggctgctctgcagtgttggcgatacttc
aacaatggcaagtgtgatggccaatgtaacagcccagggtgtctctatgatggctttgat
tgtcaaggacaggaagggcagtgcaaccctctttatgatcagtattgtaaggatcactat
gctgatggtcattgcgaccaaggctgcaacaatgcagaatgcgagtgggatggtctggac
tgtgctaacaacttgccagagaagctagcagatggacatttggttctggtcgtccaaatt
cccccagagctgcttaagaaccgttcttcatccttcctcagagagctgagcaacgttctc
cacactaatgtagtgttccgccgtgatgcaaaaggagaaccaatggtctttccttactat
ggcaatgaacaagacctggtgaaacacaatgtgctaaaacgctctgcagaaggctggcct
gagtggacttcagtgccatccaatgttttgggtgaggtgaaggaaagtgtgtcctccatg
gtcaatcagcggaaacggagagagttggatccagtgcaagtcaaaggatcgattgtatat
ctggagatagacaatcggcagtgctaccagcagtctactgaatgcttccagagcgcaaca
gatgtggctgcctttctcggagcactggccaccagtgggaacctcaatgttccctatatt
gaagctgtaacaagtgtgaaacctactcctagctctacagagttgttccccatgcatttg
gtattcctggtgttggctattttgggtttcatatgccttggtgtgataatggttcagaag
cggcgtcgagagcatggccagctctggatgccggagggatttaaagtatcggagcccagc
aaaaagaaacgcagggagccattgggagaggattctgttggactgaaacctatgaagaat
tcagacagcaaccttatagatgacaatcaaactgaatggggagatgatgatccagactgc
aggcacttcaggtatgaggagcaggcaatgttggatttaagtgatcatacagaccagagg
aaatggacccagcaacacctggatgcagctgacctccgcataacatccattgcacccaca
cctcctcagggagaaattgagaatgactgcatggatgtcaatgttagagggccagatggt
ttcacgcctctgatgatcgcctcctgcagcggtggaggactggacaccggcaacagtgaa
gaggaagaggatccatcagccgaaataatcacagacttcatttaccatggagccaacctc
cataaccagactgatcgcacgggtgagactgccctccacctggctgcccgttatgcccgc
tcagatgccgccaagcgcctcctggagtccagcgcagacgccaatgtacaagacaacatg
ggccgcaccccgctgcacgctgcagtggcagcagatgcacagggagtttttcagatttta
atccgaaatcgagccaccgatcttgatgcccgcatgcatgacggaacaacacctctgatt
ctggccgcgcgattggctgttgagggcatggtcgaagaacttatcaactgtcatgctgat
gctaacgccactgatgattctggaaaatctgctttgcactgggctgccgctgtaaacaac
gtggaggctgctgtggtgctgctgaaaaatggtgccaacaaagacatgcaggacaacaag
gaggagacaccgctgtttctcgcagcccgtgaaggcagttatgagacagctaaagttctt
ctggagcactttgccaaccgcgaaatcactgaccatcttgaccaactgcctcgagatatc
gcccaagagcgcatgcatcacgacatagtccgcctgctagatgagtacaatgtggttcgg
agtcctgggctgcacagcgccaccttgagcacctctaccctctcccctcctctctgctcc
cccaatgactatctcagcaacctcaagccaaccccctctgggaaaaaagttcgaaagccg
agctctggcgggaaaggagggaaggatggagggaaagatataaggctgaagaagaagaag
ccaatggatgggaagagtaacttattagacacaacagctgttctgtctcctgttgagtca
cttgagtcaccccatggttacctgtccgatgtggcctctcctcccatgccatcacctttc
cagcagtcgccgcctatgtccttaaatcagctacaaggcaatggggactcccacacaggc
cagattagcataggtaaggatatgagttgcatgtcatttgatcccccccgcctcacccac
ttgcctgtgtccagccccagtagccagggcacaacatctgcgggtggcagcagaggaggc
cagtgtgactggctgaccaggatgcaccctggtgtgagccagcagggaagcttcacccag
gggccgccgattacacacaacatgatgggtgccctgcatggcgtcagtactgccactttg
tcccagatcatgggttaccagaatttgccaaccagccacctgggctcagccgtgcacatg
atgcagcagcctcgctccaggcagctgcagcatcagagttccaactccaccaccgtcagt
caaagcctgagccagagcttcccgaacattgagctgaatggtgctgacatgcagccaaac
ggtggctcgggccgttcggttcccatccacactgtgttgccacaggaaacgcagatgctc
ggcacccagtttccaactcctccctcccaacatagctatacaggacctatggacaacaca
cctaaccaccagctacaggtacctgaacacccatttctaaccccttcccctggatcccct
gaccagtggtccagctcgtccccacattccaacttgtccgactggtcagagggcatttct
agcccgccaacaagtattcactcacaaatgaacctaattccagaccaatttaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
