Zygotorulaspora mrakii: HG535_0C04090
Help
Entry
HG535_0C04090 CDS
T06976
Name
(RefSeq) uncharacterized protein
KO
K03018
DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1 [EC:
2.7.7.6
]
Organism
zmk
Zygotorulaspora mrakii
Pathway
zmk03020
RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
zmk00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03020 RNA polymerase
HG535_0C04090
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
zmk03021
]
HG535_0C04090
Enzymes [BR:
zmk01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.6 DNA-directed RNA polymerase
HG535_0C04090
Transcription machinery [BR:
zmk03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase III system
RNA polymerase III
Core subunits
HG535_0C04090
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
59235753
NCBI-ProteinID:
XP_037143783
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(797085..801476)
Genome browser
AA seq
1463 aa
AA seq
DB search
MREVVVSTTPKKISGLEFSALSAADIVAQSEVEISTRDLFDLENGRAPKKGGALDPRMGV
SSSSLTCETCQGNLASCNGHFGHIKLALPVFHVGFFKSTIQILQGVCKSCSAILLSDEDR
RNFLSELRRPGADNLRRMGTLKRILDQCKKQRRCLKCGALNGVVKKAAAGSGSASLKIIH
DTFRWVGKKSVPEKDKWVGDWQEVLSHNPELERYVKRCMDDLNPLKVLNLFKQIAPEDCE
LLGIDSSIKSGRPETYIWRYLPAPPVCIRPSVMMQDSPASNEDDLTVKLTEIVWTSSLIK
TGLEKGISINNMMEHWDYLQLSVAMYINSDSVNPAMLPGASNGGSKVKPIRGFCQRLKGK
QGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLSIDEVAVPDRVAKVLTFPERVTRYNRSKLQQLI
INGPNEHPGANYLLKKDEDARRNLRYGDRVKLAKYLKIGDVVERHLEDGDVVLFNRQPSL
HRLSILSHYAKIRPWRTFRLNECVCTPYNADFDGDEMNLHVPQTEEARAEAINLMGVKNN
LLTPKSGEPIIAATQDFITGSYLISHKDSFFDRGTLTQLLSMMSDGNMQFDVPPPAIMKP
YYLWTGKQVFSLLIKPNKQSPVVINLDAKNKVFIPPKDKSLPSEMSQNDGFVLIRGSEIL
SGVMDKSVLGDGKKHSVFYTILRDYGPQEAANAMNRMAKLCARYLGNRGFSIGISDVTPA
DELKQKKEDMVETAYANCDELIDSYNKGKLETQPGCNEEQTLEAKIGGLLSKVREEVGDV
CINELDNLNAPLIMATCGSKGSTLNVSQMVAVVGQQIISGNRVPDGFQDRSLPHFPKNSK
TPQSKGFVRNSFFSGLSPPEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSCQY
DNTVRTSSNGIVQFTYGGDGLDPMEMEGNAQPVNFNKTWDHATNITFNNTDRGLLPYQII
ENTNRILAPLENKLVRYDNVGMLVSKKDEGLEEYIDQNDAERNFYHSLKTYITAKAHALA
AVRKVRGLKALLDEPGAEFDSVDLDEGAPIEVRYSVDQLCKITNAALKEFLRIALLKYLR
ARVEPGTAVGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVASMNVTLGVPRIKEIINASKVISTPI
INAVLVNDNDERAARVVKGRIEKTLLSDVAFYIQDVYNDNLSFLQVRIDLTTIEKLQLEL
TIEEIAVAITKAPKLKILSSDVSILGKDKIAINVFPEGYKAKSISTSAKEPTENDVFYRM
QQLRRSLPDIVVKGLPDISRAVINVRDDSKRELLVEGYGLREVMSTDGVIGTKTVTNHVL
EVFSVLGIEAARASITGEINYTMSNHGMSVDPRHIQLLGDVMTYKGEVLGITRFGLSKMR
DSVLQLASFEKTTDHLFDAAFYMKKDAVEGVSECIILGQTMSIGTGAFKIVKGTNLLEDD
LKPKPTLFDKLATESAGTALKIN
NT seq
4392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagaggtagtggtcagtactacgcccaaaaagatcagtggtctggagttcagtgcg
ttgagtgcagcagatatcgttgcccagtctgaagtagagatttcgacccgtgatctattt
gaccttgagaatggtcgtgcgcccaaaaaaggtggtgctttggaccccaggatgggtgtt
tcttcgtcaagtctcacttgtgagacctgtcaaggtaatttggcaagctgtaacggtcat
tttggtcacattaaattggcgttgccagttttccacgttggttttttcaagtcgacaatc
caaatattacagggtgtttgcaagagctgctctgcaattttgttgagcgatgaagataga
agaaatttcttgagtgaattacgtcgtccaggagctgataacctgagacgtatggggacc
ttaaaaagaatactcgaccagtgcaagaaacagagacgatgcctcaaatgtggggcttta
aatggtgttgtgaaaaaagcagcggcgggttctggctctgcttctttgaaaattattcat
gatacttttcgctgggtgggtaaaaaaagcgttccagagaaggataaatgggttggtgat
tggcaagaagtcttatctcataatccggagttagagcgctacgttaaacgatgtatggac
gatttgaaccctcttaaggttctgaatttattcaaacagattgctccggaagattgtgag
ttgctgggtatagattcttcaatcaagtctggtagaccggagacttacatttggagatat
ttaccagcgccaccagtttgtataagaccttctgttatgatgcaggattctcctgcttcg
aatgaagacgatttaactgttaaacttacagaaattgtgtggacatcatcattaatcaaa
acaggtttagagaagggtatatcaatcaataatatgatggagcattgggattacttgcaa
ctatccgtcgctatgtacattaattcagattccgtcaatccggcaatgttaccgggagca
tccaatggtggcagtaaagttaagccaataagaggattttgtcaaagattaaagggtaag
caaggtagatttaggggtaatctatctggtaaacgtgtagatttctcaggtagaaccgtt
atctcaccggatccaaatttatcgatagatgaagttgcagttccagatcgtgtagcaaaa
gtcttgaccttccctgaaagagtcactcgttataatagatcaaagctgcagcaactgatc
attaatggaccaaatgaacatccaggtgcgaattacctattgaaaaaagatgaagacgct
agaagaaaccttcgttacggtgaccgtgtcaaattggcaaaatacttaaaaattggtgac
gtagttgaaagacacttggaagatggtgatgttgtgttattcaatcgtcaaccgtccttg
catagattatcaattttatcacattatgctaagattcgtccttggagaacttttaggtta
aatgaatgtgtttgtacaccctataatgcagattttgatggtgatgaaatgaatctgcat
gtcccacaaaccgaagaagcaagggctgaagctatcaatctgatgggagtcaagaataat
ttgttgactccaaagtccggcgaaccaattattgctgcaactcaggatttcatcactggt
tcatatttaatttcacataaggattcattttttgacagaggcacattaactcaactactc
tccatgatgtcagatggtaatatgcagtttgatgttccaccacctgcaatcatgaagccg
tattatctctggactgggaaacaagtgttctctttgttaatcaaaccaaataagcagtcg
cctgtcgtcattaatctagatgcaaaaaacaaagtctttatccctccaaaggataaatca
ttgcctagtgaaatgtctcaaaatgatgggtttgtacttataagaggttcagaaatcttg
agtggtgttatggataagtctgttttaggtgatggaaaaaaacattccgtcttctataca
atattaagagactatggccctcaagaagctgcaaatgcaatgaatagaatggctaaactt
tgtgccaggtatctgggtaatagaggtttctctatcggtattagtgatgttacaccggca
gatgaattgaagcaaaaaaaggaagatatggttgagactgcatacgcaaactgtgacgaa
ttgattgactcctacaataaaggaaagttagaaactcaaccgggttgtaatgaggagcaa
actttggaggccaaaataggtggtcttctatcaaaggtcagagaagaagttggtgatgtt
tgcattaatgagttagacaatctgaatgctccgctgattatggctacgtgtggctctaaa
ggttccacgcttaatgtttcccaaatggttgctgttgtcgggcaacaaattatttcaggt
aatcgtgttcctgatggatttcaggatcgttcattgcctcatttcccaaaaaactccaaa
actcctcagtccaaaggttttgtgagaaactccttcttttccggtttgtccccaccagaa
tttttatttcatgccatctctggtcgtgagggtttagttgatactgcagtcaagaccgct
gaaacgggttatatgtcgcgtagattaatgaaatctttagaggatttatcatgtcagtac
gataatactgttcgtacttcttcaaatggtatcgttcaattcacgtacggtggtgacggc
ttagatcctatggaaatggaaggcaatgctcaaccggtaaactttaataagacttgggac
catgcaacaaatattacatttaacaatacagaccgagggttacttccttatcaaattata
gaaaatactaatagaatattagcaccgcttgaaaacaaattggtaagatacgataatgtt
ggaatgttggtttccaaaaaagatgaaggattggaagaatacattgatcaaaatgatgca
gagagaaatttttatcactccttgaaaacatacattactgcaaaagctcatgcgcttgca
gcagttagaaaagtgaggggactgaaagctttgcttgatgaacccggtgcagaatttgat
agtgtggatttagatgaaggtgcgcctattgaagttagatactcggtcgatcaactatgt
aagataacaaatgcagctcttaaggaattcttaagaattgcgttattaaagtacctcagg
gcaagagtagaaccaggtactgcggtaggagctattggtgcacaatccattggtgagccc
ggtacacagatgacgttaaaaactttccattttgctggtgtcgcgtctatgaatgttacg
cttggtgttcctcgtatcaaggaaattatcaatgcatcgaaagtcatctcaacaccaatt
atcaacgcagttcttgttaatgataacgatgaaagagctgcaagagtggttaagggaaga
atcgagaagacgttattgtcagatgttgcattttacattcaggatgtctacaatgataat
ctctccttcttacaggtacgaattgatttaacaacaattgaaaaattacaattagaactt
acaatagaagaaattgcagtagcaatcacaaaggctccaaaactaaagatcctttcatcg
gatgtcagcattttgggcaaagataagattgctattaatgtctttccagagggatataag
gccaaatctatctcgacgtctgccaaggagccaacagagaacgatgttttttacagaatg
caacagctgcgtcggtctcttcccgatatcgttgtgaaaggtctaccagacatttcaaga
gctgtcatcaacgttcgtgatgattctaaaagagaacttttagtagaaggttatggcttg
agggaagtcatgtcgactgatggtgtcattggtaccaaaactgtcacaaatcatgtgctc
gaagtgttcagcgttttgggtattgaagctgcaagagccagtattactggtgagatcaat
tatacaatgagcaatcatggtatgagtgttgatccccgtcatatccaacttttgggtgac
gtcatgacatacaaaggtgaagttttgggtattactaggttcggattaagtaaaatgaga
gattccgttctgcaactagcctcttttgaaaagacaacggaccaccttttcgatgctgcc
ttctacatgaaaaaagatgcagtggagggtgtctccgaatgtatcattttgggtcaaact
atgtcaattggtacaggtgcttttaagattgttaaaggaacgaacctacttgaagatgac
ctcaaaccaaagccaacgttgttcgacaaattggcaactgaatctgcaggaactgcttta
aaaattaattag
DBGET
integrated database retrieval system